معلومة

لماذا تعتبر الميكانيكا الإحصائية ذات صلة بـ RNA وطي البروتين؟

لماذا تعتبر الميكانيكا الإحصائية ذات صلة بـ RNA وطي البروتين؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

هذا سؤال ساذج للغاية. بقدر ما أفهم أن طي الجزيء تحكمه القوى الكهرومغناطيسية بين ذراته وأيضًا بين ذراته وذرات البيئة المحيطة (وهي مشكلة جسدية كثيرة). لذلك لا أفهم كيف تلعب الآليات الإحصائية ، مثل قانون بولتزمان.

على حد علمي ، توجد الميكانيكا الإحصائية والديناميكا الحرارية عندما يكون لدينا مجموعة من الجسيمات كما هو الحال في سائل أو غاز. إذن ما هي هذه المجموعة الخاصة بـ RNA أو مشكلة طي البروتين؟


أنا لست فيزيائيًا ، لكن تصريحك "حسب علمي ، توجد الميكانيكا الإحصائية والديناميكا الحرارية عندما يكون لدينا مجموعة من الجسيمات كما هو الحال في سائل أو غاز" بالتأكيد غير صحيح. مشكلة طي البروتين هي مشكلة الديناميكا الحرارية - إيجاد بنية أقل طاقة حرة ، والمسار الذي يتم من خلاله الوصول إليها من ملف عشوائي.

تتمثل إحدى الصعوبات المتعلقة بالمسار في "التعثر" في وضع لا يستطيع البروتين الهروب منه. وهذا ما يسمى "الإحباط" ويبدو أن هناك معالجة كمية "الحد الأدنى من الإحباط" باستخدام الميكانيكا الإحصائية للغازات الدورانية. هذا مذكور في مراجعة قام بها Onuchic و Wolynes ، وهي متاحة على الإنترنت ، والتي من المحتمل أن تكون قادرًا على فهمها بشكل أفضل مما أستطيع.


إذا كنت ترغب في ربط الميكانيكا الإحصائية بـ RNA وطي البروتين ، فأنت على المسار الصحيح مع المجموعات. الجزيئات الكبيرة ديناميكية للغاية وتوجد في العديد من الحالات الفيزيائية. هذه الدول الكبرى هي التي وصفها ديفيد في مشهد الطاقة. يمكن تقسيم الدول الكبرى إلى مزيد من الدول الصغيرة التي ترتبط ارتباطًا وثيقًا بالحركات الكبيرة. يعتمد ذلك على مدى الدقة التي تريد الحصول عليها عند وصف نظامك. تلعب الإحصائيات دورًا عند وصف مجموعات الجزيء الكبير في مختلف وحداته الكبيرة. عادةً ما تكون الدولة الكبيرة ذات التكوين الطاقي الأكثر ملاءمة هي الأكثر اكتظاظًا بالسكان.


يبدو أنك قد خلطت بين طريقتين مختلفتين لمناقشة شيء ما مع شيئين مختلفين. تنطبق الميكانيكا الكهروميكانيكية دائمًا ، سواء كان الحديث عن السوائل أو الغازات أو ما لديك. تخضع جميع الجزيئات للقوى الكهرومغناطيسية. وكل مادة بها مجموعات من الجزيئات ، والتي يمكننا التحدث عنها بالميكانيكا الإحصائية. في الميكانيكا الإحصائية ، نقوم بتجريد بعض تفاصيل الميكانيكا الكهروميكانيكية ونعاملها إحصائيًا ، تمامًا كما في علم الاقتصاد نقوم بتجريد بعض تفاصيل علم النفس الفردي. لذلك كلاهما ينطبق ، في كل حالة. تكمن المشكلة في أن طي الحمض النووي الريبي هو نظام فيزيائي صعب بشكل خاص ، لذا فإن تجريده بعيدًا عن طريق الميكانيكا الإحصائية أصعب بكثير مما يمكن أن يكون على سبيل المثال ، غاز نبيل.


ارتباط إحصائيات البنية الثانوية للحمض النووي الريبي مع الاستقرار الديناميكي الحراري وتطبيقات الطي

ب مركز البيولوجيا الحاسوبية والمعلوماتية الحيوية ، قسم البيولوجيا التكاملية في كلية العلوم البيولوجية ، ومعهد البيولوجيا الخلوية والجزيئية ، جامعة تكساس في أوستن ، 2401 سبيدواي ، أوستن ، تكساس 78712 ، الولايات المتحدة الأمريكية

ستيوارت اوزر

ج Microsoft، 1 Microsoft Way، Redmond، WA 98052

روبن ر.جوتل

ب مركز البيولوجيا الحاسوبية والمعلوماتية الحيوية ، قسم البيولوجيا التكاملية في كلية العلوم البيولوجية ، ومعهد البيولوجيا الخلوية والجزيئية ، جامعة تكساس في أوستن ، 2401 سبيدواي ، أوستن ، تكساس 78712 ، الولايات المتحدة الأمريكية

بينجيو رن

أ قسم الهندسة الطبية الحيوية ، جامعة تكساس في أوستن ، أوستن ، تكساس 78712-1062


البيانات المرتبطة

يرتبط الحمض النووي الريبي بشكل مباشر بعدد متزايد من الوظائف داخل الخلية. سيوفر التنبؤ الدقيق لبنية الرنا المختلفة ذات الترتيب الأعلى من تسلسل الحمض النووي الخاص بها نظرة ثاقبة على وظائفها والميكانيكا الجزيئية. لقد تم تحديد الإمكانات الإحصائية لمجموعة من العناصر الهيكلية أكبر من عدد العناصر الهيكلية المحددة بقيم الطاقة المحددة تجريبياً. تتشابه الطاقات الحرة المشتقة تجريبياً والإمكانيات الإحصائية لمكدسات زوج القاعدة الكنسي ، مما يدل على أنه يمكن استخدام الإمكانات الإحصائية المشتقة من البيانات المقارنة كمعامل بديل للطاقة. تم تطوير بنية تحتية حسابية جديدة - قاعدة بيانات التحليل المقارن RNA (rCAD) - التي تستخدم قاعدة بيانات علائقية لمعالجة وتحليل محاذاة التسلسل الكبيرة جدًا ومجموعات بيانات البنية الثانوية. باستخدام rCAD ، تم تحديد مجموعة أغنى من المعلمات النشطة للعناصر الهيكلية الأساسية للحمض النووي الريبي بما في ذلك دبوس الشعر والحلقات الداخلية. تم تطوير نسخة جديدة من RNAfold للاستفادة من هذه الإمكانات الإحصائية. بشكل عام ، أظهرت هذه الإمكانات الإحصائية الجديدة لدبابيس الشعر والحلقات الداخلية المدمجة في الإصدار الجديد من RNAfold تحسينات كبيرة في دقة التنبؤ للبنية الثانوية للحمض النووي الريبي.


الفصل السادس - طي بروتين الكم ☆

لتأسيس إطار عمل أساسي لفهم الجزيئات الحيوية من المبدأ الأول لميكانيكا الكم ، تستعرض المخطوطة عمل مجموعة المؤلفين على طي البروتين والحمض النووي الريبي لإثبات وجود آلية كمية مشتركة في الانتقال المطابق للجزيئات الحيوية. بناءً على المعادلة العامة لمعدل التشكل الانتقالي يتم استنباط العديد من النتائج النظرية ومقارنتها مع البيانات التجريبية من خلال طرق المعلوماتية الحيوية. النتائج الرئيسية التي حصلنا عليها هي: تم استنتاج الاعتماد على درجة الحرارة والاعتماد على التركيز الممسخ لمعدل طي البروتين ومقارنتها مع البيانات التجريبية. يتم استنتاج العلاقة الكمية بين معدل طي البروتين ورقم الوضع الالتوائي (أو طول السلسلة) ويمكن تطبيق الصيغة التي تم الحصول عليها على طي الحمض النووي الريبي أيضًا. تم بنجاح تعميم نظرية التحول الكمي للبروتين ثنائي الحالة على طي البروتين متعدد الحالات. بعد ذلك ، تتم مناقشة كيفية إجراء اختبارات تجريبية مباشرة على الخاصية الكمية للانتقال التوافقي للجزيء الحيوي ، والذي يتضمن دراسة طي صور البروتين ومراقبة تقلب شدة التألق المنبعثة من حدث طي / تكشف البروتين. تظهر النتائج المذكورة أعلاه أن ميكانيكا الكم توفر نقطة انطلاق نظرية موحدة وبسيطة منطقيًا في دراسة التغيير التوافقي للجزيئات البيولوجية الكبيرة. من المتوقع النتائج بعيدة المدى في التطبيق العملي للنظرية.


الكلمات الدالة

المواد التكميلية التي تتكون من جدول واحد متاحة من DOI: 10.1006 / jmbi.1997.0889

حرره دي إي دريبر

العناوين الحالية: R. Gutell ، قسم الكيمياء والكيمياء الحيوية ، Campus Box 215 ، جامعة كولورادو بولدر ، CO 80309-0215 ​​، الولايات المتحدة الأمريكية: D. Konings ، قسم علم الأحياء الدقيقة ، جامعة جنوب إلينوي في كاربونديل ، كاربونديل ، إلينوي 62901 ، الولايات المتحدة الأمريكية: M. Huynen، Biocomputing، EMBL، Meyerhofstrasse 1، 6900 Heidelberg، Germany


لماذا تعتبر الميكانيكا الإحصائية ذات صلة بـ RNA وطي البروتين؟ - مادة الاحياء

A pplied M ath & amp S tatistics
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
كيمياء
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
الفيزياء
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
3 AMS 533 Num Methd Algs CompBio 3 AMS 533 Num Methd Algs Comp Bio (elec) 0-2 PHY 600 تعليم
3 XXX XXX اختياري 3 CHE 523 الكيميائية الحرارية (كهربائي) 0-3 PHY 540 ستات ميك
3 AMS 599 بحث 3 CHE 536 النمذجة الجزيئية Biomol
3 PHY 512 ميكانيكا الكم 2
3 AMS 537 دين الأحياء وشبكة أمبير * 3 CHE 559 دين الأحياء وشبكة أمبير 3 PHY 559 دين الأحياء وشبكة أمبير
0-3 AMS 531 تعفن المختبر * 0-3 AMS 531 تعفن المختبر 0-1 PHY 665 نادي J (يشمل الأخلاق)
0-1 AMS 532 نادي J (يشمل الأخلاق) * 0-1 AMS 532 نادي J (يشمل الأخلاق)
0-1 PHY 561 iBIO-Intro Biology
0-1 PHY 561 iBIO- مقدمة السيرة الذاتية 0-1 PHY 561 iBIO- مقدمة السيرة الذاتية
B iochemistry & amp S tructural B iology
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
M olecular & amp C ellular B iology
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
B io m edical E ngineer
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
2 BSB 512 Strc Bio & amp Spectroscopy 2 BSB 512 Strc Bio & amp Spectroscopy 3 BME 502 الطرق العددية المتقدمة
1 BSB 602 ندوة في الكيمياء الحيوية 1 MCB 602 الندوة مول الخلية الحيوية 3 BME 509 صناعة Fundam Biosci
1-6 BSB 510 تعفن المختبر 1-4 MCB 510 تعفن المختبر 3 BME 521 تعفن المختبر
1 BSB 532 نادي J X MCB 532 ندوة Mol Cell Bio- J Club 3 BME XXX اختياري تقني
0 السيرة الذاتية 600 تعليم 0 السيرة الذاتية 600 تعليم
1-4 MCB 656 بيولوجيا الخلية (أو كهربائي) 4 MCB 656 بيولوجيا الخلية
1-12 MCB 599 بحث
0 MCB 604 ندوة البحث العلمي للطلاب Grd

A pplied M ath & amp S tatistics
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
كيمياء
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
الفيزياء
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
3 AMS 507 احتمالا 3 XXX XXX اختياري 0-3 PHY 584 تعفن المختبر
3 PHY 558 فيز كيم و أمبير بيو (إلكت) 3 XXX XXX اختياري 3 PHY 558 فيز كيم وبيو
3 CHE 541 الكيمياء الحيوية 3 CHE 558 فيز كيم وبيو
3 CHE 541 الكيمياء الحيوية
0-1 AMS 532 نادي J * 0-1 AMS 532 نادي J
0-1 PHY 665 نادي J
B iochemistry & amp S tructural B iology
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
M olecular & amp C ellular B iology
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
B io m edical E ngineer
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
1 BSB 601 ندوة في الكيمياء الحيوية 3 MCB 657 مبادئ التنمية (1) * 3 BME 526 هندسة النظم البيولوجية
1-12 BSB 599 بحث 3 HPH 533 علم المناعة Grd 3 BME 599 بحث
0 السيرة الذاتية 600 تعليم 1 MCB 531 نادي Sem Mol Cell Bio-J (1،2) * 3 XXX XXX اختياري
3 MCB 503 علم الوراثة المولي (أو الكهرباء) 1 HPH 691 جيه كلوب (3) * 3 CHE 558 فيز كيم وبيو
1 JRN 503 iCOMl-Improv for Sci ** 1 MCB 601 الندوة مول الخلية الحيوية
3 CHE 558 فيز كيم و أمبير بيو (إلكت) 1-12 MCB 599 بحث

A pplied M ath & amp S tatistics
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
كيمياء
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
الفيزياء
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
3 AMS 699 بحث X CHE 694 ندوة 0-3 PHY 584 تعفن المختبر
X XXX XXX اختياري X XXX XXX اختياري X XXX XXX اختياري
X XXX XXX اختياري X XXX XXX اختياري X XXX XXX اختياري
3 JRN 565 توصيل العلم الخاص بك 3 JRN 565 توصيل العلم الخاص بك 3 JRN 565 توصيل العلم الخاص بك
B iochemistry & amp S tructural B iology
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
M olecular & amp C ellular B iology
(الاعتمادات / قسم / الدورة # / الموضوع)
B io m edical E ngineer
(الاعتمادات / القسم / الدورة # / الموضوع)
1 BSB 602 ندوة في الكيمياء الحيوية 3 HBP 531 أحياء عامة (3) * 3 BME 572 التحليل الجزيئي الحيوي
1-12 BSB 599 بحث 1 MCB 532 نادي Sem Mol Cell Bio-J (1،2) * 6 BME 599 بحث
1 BSB 532 نادي J 1-12 MCB 599 بحث
1-3 XXX XXX اختياري 1 MCB 602 الندوة مول الخلية الحيوية
0 GRD 500 RCR (أو أخلاقيات الندوة) 0-1 GRD 500 RCR (الأخلاق)
3 CHE 559 دين وشبكة أمبير الأحياء (الكهرباء)
3 CHE 559 Dyn & amp Network (4 ، كهرباء)
1 JRN 501 iCOM2- تقطير الرسائل الخاصة بك ** 1-3 XXX XXX اختياري (1،2) *
1 JRN 502 iCOM2- كتابة العلوم *** 3 JRN 565 توصيل العلم (4)
3 XXX XXX اختياري 3 XXX XXX اختياري
الاختيارية: انظر دليل BSB الاختيارية: انظر كتيب MCB الاختيارية: إجمالي 6 مواد اختيارية ، 3 منها يجب أن تكون BME

* AMS 531 مدرج في القائمة مع PHY 584

* AMS 532 مدرج في القائمة مع PHY 665

* AMS 535 مدرج في القائمة مع 535 هكم

* AMS 537 مدرج في القائمة مع 559 هكم وأمبير PHY 559

* تم تقديم أوراق AMS 539

لا يبدأ طلاب الفيزياء بالتناوب المخبري حتى السنة الثانية.

الوصف بالطبع

AMS 507: مقدمة في الاحتمالية

تشمل الموضوعات فضاءات العينة ، وبديهيات الاحتمال ، والاحتمال الشرطي والاستقلالية ، والمتغيرات العشوائية المنفصلة والمتواصلة ، والمتغيرات العشوائية الموزعة بشكل مشترك ، وخصائص المتغيرات العشوائية ، وقانون الأعداد الكبيرة ، ونظرية الحد المركزي ، وسلاسل ماركوف.

AMS 510: الطرق التحليلية للرياضيات التطبيقية والإحصاء

مراجعة تقنيات حساب التفاضل والتكامل متعدد المتغيرات ، والتقارب والحدود ، وتحليل المصفوفة ، وأساسيات فضاء المتجهات ، ومضاعفات لاجرانج.

متطلب سابق: مقرر في الجبر الخطي وحساب التفاضل والتكامل متعدد المتغيرات

الخريف ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

AMS 530: مبادئ الحوسبة المتوازية

تم تصميم هذه الدورة لكل من العلماء الأكاديميين والصناعيين المهتمين بالحوسبة المتوازية وتطبيقاتها في المشكلات العلمية والهندسية على نطاق واسع. يركز على القضايا الرئيسية الثلاث في الحوسبة المتوازية: تحليل الأجهزة وأنظمة البرمجيات المتوازية ، وتصميم وتنفيذ الخوارزميات المتوازية ، وتطبيقات الحوسبة المتوازية لمشاكل مختارة في العلوم الفيزيائية والهندسة. يركز المساق على الممارسة العملية وفهم المفاهيم الحسابية للحوسبة المتوازية.

متطلب سابق: دورة في علوم الكمبيوتر الأساسية مثل أنظمة التشغيل أو البنى أو بعض الخبرة في البرمجة.

الربيع ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

AMS 531: دورات المختبر ونادي المجلات في علم الأحياء الحسابي

هذه دورة من فصلين دراسيين يتم فيها الحصول على درجة الدكتوراه في السنة الأولى. يقضي الطلاب ما لا يقل عن 8 أسابيع في كل من ثلاثة مختبرات مختلفة يشاركون بنشاط في أبحاث كلية البيولوجيا الحاسوبية المشاركة. في نهاية كل دورة ، يقدم الطلاب عرضًا تقديميًا لنشاطاتهم وإنجازاتهم المعملية. الهدف الأساسي من التدوير هو مساعدة الطلاب على اختيار مستشار بحث ومساعدة أعضاء هيئة التدريس في اختيار الطلاب. يسجل الطلاب في AMS 531 في كل من فصلي الخريف والربيع من السنة الأولى.

0-3 وحدات ، تقدير S / U ، يمكن أن تتكرر للحصول على الائتمان.

AMS 532: دورات المختبر ونادي المجلات في علم الأحياء الحسابي

الهدف من هذه الدورة هو أن يقوم الطلاب بصقل مهارات القراءة والتحليل النقدية من خلال مناقشات الأدب في مجال علم الأحياء الحسابي. يأخذ المشاركون دورهم في كونهم "قائد مناقشة" يوجه المجموعة بشكل غير رسمي من خلال مخطوطة تمت مراجعتها من قبل الزملاء والتي سيتعين على جميع أعضاء Journal Club قراءتها قبل الاجتماع. ستشمل الاجتماعات في فصل الربيع تدريب الأفراد (IPT) في السلوك المسؤول للبحث والمنح الدراسية (RCRS) حول الموضوعات التي تشمل (1) النزاهة في المنح الدراسية ، (2) سوء السلوك العلمي ، (3) التوجيه ، (4) الملكية و التأليف ، (5) الانتحال ، (6) إدارة البيانات ، (7) الصحافة والعلوم ، (8) الموضوعات البشرية ، (9) حيوانات المختبر.

0-1 وحدات ، تصنيف S / U ، يمكن أن تتكرر للحصول على الائتمان.

AMS 533: الخوارزميات وصنع النماذج

مسح متعمق للعديد من التقنيات الرئيسية المستخدمة في جوانب متنوعة من علم الأحياء الحسابي. ينصب التركيز الرئيسي لهذا الفصل على كيفية صياغة بيان للمشكلة التي سيتم حلها بنجاح ، وكيف يمكن أن ترشد هذه الصياغة في اختيار النهج الحسابي الأنسب. سيتم استخلاص الأمثلة من مجموعة واسعة من المشاكل في علم الأحياء ، بما في ذلك النمذجة الجزيئية ، وشبكات التفاعل الكيميائي الحيوي ، والفحص المجهري وبيولوجيا الأنظمة. لا يلزم معرفة مسبقة بالبيولوجيا.

AMS 534: مقدمة في بيولوجيا الأنظمة

هذا المساق موجه نحو تدريس المفاهيم الأساسية والمهارات الحسابية في بيولوجيا الأنظمة. تتركز الدورة على لغتين أساسيتين من لغات البرمجة: Matlab لتطبيقات النمذجة ولغة R للتحليل الإحصائي ومعالجة التسلسل.

الربيع ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

AMS / CHE 535: علم الأحياء الإنشائي الحسابي

ستوفر هذه الدورة مقدمة في علم الأحياء الهيكلية الحسابي مع تطبيقه على تصميم الأدوية. سيتم التأكيد على الطرق والتطبيقات التي تستخدم الحساب لنمذجة النظم البيولوجية المشاركة في الأمراض البشرية. تهدف الدورة إلى تعزيز التعلم التعاوني وستتألف من عروض تقديمية من قبل المدرب والمحاضرين الضيوف والمشاركين في الدورة بهدف تلخيص الأساليب والموضوعات والأوراق الرئيسية ذات الصلة بالبيولوجيا الهيكلية الحاسوبية. يتم تقديم هذه الدورة التدريبية على أنها كلا من 535 هكم و AMS 535.

تقع ، 0-3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

AMS 536: النمذجة الجزيئية للجزيئات البيولوجية

تم تصميم هذه الدورة للطلاب الذين يرغبون في اكتساب خبرة في نمذجة الجزيئات البيولوجية على المستوى الذري. بالاقتران مع الاهتمامات الفردية ، يمكن استخدام الميكانيكا الجزيئية أو الديناميكيات الجزيئية أو مونت كارلو أو الإرساء (الفحص الافتراضي) أو حزم برامج ميكانيكا الكم لدراسة الأنظمة (الأنظمة) البيولوجية ذات الصلة. ستتضمن المشاريع الإعداد والتنفيذ والتحليل. سيقدم المشاركون في الدورة عروضًا تقديمية للأدبيات ذات الصلة بعمليات المحاكاة التي يتم إجراؤها وسيتطلب تقرير المشروع النهائي. الإلمام بـ Unix (Linux) مرغوب فيه.

الربيع ، 0-3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

AMS 537: النماذج الديناميكية لتنظيم الجينات وتشكيل الأنماط البيولوجية

هذه دورة دراسات عليا في النظرية الأساسية للوظيفة الجينية وتكوين الأنماط البيولوجية في نمو الحيوان. يغطي المقرر الدراسي النماذج الديناميكية (تسمى أحيانًا "الفسيولوجية") لهذه العمليات على مجموعة متنوعة من المستويات الرياضية. من الناحية البيولوجية ، سيكون التركيز على الإشريكية القولونية وذبابة الفاكهة ذبابة الفاكهة ، مع مناقشة متأنية للنتائج التجريبية الرئيسية لغير المتخصصين. سوف ندرس استخدام كل من المعادلات التفاضلية القطعية والعشوائية لحل المشكلات العلمية الأساسية مثل قرار تحلل / lysogeny ، وهندسة دوائر الجينات الاصطناعية ، وتحديد وتنظيم المجال المورفوجيني في تنمية الحيوان ، ولا سيما التجزئة الحقل في ذبابة الفاكهة.

الربيع ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة ، قائمة x مع PHY / CHE 559

AMS 539: iPQB-Intro في علم الأحياء الفيزيائي والكمي

هذه الدورة عبارة عن سلسلة ندوات ينظمها مركز لوفر للبيولوجيا الفيزيائية والكمية وتستهدف أي من طلاب الدراسات العليا القادمين الذين قد يكونون مهتمين بإجراء بحث في علم الأحياء الحسابي أو الرياضي أو الفيزيائي. سيتم تقديم كل ندوة من قبل عضو هيئة تدريس مختلف حول أبحاثهم وستغطي مجموعة من الموضوعات بما في ذلك البيولوجيا الهيكلية الحسابية وعلم الجينوم / المعلوماتية الحيوية والنمذجة الأيضية والتنظيمية وبيولوجيا الخلية الحسابية والنماذج التطورية.

خريف ، 0-1 اعتمادات ، درجات S / U

AMS XXX: البحث أو اللغة الإنجليزية كلغة ثانية

الخريف ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

BSB 515: الطرق الحسابية في الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الإنشائية

تحليل البيانات والإحصاءات باستخدام بيئة البرمجة R والتسلسل والتحليل الرسومي للبروتينات والأحماض النووية. المتطلبات المسبقة: يقتصر هذا الفصل على طلاب السنة الأولى BSB و HBM و MCB PHD و amp HBH PhD. يتطلب الاستثناء موافقة من مدرس الدورة.

504 هكم: التركيب والفاعلية في الكيمياء العضوية

النظريات الإلكترونية والكيميائية الفراغية المتعلقة بالتركيب العضوي والتفاعلات. تتم تغطية موضوعات مثل الترابط ، والانفعال ، والعطرية ، ونظرية MO ، وإعادة الترتيب الجزيئي ، والتفاعلات حول الحلق ، والكيمياء الضوئية. تهدف هذه الدورة إلى توفير أساس المعرفة في مستوى الخريجين المبتدئين كتحضير للمواد المتقدمة في 502 هكم و 503 هكم ، وهي مكملة لـ 501 هكم.

الخريف ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

523 هكم: الديناميكا الحرارية الكيميائية

تطوير صارم لأساسيات الديناميكا الحرارية وتطبيقها على عدد من الأنظمة التي تهم الكيميائيين ، مثل الخلايا الكهروكيميائية والغازات والتوازن المتجانس وغير المتجانس. كما سيتم تضمين مقدمة في الميكانيكا الإحصائية.

الخريف ، 1-3 وحدات دراسيّة ، درجة الرسالة

528 هكم: ميكانيكا إحصائية

النظرية الإحصائية لأنظمة التوازن وعمليات المعدل. نظرية المجموعات ، وظائف الارتباط المكاني والزمن.نماذج النظم وطرق تقدير خصائصها. مصمم لتمكين الطالب من استخدام الأدبيات الحالية التي تتناول تطبيق الميكانيكا الإحصائية على مشاكل الكيمياء.

الربيع ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

541 هكم: التركيب والتحليل الجزيئي الحيوي

تم وصف تراكيب الجزيئات البيولوجية وعلاقة تركيبها بالوظيفة البيولوجية. كما تمت مناقشة المنهجية المستخدمة لدراسة الجزيئات الكبيرة. تشمل الموضوعات الخصائص الكيميائية والفيزيائية للخلايا ومكونات الأنسجة ، بما في ذلك الكربوهيدرات والدهون والأحماض النووية والبروتينات والببتيدات. المتطلب السابق: أساس قوي في الكيمياء الفيزيائية والعضوية.

الخريف ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

542 هكم: علم الأحياء الكيميائي

يتم وصف التفاعل والوظيفة الفسيولوجية للجزيئات البيولوجية الكبيرة والعوامل المساعدة لها على المستوى الكيميائي الحيوي. يعكس تركيز هذه الدورة التطورات الحديثة في البيولوجيا الكيميائية. تشمل الموضوعات المحتملة المحفزات وآليات التفاعل والعلاقة بين البنية ثلاثية الأبعاد والتفاعلية وتفاعلات مستقبلات ليجند في الإشارات خارج الخلية وداخل الخلايا وطي البروتين في المختبر وفي الجسم الحي.

الربيع ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

543 هكم: الأساليب الكيميائية في علم الأحياء

استخدام المفاهيم والمنهجيات الجزيئية لحل المشكلات في علم الأحياء والطب. يغطي المقرر طرق توضيح ومراقبة النظم البيولوجية. تشمل الموضوعات المحتملة الجينوميات الكيميائية وعلم الأيض والعلاج الكيميائي.

الخريف ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

CSE 549: علم الأحياء الحسابي

يركز هذا المقرر على المشكلات الحالية في علم الأحياء الحسابي والمعلوماتية الحيوية. سيكون تركيزنا على الخوارزمية ، على اكتشاف مشاكل الخوارزمية التوافقية المناسبة وتقنيات حلها. ستشمل الموضوعات الأساسية تجميع تسلسل الحمض النووي ، وتجميع تسلسل الحمض النووي / البروتين ، ومقارنة تسلسل الحمض النووي / البروتين ، وتحليل مجموعة التهجين ، وطي الحمض النووي الريبي والبروتين ، وأشجار التطور.

المتطلب السابق: CSE 373 أو CSE 548 أو موافقة المعلم

الخريف ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

BME 558 / CHE 558 / PHY 558: علم الأحياء الفيزيائي والكمي

هذه دورة حول المبادئ الكمية لعلم الأحياء الفيزيائي. نحن نصف طبيعة القوى والطاقات والنتروبيا التي تدفع الأنظمة الجزيئية والخلوية نحو حالات التوازن. نحن ندرس مجموعة واسعة من التطبيقات في مجالات الكيمياء والبيولوجيا وهندسة المواد وعلم النانو. يهدف هذا المقرر الدراسي إلى إعطاء الطلاب فهمًا لكيفية ظهور تصرفات وسلوكيات المواد والأنظمة البيولوجية من مكوناتها (الذرات أو الجزيئات أو الخلايا). تشمل موضوعات هذه الدورة على سبيل المثال لا الحصر: الزمان والمكان في الخلايا الأساس الهيكلي لعلم الأحياء نماذج الذوبان الجزيئي والشبيكة المحتملة الكيميائية الانتشار الجماعي والحركية الكيميائية العشوائية الكهروستاتيكية ، الجهد ، ثنائيات الأقطاب ، الإمكانات الكهروكيميائية ، نماذج بواسون بولتزمان وبورن الإمكانات بين الجزيئات ومجالات القوة انتقالات الطور نماذج شعرية وعزل امتزاز تجليد متعدد الحدود تعاونية ملزمة الآلات الجزيئية المحركات الجزيئية وتحويل الطاقة ونقل الطاقة نظرية البوليمر Flory-Huggins رحلات عشوائية المرونة نظرية الملف اللولبي انتقالات الانهيار توازن طي البروتين حركات طي البروتين مساحة تسلسل تطور البروتين مرونة البروتين الميكانيكا البيولوجية للبروتينات الفيزياء الحيوية للخلية استقرار البروتينات ، التجميع ، الحركية تنظيم الجينات السكان والديناميكيات التطورية.

الخريف ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة

559 هكم / PHY 559: بيولوجيا الأنظمة وديناميكيات الشبكة

يقدم هذا المقرر الدراسي أسس بيولوجيا الأنظمة. أولاً ، نناقش الخصائص الديناميكية للشبكات الكيميائية والكيميائية الحيوية ، خاصة في الخلايا. ثانيًا ، نقدم مقدمة واسعة لعلم الشبكات الناشئ بما في ذلك الإنترنت وأنظمة النقل والشبكات الاجتماعية مثل Facebook وشبكات انتشار الأمراض وغيرها. نطبق المبادئ التي تعلمناها من تلك الأنظمة على شبكات التفاعلات الكيميائية الحيوية في الخلايا. هدفنا هو إعداد الطلاب لفهم خصائص الخلايا ومبادئ اكتشاف الأدوية في المستقبل بشكل أفضل. تشمل موضوعات هذه الدورة على سبيل المثال لا الحصر: الحركية الفيزيائية الانتشار / Smoluchowskii رحلات عشوائية أوقات الانتظار حركات بواسون براونيان الحركية الكيميائية حالات الانتقال الاستقرار ، التشعبات ، تطوير الأنماط الضوضاء في الخلايا: التغذية المرتدة الجوهرية والخارجية المذبذبات البيولوجية التكرار ، مضاعفة الفترة ، الفوضى الشبكات الطبولوجيا توزيع الدرجات ، بين نماذج الشبكات: Erdos-Renyi ، بدون مقياس ، اجتماعي ، Watts-Strogatz ، العوامل المتانة ، التحمل الأمثل للغاية ، القوس ، الأوبئة الشبكات البيولوجية: شبكات البروتين البروتين ، الشبكات التنظيمية والاستقلابية المعروفة الدوائر البيولوجية و سلوكياتهم كيف تتطور الشبكات: الارتباط التفضيلي ، إعادة الأسلاك ، قوانين الطاقة المتدفقة عبر الشبكات المعلومات والاتصالات ، الانتروبيا تحليل التدفق الأيضي الانتقاء الاصطناعي والطبيعي للسمات التطور الدارويني الديناميكيات السكانية.

الربيع ، 3 ساعات معتمدة ، درجة الرسالة ، قائمة x مع AMS 537

581 هكم: ندوة البحث في الأقسام

اجتماعات يتعرف فيها طلاب الدراسات العليا في السنة الأولى على الأنشطة البحثية لأعضاء هيئة التدريس في القسم.

603 هكم: مواضيع خاصة في الكيمياء العضوية

يختلف الموضوع باختلاف اهتمامات الطلاب وأعضاء هيئة التدريس. تشمل الموضوعات المحتملة التوليف غير المتماثل والتوليف الطبيعي للمنتج.

الخريف ، 1-3 أرصدة ، درجة الرسالة ، يمكن أن تتكرر للحصول على الائتمان.

607 هكم: التصميم الحديث للأدوية وتسليمها

دورة ندوة تغطي الجوانب والأساليب الحديثة لتصميم الأدوية. تجمع هذه الدورة بين العروض التقديمية التي يقدمها أعضاء هيئة التدريس وممثلو الصناعة لتقديم وجهة نظر متعددة التخصصات لتطور المستحضرات الصيدلانية.


مارك كون

يعمل مارك كون في الاحتمالات والمعلومات الكمومية ، والمعلوماتية الحيوية ، والتعلم الآلي والإحصائي ، والفيزياء الرياضية ، وعلم الأعصاب الرياضي والحسابي ، ونظرية التعقيد ، والموجات. يركز بحثه الحالي على مجالين.

الأول يتعلق بالاحتمالات الكمومية والحساب الكمي والمعلومات الكمومية. يعد الحساب الكمي بحل بعض مشاكل التحسين طويلة الأمد الناشئة في الإحصاء وعلم الأحياء الحسابي ، بما في ذلك طي البروتين ، وهيكل الحمض النووي الريبي ، ونشاط نسخ الحمض النووي. يرتبط الاحتمال الكمي أيضًا بالأسئلة التي لها تطبيقات في الميكانيكا الإحصائية. تتضمن هذه الأسئلة المتعلقة بالاعتماد / الاستقلالية (التشابك) للمتغيرات العشوائية الكمية ، وفي النهاية إلى مناهج أكثر عمومية لطرق الحوسبة الكمومية نفسها.

المجال الثاني للدراسة من قبل كون وزملاؤه هو في تطبيقات التعلم الآلي للمعلوماتية الحيوية والبيولوجيا الحسابية ، في مجالات تتراوح من استدلال شبكات تنظيم الجينات إلى تحديد وتصنيف السرطانات على أساس التباين الجيني ، وتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ، و microRNA ، وغيرها من المؤشرات الحيوية. أدت تطبيقات المعلوماتية الحيوية والنسخ للتعلم الإحصائي والآلي في الواقع إلى تحسينات منهجية ونظرية في الأساليب الإحصائية نفسها ، والتي أصبحت مهمة في العديد من جوانب هذه المشاريع البحثية. ترتبط هذه المناطق أيضًا بنظرية التعقيد الإحصائي ، والشبكات العصبية ، والاستدلال البايزي ، حيث توجد قضايا مماثلة بارزة. في هذا العمل ، يركز كون وزملاؤه على الروابط بين الأساليب الإحصائية المذكورة أعلاه ، وبشكل أكثر عمومية على صياغة منهجيات أكثر توحيدًا. يتمثل أحد الأهداف الموحدة في توفير نهج عام للتعلم الآلي ومجموعة خوارزمية لتحليل التفاعلات التنظيمية للجينات والتحكم في النسخ.


الإجابات والردود

أنت تفتقد بعض المفاهيم الأساسية. ربما استطيع المساعدة:

1. معظم الطفرات (التغييرات) ضارة. كما في العادة & quotfatal & quot إلى الكائن الحي مع التغيير.
2. كان العديد من البروتينات ذات النسب المشترك جزءًا من الكائنات الحية لمليارات السنين.
3. بعض الطفرات القليلة جدًا هي في الواقع مكسب للكائن الحي. إذن ما نراه اليوم هو من فاز ، وليس من خسر يانصيب الانتقاء الطبيعي.
هذا يسمى تحيز البقاء على قيد الحياة - ولهذا السبب لا نعرف دائمًا ما هو البروتين الذي جاء قبل ما نراه الآن.
https://en.wikipedia.org/wiki/Survivorship_bias

4. الأهم من ذلك هو مفهوم الظهور والتنظيم الذاتي:
خذ مجموعة من بعض القواعد البسيطة المتسخة. قم بتشغيلها ضد المركبات الأساسية المعروفة بوجودها في أماكن أخرى من النظام الشمسي ، وفي النهاية تحصل على حياة معقدة - بروتينات من الصفر إذا أردت.

IMO ، أفضل طريقة لرؤية هذا هو جهاز كمبيوتر بسيط ومقتطف من John Conway يسمى 'The Game of Life & quot.
- هذه طريقة رائعة لفهم مفهوم النشوء لأنه ينطبق على النشوء التلقائي ، انظر إلى الرسومات أولاً.

https://en.wikipedia.org/wiki/Conway's_Game_of_Life

إذا قرأت الرابط بالفعل وعبثت بالرسومات ، فسيصبح واضحًا بسرعة كبيرة. يمكنك أيضًا الحصول على إصدارات الإنترنت من اللعبة التي يمكنك لعبها بنفسك إذا كنت تريد ذلك.

يبدو أن النقاط الثلاث الأولى الخاصة بك تعالج فقط التغييرات التي تطرأ على البروتينات الكاملة التكوين. هذا ليس ما أسأل عنه.

هذا يبدو قليلا مثل & quotpoof! & quot كيف؟ ما الآلية؟ كيف حافظت البروتينات الجزئية على الوجود قبل أن تكتمل؟

ويبدو أن لعبة الحياة لجون كونواي شيء رياضي. حتى عند النظر إلى الرسومات ، لا أرى مدى الصلة بالموضوع. إذا نظرنا إلى الرياضيات فقط ، فهذا أمر مروع. ضع في اعتبارك بروتين صغير نسبيًا يحتوي على 100 بقايا. يوجد حوالي 20 ^ 100/2 أو 6E129 مجموعة عشوائية ممكنة. الكون ليس قريبًا جدًا من العديد من أوقات بلانك القديمة. من الواضح أن البروتينات لم تنشأ عن أي شيء رياضي ذي قوة غاشمة ، والذي يبدو أن اللعبة تستخدمه.

من المغري القول إن معظم الترتيبات العشوائية تم رفضها بقبول الإجابة الصحيحة فقط عند كل إضافة. ولكن على حد علمي ، فإن البروتين الأطول الصحيح ولكنه غير المكتمل لا يعمل بشكل أفضل من البروتين الأقصر الصحيح ولكنه غير المكتمل. فكيف تم رفض الإضافات غير الصحيحة على مسار التطوير؟

تعتبر النقاط الثلاث الأولى لـjim mcnamara وثيقة الصلة بضبط تسلسل البروتين الموجود.

هناك عوامل تطورية إضافية من شأنها أن تقلل من احتمالات تطور البروتين.

زيادات أسرع في التباين (يمكن أن تؤدي هذه إلى اختصار إضافة الأحماض الأمينية واختيار التسلسل لوظائف وهياكل معينة):
1) معظم البروتينات الحالية لا يتم إنشاؤها من الصفر فقط. هم من نسل بروتينات أخرى ، وغالبًا ما يكون أكثر من بروتين واحد.
الازدواجية الجينية والازدواجية الكاملة للجينوم ليست شائعة في التطور وتعتبر مصدرًا مهمًا لمواد العمل لمزيد من التطور. ينتج عن تكرار الجينوم الكامل نسخ إضافية من كل جين مشفر للبروتين في جينوم الكائن الحي. هذا يحرر نصف الجين المشفر للبروتين من أن يكون مقيدًا لأداء وظيفة محددة ويسمح لهم بمزيد من الحرية لتغيير التسلسل الحالي أو الحصول على تسلسل جديد. وبالتالي يمكن أن تتغير هذه التسلسلات دون قتل الكائن الحي الذي يحملها. يمكن أن تتحلل إلى جينات زائفة أو تتحول إلى جينات وظيفية جديدة.

2) العديد من الجينات هي نتاج دمج أجزاء من جينات أخرى معًا. هناك مكونات وظيفية للبروتينات (مثل موقع إنزيمي ، أو غشاء ممتد ، أو علامة بروتينية لتصديرها من الخلية ، أو بعض مواقع الربط) والتي يمكن أن تكون نسخًا من مكان ما وتوضع في مكان آخر قد يكون أو ربما ألا تكون جزءًا من جين. يمكن أن ينتج عن ذلك بروتين له مجموعة جديدة من الوظائف ، مثل وضع إنزيم طبيعي في السيتوبلازم في حويصلة بدلاً من ذلك. في بعض الأحيان يمكن أن يولد هذا بروتينات بوظائف جديدة.

3) يمكن للفيروسات الاستيلاء على جزء من البروتين ونقله من مكان (أو نوع واحد) ووضعه في جين ترميز بروتين آخر.

تقلل الأعداد الكبيرة من احتمالات حدوث حدث غير متوقع (رمي المزيد من النرد / المزيد من رميات النرد):
4) يمكن أن تكون أعداد الكائنات الحية أحادية الخلية (التي تطورت فيها معظم هياكل البروتين لأول مرة) ضخمة للغاية. لقد قمت بتنمية 10 8 خلايا من الثدييات في أقل من لتر من وسائط زراعة الأنسجة (في ظل الظروف المثلى). يوجد ما يقرب من 1.335.000.000 (1.3 × 10 9) كيلومتر مكعب من مياه المحيط ، أي 1.3 × 10 21 لترًا. تكون الخلايا البكتيرية أصغر حجمًا ولكن يمكن أن تكون أكثر كثافة في الظروف المثلى. لن يوفر العالم الطبيعي عادة الظروف المثلى ، ولكن لا تزال هناك إمكانية جيدة للأعداد الكبيرة حقًا.

5) يمكن أن تكون الأجيال البكتيرية قصيرة بحد أقصى 20 دقيقة والتي يمكن أن تنتج (على النحو الأمثل) 26000 جيل سنويًا.

ليست كل الأحماض الأمينية في البروتين لها نفس القدر من الأهمية (لا يقتصر كل موضع في البروتين على حمض أميني واحد فقط):
6) يمكن تبديل بعضها للأحماض الأمينية المتشابهة كيميائيًا مع تغيير بسيط في الوظيفة. بعض أجزاء البروتين تشبه نوعًا ما سقالة ، تحمل الأجزاء الأكثر أهمية في أماكنها.


علم الأحياء (BIO)

مقدمة لبيئة النظام البيئي والكيمياء الحيوية الأرضية. ستركز هذه الدورة على ديناميكيات الكربون والعناصر البيولوجية الأساسية الأخرى في نظام الأرض ، على المقاييس المكانية من المحلية إلى العالمية.

السيرة الذاتية 103. صحة الإنسان والكوكب. 2 وحدة.

اثنان من أكبر التحديات التي يتعين على البشرية مواجهتها - وهما تعزيز صحة الإنسان ووقف التدهور البيئي - مرتبطان ارتباطًا وثيقًا. يدرك المجال الناشئ لصحة الكواكب هذه الروابط المتداخلة ويعزز الحلول الإبداعية متعددة التخصصات التي تحمي صحة الإنسان وصحة النظم البيئية التي نعتمد عليها. من خلال سلسلة من المحاضرات ومناقشات دراسة الحالة ، سيطور الطلاب فهمًا متعمقًا لمفهوم "صحة الكواكب" وأسسه وأهدافه ومجالات العمل ذات الأولوية وأساليب التحقيق والتحديات المباشرة الأكثر صلة.
مثل: BIO 203

BIO 104. علم الأحياء الجزيئي المتقدم: علم التخلق والبروتين. 5 وحدات.

الآليات الجزيئية التي تحكم النسخ المتماثل وإعادة التركيب والتعبير عن جينومات حقيقية النواة. الموضوعات: تكرار الحمض النووي ، إعادة تركيب الحمض النووي ، نسخ الجينات ، ربط الحمض النووي الريبي ، تنظيم التعبير الجيني ، تخليق البروتين ، وطي البروتين. المتطلبات المسبقة: جوهر علم الأحياء أو BIO 83 (ينصح بشدة بيو 82 و 86).
مثل: BIO 200

105 أ. علم البيئة والتاريخ الطبيعي للمحمية البيولوجية جاسبر ريدج. 4 وحدات.

علم البيئة والتاريخ الطبيعي لـ Jasper Ridge Biological Preserve دورة تدريبية في القسم العلوي ، تهدف إلى مساعدة الطلاب على تعلم البيئة والتاريخ الطبيعي باستخدام مختبر حي ، محمية جاسبر ريدج. الهدف الرئيسي للدورات التدريبية هو أنه ، كمجتمع للتعلم ، ندرس من خلال مناقشات تمهيدية ، تليها تجارب عملية في هذا المجال ، الأساس العلمي لـ: البحث البيئي ، وعلم الآثار ، وعلم الآثار ، والجيولوجيا ، والهيدرولوجيا ، وتفاعلات الأنواع ، وإدارة الأراضي ، والتعليم البيئي متعدد التخصصات. يقود الجلسات العشر التي يتكون منها البرنامج الأكاديمي المدربون وأعضاء هيئة التدريس (خبراء عالميون في مواضيع كل جلسة) وموظفي JRBP. بالإضافة إلى ذلك ، يقوم هذا الفصل بتدريب الطلاب ليصبحوا Docents في JRBP الذين ينضمون بالتالي إلى مجتمع الشركات التابعة للتعليم Jasper Ridge. nn بعد الانتهاء من هذه الدورة وكشركات تابعة جديدة لـ Jasper Ridge ، سيتمكن المشاركون من قيادة الجولات التعليمية التي تركز على البحث والمساعدة في الفصول والأبحاث وحضور أنشطة التعليم المستمر المتاحة لأعضاء مجتمع JRBP.
مثل: EARTHSYS 105A

105 ب. علم البيئة والتاريخ الطبيعي للمحمية البيولوجية جاسبر ريدج. 4 وحدات.

علم البيئة والتاريخ الطبيعي لـ Jasper Ridge Biological Preserve دورة تدريبية في القسم العلوي ، تهدف إلى مساعدة الطلاب على تعلم البيئة والتاريخ الطبيعي باستخدام مختبر حي ، محمية جاسبر ريدج. الهدف الرئيسي للدورة هو أنه ، كمجتمع للتعلم ، ندرس من خلال مناقشات تمهيدية ، تليها تجارب عملية في هذا المجال ، والأساس العلمي لـ: البحث البيئي ، وعلم الآثار ، وعلم الآثار ، والجيولوجيا ، والهيدرولوجيا ، وتفاعلات الأنواع ، وإدارة الأراضي ، والتعليم البيئي متعدد التخصصات. يقود الجلسات العشر التي يتكون منها البرنامج الأكاديمي المدرسون وأعضاء هيئة التدريس (خبراء عالميون في مواضيع كل جلسة) وموظفي JRBP. بالإضافة إلى ذلك ، يقوم هذا الفصل بتدريب الطلاب ليصبحوا Docents في JRBP الذين ينضمون بالتالي إلى مجتمع الشركات التابعة للتعليم Jasper Ridge. بعد الانتهاء من هذه الدورة ، وبصفتهم شركات تابعة جديدة لـ Jasper Ridge ، سيتمكن المشاركون من قيادة جولات تعليمية تركز على الأبحاث ، والمساعدة في الفصول والأبحاث ، وحضور أنشطة التعليم المستمر المتاحة لأعضاء مجتمع JRBP.
مثل: EARTHSYS 105B

بيو 109 أ. اللبنات الأساسية للأمراض المزمنة. 3 وحدات.

لقد قطع الباحثون شوطا طويلا في تطوير علاجات للأمراض المزمنة ولكن لا تزال هناك فجوة بين الحلول الحالية والقدرة على معالجة المرض بالكامل. يقدم هذا المساق لمحة عامة عن البيولوجيا الكامنة وراء العديد من هذه الأمراض وكيفية ارتباطها ببعضها البعض. هناك حاجة إلى & quot التفكير خارج الصندوق & quot في نهج اكتشاف الأدوية لسد هذه الفجوة في الحلول ، وتعلم هذه الدورة اللبنات الأساسية لهذا النهج. هل يمكن أن تقدم ليغولاند الإجابة؟ هذه سلسلة محاضرات ضيف مع مساهمات أصلية من قادة الفكر البارزين في الأوساط الأكاديمية والصناعية. من المتوقع التفاعل بين الطلاب والمحاضرين الضيوف. الطلاب الحاصلين على تخصص رئيسي أو ثانوي أو متماثل في علم الأحياء: 109A / 209A أو 109B / 209B قد يحسبون في برنامج الشهادة ولكن ليس كلاهما.
مثل: BIOC 109A ، BIOC 209A ، HUMBIO 158

بيو 109 ب. التطورات في التطور العلاجي: الإشارات العصبية وعلم المناعة. 3 وحدات.

تركز هذه الحلقة الدراسية على تعليم الطلاب الأبحاث والتطبيقات الجديدة في مجالات علم الأعصاب وعلم المناعة. ستغطي الدورة موضوعات تتراوح من المسارات العصبية في إدمان المواد الأفيونية وآليات الألم ، إلى التطورات في العلاج المناعي. سوف يتفاعل الطلاب مع مواد متنوعة من كبار خبراء علم الأعصاب والعلاج المناعي للسرطان في منطقة الخليج. سيزور المحاضرون الضيوف من الأوساط الأكاديمية وشركات الأدوية / التكنولوجيا الحيوية المجاورة. المشاركة النشطة مطلوبة. المتطلبات المسبقة: علم الأحياء أو جوهر علم الأحياء البشري. الطلاب الحاصلين على تخصص رئيسي أو ثانوي أو متماثل في علم الأحياء: 109A / 209A أو 109B / 209B قد يحسبون في برنامج الدرجات العلمية ، ولكن ليس كلاهما.
مثل: BIOC 109B

بيو 10N. استخدام الفيزياء لشرح علم الأحياء: مناهج ميكانيكية لبيئة العوالق. 3 وحدات.

غالبًا ما يفكر الناس في الفيزياء وعلم الأحياء على أنهما مساعٍ علمية منفصلة تمامًا ، ولكن في الواقع يمكن الجمع بين الاثنين بشكل مثمر. تعيش جميع النباتات والحيوانات في بيئة مادية ، وغالبًا ما تحدد قوانين الفيزياء التي تحكم تلك البيئة كيفية عمل الكائنات الحية وتفاعلها. في هذه الندوة ، سوف نستكشف التقاء الفيزياء والبيولوجيا من خلال نظرة متعمقة حول كيفية تأثر العوالق النباتية والعوالق الحيوانية - الطحالب الصغيرة والحيوانات التي تشكل قاعدة الشبكة الغذائية للمحيطات - بالخصائص الفيزيائية لـ عالمهم المائي. ستندهش من قدرتنا على شرح بيئة هذه الكائنات الحية ، ومدى أهمية هذه البيئة للحياة على الأرض.

110 بيو.الجينوم المنظم بالكروماتين. 3 وحدات.

الحفاظ على الجينوم شرط أساسي للحياة. في حقيقيات النوى ، ترتبط جميع العمليات المقولبة للحمض النووي ارتباطًا وثيقًا ببنية الكروماتين ووظيفته. يستكشف هذا المقرر الدراسي التنظيم اللاجيني والكروماتين للعمليات الخلوية المتعلقة بالشيخوخة والسرطان وتعدد الخلايا الجذعية والتوازن الأيضي والتطور. تدمج مادة الدورة الأدبيات الحالية مع المراجعة التأسيسية لتعديلات الهيستون وتكوين النوكليوزوم في الوراثة اللاجينية والنسخ والتكرار وانقسام الخلايا واستجابات تلف الحمض النووي. المتطلبات المسبقة: BIO 41 أو BIO 83 أو موافقة المعلم.
مثل: بيو 210

بيو 112. علم وظائف الأعضاء البشرية. 4 وحدات.

سيتم فحص فسيولوجيا الإنسان من خلال أجهزة الأعضاء: القلب والأوعية الدموية والجهاز التنفسي والكلى والجهاز الهضمي والغدد الصماء. تتم مناقشة البيولوجيا الجزيئية والخلوية ومبادئ الإشارات التي تكمن وراء تطور الأعضاء والفيزيولوجيا المرضية وفرص الطب التجديدي ، بالإضافة إلى آليات التحكم التكاملية وتطور الجنين. المتطلبات المسبقة: جوهر علم الأحياء البشري أو أسس علم الأحياء أو ما يعادلها أو موافقة المعلم.
مثل: HUMBIO 133

بيو 113. أساسيات التطور الجزيئي. 4 وحدات.

استنتاج العمليات التطورية الجزيئية الرئيسية من تسلسل الحمض النووي والبروتين. تشمل الموضوعات الانجراف الجيني العشوائي ، والنماذج الموحدة ، والتأثيرات والاختبارات الخاصة بالانتقاء الطبيعي ، والتأثيرات المجمعة للربط والانتقاء الطبيعي ، وتحيز الكودون ، وتطور الجينوم. المتطلبات الأساسية: علم الأحياء الأساسي أو BIO 82 أو 85 أو خريج يقف في أي قسم ، وموافقة المعلم.
مثل: BIO 244

BIO 114. bioBUDS (بناء العلماء الناميين): العلم في المختبر وما بعده. 2 وحدة.

معرفتك وخبراتك وأهدافك الفريدة لتعزيز فهمنا الجماعي للحياة من حولنا. تهدف BUDS إلى توسيع فكرة ما يعنيه أن تكون عالمًا وتساعد في عملية أن تصبح علماء يحركهم المجتمع داخل المختبر وخارجه. سنسلط الضوء على طلاب الدراسات العليا والجمعيات من المجموعات الممثلة تمثيلا ناقصا تاريخيا لوجهات نظرهم حول البحث والوظائف الأوسع في العلوم والتكنولوجيا والهندسة والرياضيات. جميع نوادي المجلات وورش العمل مفتوحة لجميع الطلاب بغض النظر عن انتماء القسم أو مستوى الخبرة أو المجال.

بيو 115. المملكة الخفية - تطور وبيئة وتنوع الفطريات. 4 وحدات.

تعتبر الفطريات مكونات مهمة ، ولكنها غالبًا ما تكون مخفية ، في المحيط الحيوي. إنهم ينظمون التحلل ، وهم شركاء أساسيون في تعايش النبات ويؤثرون بشدة على الزراعة والاقتصاد. سيستكشف الطلاب العالم الرائع لبيولوجيا الفطريات والبيئة والتطور من خلال المحاضرات والمختبرات والتمارين الميدانية والرحلات الميدانية يوم السبت التي ستوفر الخبرات التقليدية والجزيئية في جمع الفطريات المتنوعة وتحليلها واستخدامها الصناعي. سيختار الطلاب مكانًا بيئيًا ، ويجمعون ويحددون الفطريات المقيمة ، ويفترضون حول علاقتهم المجتمعية. المتطلب السابق: BIO 81، 85 موصى به.
مثل: بيو 239

بيو 116. إيكولوجيا جزر هاواي. 4 وحدات.

البيئة البرية والبحرية وبيولوجيا الحفظ في أرخبيل هاواي. تم تدريسه في الميدان في هاواي كجزء من تسلسل ربع طويل من الدورات بما في ذلك علوم الأرض والأنثروبولوجيا. تشمل الموضوعات التعاقب البيئي ، والتفاعلات بين التربة والنبات ، وبيولوجيا الحفظ ، والغزوات البيولوجية ونتائج النظام البيئي ، وبيئة الشعاب المرجانية. يقتصر على الطلاب المقبولين في برنامج Earth Systems of Hawaii.
مثل: EARTHSYS 116

بيو 117. علم الأحياء والتغير العالمي. 4 وحدات.

الأسباب والعواقب البيولوجية للتغيرات البشرية والطبيعية في الغلاف الجوي والمحيطات والنظم الإيكولوجية الأرضية والمياه العذبة. الموضوعات: الدورات الجليدية والدورة البحرية ، وغازات الاحتباس الحراري وتغير المناخ ، وإزالة الغابات الاستوائية وانقراض الأنواع ، والنمو السكاني البشري واستخدام الموارد. المتطلبات المسبقة: علم الأحياء أو جوهر علم الأحياء البشري أو BIO 81 أو مكانة الخريجين.
مثل: EARTHSYS 111 ، EARTHSYS 217 ، ESS 111

السيرة الذاتية 119. تطور النظم الإيكولوجية البحرية. 3-4 وحدات.

تطورت الحياة في الأصل في المحيط. متى ولماذا وكيف حدثت التحولات الكبرى في تاريخ الحياة البحرية؟ ما الذي أدى إلى التطور السريع والتنوع للحيوانات في العصر الكمبري ، بعد أكثر من 3.5 مليار سنة من تاريخ الأرض؟ ما الذي تسبب في أحداث الانقراض الجماعي الكبرى على الأرض؟ كيف تقارن أحداث الانقراض القديمة بالتهديدات الحالية للنظم البيئية البحرية؟ كيف أثر تطور المنتجين الأساسيين على الحيوانات ، وكيف أثر تطور الحيوان على المنتجين الأساسيين؟ في هذه الدورة ، سنراجع أحدث الأدلة فيما يتعلق بهذه الأسئلة الرئيسية في تاريخ النظم البيئية البحرية. سنعمل على تطوير الإلمام بالمجموعات الأكثر شيوعًا من أحافير الحيوانات البحرية. سنقوم أيضًا بإجراء تحليلات أصلية لبيانات الحفريات ، وتطوير المهارات في كل من صياغة واختبار الفرضيات العلمية وفي تحليل البيانات وعرضها.
مثل: EARTHSYS 122، GEOLSCI 123، GEOLSCI 223B

بيو 120. بيولوجيا بدائية النواة - نهج كمي. 3 وحدات.

للعيش ، يجب على الميكروبات أن تنسق بنجاح العمليات الخلوية المختلفة ، بما يتماشى مع الموارد المتاحة وما تتطلبه الظروف البيئية. يقدم هذا المقرر الدراسي التطورات الكمية في فهم هذا التنسيق وعواقبه عبر المقاييس: من البيولوجيا الجزيئية عبر النمو إلى ديناميكيات السكان والبيئة. جلسات المعمل الجاف تكمل المحاضرات لتقديم الأساليب الحسابية. سيتم تقديم أدوات التحليل القائمة على بايثون. متطلب: رياضيات 51 أو رياضيات 19 ، 20 ، 21. موصى به: علم الأحياء الدقيقة (مثل BIO 62 أو 162) ودورات البيولوجيا الجزيئية / الكيمياء الحيوية / علم الوراثة (على سبيل المثال BIO 82 أو 83) والإلمام الأساسي بالشفرات.
مثل: BIO 220

بيو 121. علم الأورام. 3 وحدات.

مسح جامعي متقدم لعلم الطيور ، وتعريف الطلاب ببيولوجيا الطيور وإعطائهم أدوات لاستخدام الطيور كنظم نموذجية للبحث. ستشمل الموضوعات تطور الطيور وعلم وظائف الأعضاء والتكيفات والسلوك والبيئة. ركز طوال الوقت على تحديد طيور كاليفورنيا والتطبيقات على قضايا الحفاظ على الطيور الحالية. ستشمل الدورة محاضرات ومكونًا ميدانيًا سيعرض الطلاب على تقنيات بحث الطيور القياسية مثل الخطأ في الشبكة ، والنطاقات ، واستطلاعات عدد النقاط. المتطلبات المسبقة: BIO 81 أو BIO 105 أو موافقة المعلم.
مثل: BIO 221

BIO 124. موضوعات في بيولوجيا السرطان. 3 وحدات.

سوف تستكشف هذه الدورة القائمة على المناقشة الأدوات العلمية المستخدمة لدراسة الأساس الجزيئي والجيني للسرطان وتطوير علاجات لهذا المرض. قد تشمل الموضوعات التي يتم تناولها نماذج السرطان ، وعلاجات السرطان التقليدية والمستهدفة ، وتطوير مقاومة العلاج. سيطور الطلاب مهارات في القراءة النقدية لمقالات البحث الأولية وسيكملون أيضًا مشروعًا نهائيًا. المتطلبات الأساسية: جوهر علم الأحياء البشري أو BIO 82 ، 83 ، 86 ، أو بإذن من المدرب.

بيو 126. مقدمة في الفيزياء الحيوية. 3-4 وحدات.

دورة أساسية مناسبة للطلاب الجامعيين المتقدمين وطلاب الدراسات العليا الذين لديهم معرفة مسبقة بحساب التفاضل والتكامل ودورة في الفيزياء بالكلية. مقدمة لكيفية تقديم المبادئ الفيزيائية رؤى ثاقبة في علم الأحياء الحديث ، فيما يتعلق بالتنظيم الهيكلي والديناميكي والوظيفي للأنظمة البيولوجية. تشمل الموضوعات أدوار الطاقة الحرة ، والانتشار ، والقوى الدافعة الكهربائية ، وديناميات عدم التوازن ، والمعلومات في العمليات البيولوجية الأساسية.
مثل: APPPHYS 205 ، BIO 226

السيرة الذاتية 129. أساسيات وحدود في بيولوجيا النبات. 3 وحدات.

ستكون هذه الدورة بمثابة كتاب تمهيدي لجميع مستويات الخريجين ، والمشتركين ، والطلاب الجامعيين من المستوى الأعلى المهتمين بالتعرف على الجوانب الأساسية لبيولوجيا النبات ، وأحدث التطورات في الأدوات والتقنيات والنظريات التي تربط العلوم الأساسية بالعلوم الترجمية. وتطبيقات حل التحديات المجتمعية الكبرى في الحاضر والمستقبل. بالإضافة إلى ذلك ، ستعمل هذه الدورة على تقديم اتساع نطاق البحوث النباتية في الحرم الجامعي وتساعد في ترسيخ مجموعة من الطلاب المهتمين ببيولوجيا النبات.
مثل: BIO 229

بيو 12N. علم البيئة الحسية للحيوانات البحرية. 3 وحدات.

تشهد الحيوانات التي تعيش في المحيطات مجموعة متنوعة للغاية من المحفزات البيئية. يتطلب نمط الحياة المائي مجموعة غنية بنفس القدر من التكيفات الحسية ، بما في ذلك بعض التعديلات الحسية الغريبة تمامًا علينا. في هذا المقرر سوف ندرس النظام الحسي في الحيوانات البحرية من منظور بيئي وسلوكي ومن وجهة نظر علم الأعصاب وهندسة نظم المعلومات.

بيو 130. النظم البيئية في كاليفورنيا. 4 وحدات.

تعد كاليفورنيا موطنًا لمجموعة متنوعة ضخمة من أنواع وعمليات النظام البيئي. توفر هذه الدورة التدريبية مقدمة عن التاريخ الطبيعي ، والنظاميات ، وبيئة النظام الإيكولوجي للنظم البيئية في كاليفورنيا ، بناءً على مجموعة من المحاضرات ، والمشروعات التي يقودها الطلاب ، والرحلات الميدانية في عطلة نهاية الأسبوع. ستتنوع النظم البيئية التي سيتم استكشافها من السواحل إلى الجبال ومن الصحراء إلى الأراضي الرطبة. تتضمن المتطلبات ثلاث مقالات والمشاركة في ثلاث رحلات ميدانية (من ستة خيارات).
مثل: إيرثسيس 130 أ

BIO 132. مختبر التصوير المتقدم في الفيزياء الحيوية. 4 وحدات.

المختبر والمحاضرات. الفحص المجهري والتصوير المتقدمان ، مع التركيز على الخبرة العملية بأحدث التقنيات. يقوم الطلاب ببناء وتشغيل جهاز العمل. تشمل الموضوعات البصريات المجهرية ، وإضاءة كوهلر ، وآليات توليد التباين (المجال الساطع / المظلم ، والتألق ، وتباين الطور ، وتباين التداخل التفاضلي) ، وحدود الدقة. تختلف الموضوعات المختبرية حسب السنة ، ولكنها تشمل تألق جزيء واحد ، ونقل طاقة الرنين الفلوري ، والفحص المجهري متحد البؤر ، والفوتون المجهري ، والتنظير المجهري ، والمحاصرة البصرية. تسجيل محدود. موصى به: الفيزياء الأساسية ، وبيولوجيا الخلية الأساسية ، وموافقة المدرب.
مثل: APPPHYS 232، BIO 232، BIOPHYS 232، GENE 232

BIO 134- التحليل الجزيئي والخلوي لخطوط الخلايا السرطانية البشرية. 4 وحدات.

ستستخدم هذه الدورة المختبرية خلايا الثدييات المستزرعة لدراسة ما إذا كان العلاج الدوائي يمكنه استعادة وظيفة النسخ الطافرة من مثبط الورم p53. سيقوم الطلاب بأداء مجموعة متنوعة من التقنيات الخلوية والجزيئية ، بما في ذلك RT-PCR والتألق المناعي ، لاختبار قدرات معينة لطفراتهم في وجود وغياب الدواء. سيتوج المشروع بتجارب صممها الطلاب لاختبار جانب وظيفي من p53 وعرض النتائج على كل من الخبراء والجمهور العادي. المتطلبات الأساسية المقترحة بشدة: BIO 45 ، BIO 82 ، 83 ، 86.

بيو 135. علم الأعصاب. 3 وحدات.

علم الأعصاب هو دراسة الأساس العصبي لسلوك الحيوان. سوف نستكشف الآليات العصبية للسلوكيات الطبيعية في مجموعة متنوعة من الكائنات الحية. تشمل الموضوعات الآليات الجزيئية لوظيفة الجهاز العصبي ، والتفاعلات بين المفترس والفريسة ، والسلوك الاجتماعي ، والسلوكيات المعقدة الأخرى مثل التعلم والذاكرة ، والتنقل ، والتواصل. يشمل التقييم عروض تقديمية شفوية جماعية للأوراق العلمية ، ومطالبات أسبوعية بالواجبات المنزلية التي تؤدي إلى اقتراح منحة صغيرة ، والكتابة العلمية والتواصل مع الجمهور الأوسع حول موضوع علم الأعصاب. المتطلبات المسبقة: BIO 84.
مثل: بيو 235

السيرة الذاتية 136. التطور الكلي. 3 وحدات.

ستركز الدورة على التطور الكبير للحيوانات. سنستكشف كيف ساهم علم الأحياء القديمة وعلم الأحياء التطوري / علم الجينوم في فهمنا لأصول الحيوانات ، وكيف شكلت أنماط التطور والانقراض تنوع أشكال الحيوانات التي نلاحظها اليوم.
مثل: BIO 236 ، GEOLSCI 136 ، GEOLSCI 236

بيو 137. علم الوراثة النباتية. 3-4 وحدات.

تحليل الجينات ، الطفرات ، العناصر القابلة للنقل ، الوراثة التطورية للازهار وتطور الأجنة ، الجينات البيوكيميائية لاستقلاب النبات ، الدروس العلمية والمجتمعية من النباتات المحورة جينيا. المتطلبات المسبقة: جوهر علم الأحياء أو موافقة المعلم. يرضي WIM في علم الأحياء.

BIO 138. خدمات النظام الإيكولوجي: الحدود في علم تقدير الطبيعة. 3 وحدات.

يستكشف هذا المقرر الدراسي علم تقدير الطبيعة ، بدءًا من أصولها التاريخية ثم التركيز الأساسي على تطورها الحديث وحدودها. الهدف الرئيسي من الدورة هو تمكين البحث الجديد والتطبيقات الواقعية لأدوات ونهج إنفيست (التقييم المتكامل لخدمات النظام الإيكولوجي والمفاضلات). سنناقش الترابط بين الناس والطبيعة وحدود البحث الرئيسية ، كما هو الحال في مجالات التنوع البيولوجي ، والمرونة ، وصحة الإنسان ، والتخفيف من حدة الفقر ، والتنمية المستدامة. العلم الذي سنستكشفه في خدمة القرارات ، وسنستخدم أمثلة من الحياة الواقعية لتوضيح سبب أهمية هذا العلم لإعلامنا لماذا وأين وكيف ومقدار الناس بحاجة إلى الطبيعة. المتطلبات المسبقة. مهارات نظم المعلومات الجغرافية الأساسية إلى المتوسطة مطلوبة (بما في ذلك العمل مع تحميل البيانات النقطية والمتجه والجداول وتحرير البيانات النقطية وملفات الأشكال والجداول في فهم نظم الإحداثيات وفهم نظم المعلومات الجغرافية وإجراء العمليات الحسابية الأساسية النقطية).
مثل: بيو 238 ، إيرثسيس 139 ، إيرثسيس 239

بيو 140. علم الحياة المتطرفة للبحر. 3 وحدات.

يغطي الطريقة التي تعيش بها الحيوانات والنباتات البحرية في البيئات القاسية من خلال فحص التكيفات المورفولوجية والبيئية والجينية مع درجات الحرارة المنخفضة والحرارة المرتفعة والمياه العميقة وما إلى ذلك. كما نغطي أيضًا أنماط الحياة القاسية مثل السباحة السريعة وحجم الجسم الصغير والكبير والرواية الجهاز التناسلي. تتخلل مواد المحاضرة سلسلة من البرامج التعليمية حول مهارات الكتابة السردية في العلوم ، وخاصةً الإبداعية غير الخيالية والمذكرات والمقالات المضفرة والخيال القصير. الهدف هو دمج التفكير الكمي حول علوم الحياة مع الكتابة الإبداعية التي تجلب الحقائق إلى الحياة. المتطلبات الأساسية: دورات أساسية في علم الأحياء أو الكتابة الإبداعية أو العلوم البيئية أو الهندسة. محاضرتان متتاليتان يوم الثلاثاء مع Intermezzo للكتابة بينهما.

بيو 141. الإحصاء الحيوي. 5 وحدات.

طرق إحصائية تمهيدية للبيانات البيولوجية: وصف البيانات (ملخصات رقمية ورسومية) مقدمة في الاحتمالية والاستدلال الإحصائي (اختبارات الفرضيات وفترات الثقة). الأساليب الإحصائية الوسيطة: مقارنة المجموعات (تحليل التباين) ، وتحليل الارتباطات (الانحدار الخطي واللوجستي) وطرق البيانات الفئوية (جداول الطوارئ ونسبة الأرجحية). تم دمج محتوى الدورة التدريبية مع الحوسبة الإحصائية في R.
مثل: STATS 141

BIO 142. مختبر علم الأحياء الدقيقة الجزيئي. 3-4 وحدات.

في هذه الدورة ، سيدرس الطلاب التركيب الحيوي للعلامات الحيوية للدهون الحلقية ، وهي جزيئات تنتجها الميكروبات الحديثة التي يمكن حفظها في الصخور التي يزيد عمرها عن مليار سنة والتي يستخدمها الجيولوجيون كأحفاف جزيئية. سيتم تكليف الطلاب بتحديد جينات تخليق الدهون للعلامات الحيوية المحتملة في قواعد البيانات الجينومية البيئية ، والتعبير عن تلك الجينات في نظام التعبير البكتيري النموذجي في المختبر ، ثم تحليل المنتجات الدهنية التي يتم إنتاجها. الهدف العام هو أن يختبر الطلاب عملية البحث العلمي بما في ذلك إنشاء الفرضيات واختبار هذه الفرضيات في التجارب المعملية وإبلاغ نتائجها من خلال ورقة أسلوب النشر. المتطلبات الأساسية: BIO83 و CHEM 121 أو إذن المعلم.
مثل: EARTHSYS 143، ESS 143، ESS 243

بيو 144. بيولوجيا الحفظ: منظور أمريكا اللاتينية. 3 وحدات.

مبادئ وتطبيق علم الحفاظ على التنوع البيولوجي. من الناحية المفاهيمية ، تم تصميم هذه الدورة لاستكشاف المكونات الرئيسية ذات الصلة بحفظ التنوع البيولوجي ، كما يتضح من منطقة أمريكا اللاتينية. ومع ذلك ، يجب أن تكون الأطر والمبادئ المفاهيمية قابلة للتطبيق بشكل عام ، وتوفر رؤى لجميع مناطق العالم. يُتوقع من جميع الطلاب إجراء تمرين بحث في الأدب يؤدي إلى تقرير مكتوب ، يتناول موضوعًا من اختيارهم ، مستمدًا من أي من الموضوعات التي تمت مناقشتها في الفصل. المتطلبات المسبقة: BIO 101 أو BIO 43 أو HUMBIO 2A أو BIO 81 و 84 أو موافقة المدرب.
مثل: BIO 234 ، HUMBIO 112

بيو 145. علم البيئة وتطور سلوك الحيوان. 3 وحدات.

المنظورات البيئية والتطورية لسلوك الحيوان ، مع التركيز على السلوك الاجتماعي والجماعي. هذه دورة قائمة على المشاريع في شكل محاضرة / ندوة. ستستند الندوات إلى مناقشة مقالات المجلات. مشاريع بحثية مستقلة عن سلوك الحيوانات في الحرم الجامعي. المتطلبات الأساسية: علم الأحياء أو جوهر علم الأحياء البشري أو BIO 81 و 85 أو موافقة مدرس الأحياء / ES 30. يوصى به: الإحصائيات.
مثل: BIO 245

بيو 146. الجينات والأمراض. 3 وحدات.

سيكشف الطلاب في هذه الدورة عن المبادئ الأساسية لعلم الوراثة والبيولوجيا الجزيئية من خلال التحقيق في دراسات الحالة للأمراض البشرية والأساليب العلاجية الجديدة في التنمية. ستتطلب هذه الدورة قراءة ومناقشة عن كثب للأدب الابتدائي وسوف تؤكد وتدعم تطوير المهارات النقدية في الاتصال العلمي. سيستخدم الطلاب مجموعة متنوعة من الوسائط لنقل المعلومات العلمية إلى مجموعة من الجماهير في سلسلة من المشاريع المنجزة خلال الربع. الشروط: BIO 82 و 83 و 86 أو ما يعادلها.

BIO 147. إيكولوجيا النظام الإيكولوجي والكيمياء الحيوية. 3 وحدات.

مقدمة لبيئة النظام البيئي والكيمياء الحيوية الأرضية. ستركز هذه الدورة على ديناميكيات الكربون والعناصر البيولوجية الأساسية الأخرى في نظام الأرض ، على المقاييس المكانية من المحلية إلى العالمية. المتطلبات: علم الأحياء 117 ، أنظمة الأرض 111 ، أو مكانة الخريجين.
مثل: BIO 240 و EARTHSYS 147 و EARTHSYS 247

BIO 148. تطور النظم الإيكولوجية الأرضية. 4 وحدات.

ماذا ومتى وأين وكيف نعرفه فيما يتعلق بالحياة على الأرض عبر الزمن. تمت تغطية جميع النباتات الأحفورية والفطريات واللافقاريات والفقاريات (نعم ، الديناصورات) ، بما في ذلك كيفية تفاعل كل هذه المكونات مع بعضها البعض ومع تغير المناخ ، والانجراف القاري ، وتكوين الغلاف الجوي ، والاضطرابات البيئية مثل التجلد والانقراض الجماعي. تتضمن الدورة كلاً من المحاضرات ومكونات المختبر. يُتوقع من طلاب الدراسات العليا المسجلين على مستوى 200 كتابة ورقة بحثية ، ولكن يمكنهم إلغاء الاشتراك في بعض المعامل عند الاقتضاء.
مثل: BIO 228 ، EARTHSYS 128 ، GEOLSCI 128 ، GEOLSCI 228

بيو 149. البيولوجيا العصبية للنوم. 4 وحدات.

الكيمياء العصبية والفيزيولوجيا العصبية للتغيرات في نشاط الدماغ والوعي الواعي المرتبط بالتغيرات في حالة النوم / الاستيقاظ. الظواهر السلوكية والبيولوجية العصبية بما في ذلك تنظيم النوم ، واستتباب النوم ، وإيقاعات الساعة البيولوجية ، واضطرابات النوم ، ووظيفة النوم ، والبيولوجيا الجزيئية للنوم. nn تفضيل لكبار السن وطلاب الدراسات العليا. nn يقتصر التسجيل على 16.
مثل: BIO 249، HUMBIO 161، PSYC 149، PSYC 261

بيو 150. علم الأحياء السلوكي البشري. 5 وحدات.

متعددة التخصصات. كيفية التعامل مع السلوكيات المعقدة والشاذة من خلال علم الأحياء. كيفية دمج التخصصات بما في ذلك علم الأحياء الاجتماعي وعلم السلوك وعلم الأعصاب وعلم الغدد الصماء لفحص السلوكيات مثل العدوان والسلوك الجنسي واستخدام اللغة والأمراض العقلية.
مثل: HUMBIO 160

السيرة الذاتية 151. آليات موت الخلايا العصبية. 3 وحدات.

للطلاب الجامعيين ذوي الخلفيات في علم الأعصاب. البيولوجيا الخلوية والجزيئية لموت الخلايا العصبية أثناء المرض العصبي.الموضوعات: أمراض الأميلويد (الزهايمر) ، وأمراض البريون (كورو وكروتزفيلد جاكوب) ، وأمراض جذرية الأكسجين (باركنسون والتصلب الجانبي الضموري) ، وأمراض التكرار الثلاثي (هنتنغتون) ، والخرف المرتبط بالإيدز. التقييم على أساس المشاركة في الصف وأوراق أسبوعية قصيرة. التسجيل محدود بـ 15 طلبًا مطلوبًا. قدم طلبك على https://forms.gle/UE8EcQi3jS6do31a7 بحلول الساعة 4:30 مساءً يوم الأربعاء 9 سبتمبر 2020.

BIO 152. التصوير: الفحص المجهري للضوء البيولوجي. 3 وحدات.

ستزود هذه الدورة المختبرية والمناقشات المكثفة المشاركين بالمعرفة النظرية والعملية لاستخدام تقنيات التصوير الناشئة القائمة على الفحص المجهري الضوئي. تشمل الموضوعات البصريات المجهرية ، وحدود الدقة ، وإضاءة كوهلر ، ومضان متحد البؤر ، وفوتون ثنائي ، و TIRF ، و FRET ، وتبييض ضوئي ، ودقة فائقة (SIM ، و STED ، و STORM / PALM) ، وتنقية الأنسجة / الوضوح / الفحص المجهري للورقة الضوئية ، و التصوير الخلوي. تتضمن التطبيقات استخدام مجسات الفلورسنت لتحليل التوطين الخلوي وديناميكيات نقل الخلايا الحية. سنستخدم فصلًا دراسيًا مقلوبًا للدورة التدريبية حيث سيشاهد الطلاب محاضرات iBiology قبل الفصل ، وسيتم استخدام وقت الفصل للمشاركة في مناقشة مستفيضة. يتضمن جزء المختبر استخدامًا مكثفًا في فئته للمجاهر في مرافق الفحص المجهري الأساسية CSIF و NMS.
مثل: MCP 222

BIO 153. علم الأعصاب الخلوي: إشارات الخلية والسلوك. 4 وحدات.

التفاعلات العصبية الكامنة وراء السلوك. الشروط: نفس 1 أو علم الأحياء الأساسي.
مثل: نفس 120

بيو 154. البيولوجيا العصبية الجزيئية والخلوية. 4 وحدات.

للطلاب الجامعيين المتقدمين. الآليات الخلوية والجزيئية في تنظيم ووظائف الجهاز العصبي. الموضوعات: توصيلات الدائرة العصبية ، هيكل المشبك ونقل المشابك ، نقل الإشارات في الجهاز العصبي ، الأنظمة الحسية ، الأساس الجزيئي للسلوك بما في ذلك التعلم والذاكرة ، التسبب الجزيئي للأمراض العصبية. ينصح بشدة: BioCore أو BIO 82 ، 83 ، 86 ، أو موافقة المدرب.

السيرة الذاتية 155. علم الأحياء الخلوي والنمائي للنباتات. 3 وحدات.

في هذه الدورة سوف نتعلم كيف يتم بناء النباتات على مستويات تنظيمية مختلفة من مستوى الخلية والأنسجة والعضو ونظام الأعضاء. سنتعرف أيضًا على الأساليب التجريبية المستخدمة في دراسة النباتات على هذه المستويات التنظيمية المختلفة وكيفية تفسير وتقييم التجارب التي تستخدم هذه الأساليب. تشمل المهارات ذات الصلة على نطاق واسع والتي سيتم صقلها في الدورة: تقييم الأدب في المقام الأول ، وتحديد الفجوات في المعرفة ، وصياغة أسئلة البحث وتصميم استراتيجيات تجريبية جديدة. المتطلبات الأساسية: سلسلة بيو 80.
مثل: BIO 255

السيرة الذاتية 156. حرائق الغابات في كاليفورنيا: بيئة حرائق الغابات وإدارتها وسياستها. 3 وحدات.

أصبح انتشار حرائق الغابات حدثًا سنويًا في جميع أنحاء ولاية كاليفورنيا مع آثار هائلة على كل من العالم الطبيعي والمجتمع البشري. من المرجح أن تتفاقم آثار هذه الحرائق مع زيادة تغير المناخ وتكثيف استخدام الأراضي. سيأخذ هذا الفصل منظورًا متعدد التخصصات حول حرائق الغابات بما في ذلك الآثار الفسيولوجية والبيئية والاجتماعية للحرائق نفسها ، فضلاً عن نتيجة سياسة حرائق الغابات على الطبيعة والبشر ، مع التركيز بشكل خاص على الإنصاف في التأثيرات عبر الطبقة والعرق. خطوط.

BIO 158. علم الأعصاب التنموي. 4 وحدات.

للطلاب الجامعيين المتقدمين والطلاب المشتركين. مبادئ تطور الجهاز العصبي من التحكم الجزيئي للتشكيل والتفاعلات بين الخلايا والعوامل الغذائية إلى مستوى الأنظمة العصبية ودور الخبرة في التأثير على بنية الدماغ ووظيفته. الموضوعات: الحث العصبي ونسب الخلايا ، تكوين الخلايا العصبية ، هجرة الخلايا العصبية ، تحديد المسار المحوري ، القضاء على المشبك ، دور النشاط ، الفترات الحرجة ، وتطور السلوك. المتطلبات: BIO 82، 83، 84، 86.
مثل: BIO 258

السيرة الذاتية 16. سرد قصص الحفظ: دورة تمهيدية لـ BOSP جنوب إفريقيا. وحدة 1.

يقتصر على الطلاب المقبولين في ندوة BOSP بجنوب إفريقيا في الخارج. من خلال 5 اجتماعات لورشة العمل ، سيقوم الطلاب بتطوير أفكار القصة وعرضها ، وتشكيل فرق يتفق فيها الكاتب والمصور على التعاون في قصة ما ، وإجراء بحث في الخلفية قبل المغادرة إلى جنوب إفريقيا.

بيو 160. علم الأحياء التنموي. 4 وحدات.

سيغطي هذا المقرر الآليات الجزيئية الكامنة وراء توليد أنواع وأنسجة متنوعة من الخلايا أثناء نمو الحيوانات الجنينية وما بعد الجنين. تشمل الموضوعات دور الاتصال الخلوي في التحكم في القرارات التنموية ، وتنظيم وتشكيل مجموعات كبيرة من الخلايا عبر إشارات المورفوجين ، وتحديد أنواع الخلايا الفردية ، ودور الخلايا الجذعية في التنمية. يركز المساق على المنطق التجريبي وأساليب البحث في علم الأحياء التنموي ويتضمن مناقشات للأوراق البحثية.

BIO 161. مختبر بيولوجيا الكائنات الحية. 4 وحدات.

هذا المختبر هو دورة تجربة بحثية حقيقية حيث يساهم الطلاب في البحث الأصلي في مجال بيولوجيا الكائن الحي. تركز الدورة هذا العام على فسيولوجيا الدفاعات الكيميائية في البرمائيات السامة من خلال ثلاث وحدات. في الوحدة الأولى التي تركز على الكيمياء ، سيعمل الطلاب مع بيانات الأيض لتفسير وتصور التواقيع الكيميائية لدفاع الضفدع السام. في الوحدة الثانية التي تركز على علم وظائف الأعضاء ، سيتعلم الطلاب تحليل اختلافات التعبير الجيني في الأنسجة المختلفة من بيانات تسلسل الحمض النووي الريبي. في الوحدة الثالثة التي تركز على البيئة ، سيتعلم الطلاب كيفية تحليل النظام الغذائي الحيواني واستراتيجيات البحث عن الطعام من خلال عملية التمثيل الغذائي. أخيرًا ، سيقوم الطلاب بدمج مجموعات البيانات هذه معًا للحصول على منظور عضوي على الدفاعات الكيميائية. سيعمل الطلاب بشكل تعاوني لتحليل البيانات وسيتعلمون توصيل نتائجهم بوضوح من خلال التنسيقات الشفوية والمكتوبة.

BIO 162. آليات تجديد الأنسجة. 3 وحدات.

تمتلك العديد من الكائنات الحية قدرة رائعة على إصلاح وتجديد الأعضاء والأنسجة التالفة. يستكشف هذا المقرر الآليات الخلوية والتنموية المستخدمة لتحقيق التجديد. سيتعلم الطلاب الآليات التنموية والخلوية الأساسية الكامنة وراء التكوين الأصلي للأعضاء أثناء التطور الطبيعي وكيف يتم تعديل هذه الآليات أثناء عملية التجديد. ستنظر الدورة أيضًا في كيفية استخدام معرفتنا الموسعة بآليات التجديد لتعزيز التجديد المفيد طبياً لدى البشر. ستشمل الدورة قراءة وتحليل مكثف للأدب الأساسي. المتطلبات الأساسية: BIO 86 و BIO160 أو بموافقة المدرب.

بيو 168. الاستكشافات في بيولوجيا الخلايا الجذعية. 3 وحدات.

دورة قائمة على المناقشة للطلاب الجامعيين المتقدمين. الغرض من هذه الدورة هو تعريف الطلاب بالموضوعات الرئيسية في بيولوجيا الخلايا الجذعية وتعزيز تنمية مهارات الكتابة العلمية القوية. سنراجع ونناقش بعض الأدبيات التاريخية والحالية في مجال الخلايا الجذعية. ستشمل الموضوعات الخلايا الجذعية الجنينية والبالغة ، وإعادة البرمجة الخلوية والخلايا الجذعية في الأمراض والطب التجديدي. سيقدم الطلاب ورقة بحثية حالية في مجال موضوع الخلايا الجذعية المفضل لديهم ويقومون بتكوين اقتراح بحث جديد. المتطلبات الأساسية: علم الأحياء أو جوهر علم الأحياء البشري أو BIO 82 ، 83 ، 86. يرضي WIM في علم الأحياء.

بيو 16N. إيكولوجيا الجزيرة. 3 وحدات.

الأفضلية للطلاب الجدد. كيف يفكر علماء البيئة في العالم. ينصب التركيز على جزر هاواي: الأصل والجيولوجيا والمناخ وتطور وبيئة النباتات والحيوانات والنظم البيئية. أسباب تركز الأنواع المهددة والمهددة بالانقراض في هاواي ، الأساس العلمي لحمايتها واستعادتها. كيف يمكن أن تساهم المعرفة بالنظم الإيكولوجية للجزر في علم البيئة وبيولوجيا الحفظ في القارات.

BIO 171. مبادئ التحكم في دورة الخلية. 3 وحدات.

التحليل الجيني للدوائر التنظيمية الرئيسية التي تحكم التحكم في انقسام الخلايا. توضيح للمبادئ الأساسية التي يمكن تعميمها على الدوائر البيولوجية الاصطناعية والطبيعية الأخرى. التركيز على التحكم في نمو الكائنات الحية النموذجية التي يمكن تتبعها ، والمفاتيح الكيميائية الحيوية التي لا رجعة فيها ، والمفاتيح الكيميائية الحيوية التي لا رجعة فيها ، والانقسام المزدوج للكروموسوم ، ونقاط التفتيش الخاصة بتلف الحمض النووي ، ونقاط تفتيش MAPK ، وتكوين واجهة دورة الخلية في مسار الخلية. تحليل الأدب الأساسي الكلاسيكي والحالي.
مثل: BIO 271، CSB 271

BIO 172. الديناميات البيئية: النظرية والتطبيقات. 4 وحدات.

نماذج السكان المهيكلة مع العمر والاختلاف المظهرى. نماذج السكان المتكاملة ونماذج التركيب والديناميكيات. اللياقة البدنية وعدم التجانس الديناميكي. أمثلة من التجمعات الطبيعية (الأغنام ، اليحمور ، النباتات ، الطيور). سيكون طلاب الدراسات العليا مسؤولين عن مجموعات مشاكل إضافية. الشروط: حساب التفاضل والتكامل والجبر الخطي.
مثل: BIO 272

بيو 173. البيولوجيا الكيميائية. 3 وحدات.

علم الأحياء الكيميائي هو نظام تكاملي يسعى إلى تطبيق الأدوات والأساليب الكيميائية لفهم علم الأحياء. سيعرف هذا المساق الطلاب على الطرق والأساليب المختلفة المستخدمة في هذا المجال ، مع التركيز على استخدام المنتجات الطبيعية والجزيئات الاصطناعية الصغيرة كمجسات للوظيفة البيولوجية. سيتم استخدام أمثلة محددة لتوضيح تداعيات البيولوجيا الكيميائية مع البيولوجيا الجزيئية والخلوية والنمائية. سيتم النظر بالتفصيل في التفاعل بين المرض واكتشاف الأدوية. المتطلبات الأساسية: BIO 83 و BIO 82 و / أو BIO 84.

BIO 174. تشريح الهيكل العظمي البشري. 5 وحدات.

دراسة الهيكل العظمي البشري (مثل علم العظام البشري) ، كما أنها تتناول تخصصات أخرى ، بما في ذلك الطب ، والطب الشرعي ، وعلم الآثار ، وعلم الإنسان القديم (التطور البشري). علم الأحياء الأساسي للعظام ، وعلم التشريح ، والتنمية ، مع التركيز على الفحص العملي وتحديد أجزاء الهيكل العظمي البشري ، وآثارها على تحديد عمر الفرد ، والجنس ، والأصل الجغرافي ، والحالة الصحية ، والتاريخ التطوري لجنسنا البشري. ثلاث ساعات من المحاضرات وثلاث ساعات على الأقل من الدراسة تحت الإشراف والمستقلة في المختبر كل أسبوع.
مثل: ANTHRO 175 ، ANTHRO 275 ، BIO 274 ، HUMBIO 180

BIO 175. السلوك الجماعي والذكاء الموزع. 3 وحدات.

يستكشف هذا المساق إمكانيات مشاريع بحثية للطلاب بناءً على العروض التقديمية لأبحاث أعضاء هيئة التدريس. سنغطي مجموعة واسعة من الموضوعات ضمن المجال العام للسلوك الجماعي ، الطبيعي والاصطناعي. سيقوم الطلاب بالبناء على عروض أعضاء هيئة التدريس لتطوير مقترحات للمشاريع المستقبلية.
مثل: SYMSYS 275

BIO 176. الأساس التنموي لتطور خطة جسم الحيوان. 4 وحدات.

يتم تصنيف الحيوانات في مجموعات ذات خصائص تنظيمية محددة مثل تعدد الخلايا ، وتنظيم المحور ، وتنظيم الجهاز العصبي ، بالإضافة إلى المستجدات المورفولوجية مثل العيون والأطراف والشرائح. يستكشف هذا المقرر الأصول التطورية والجزيئية للابتكارات الحيوانية هناك. عرضت سنوات بديلة. الشروط: لا يوجد.
مثل: BIO 276

بيو 177. تفاعل ميكروب النبات. 3 وحدات.

الأساس الجزيئي لتعايش النبات والتسبب في المرض. تشمل الموضوعات آليات التعرف والإشارة بين الميكروبات ومضيفي النبات ، مع أمثلة مثل دور الجزيئات الصغيرة ، والببتيدات المفرزة ، ومسارات نقل الإشارة في التفاعلات التكافلية أو المسببة للأمراض. تشمل القراءات أوراقًا تاريخية مع قراءات في الأدب المعاصر. المتطلبات الأساسية: علم الأحياء الأساسي ودورتان أو أكثر في القسم العلوي في علم الوراثة أو البيولوجيا الجزيئية أو الكيمياء الحيوية. يوصى به: علم الوراثة النباتية أو الكيمياء الحيوية للنبات.
مثل: BIO 277

BIO 178. أدب علم الأحياء الدقيقة. 3 وحدات.

للطلاب الجامعيين المتقدمين وطلاب الدراسات العليا في السنة الأولى. قراءة نقدية للأدبيات البحثية في علم الوراثة بدائية النواة والبيولوجيا الجزيئية ، مع تطبيقات خاصة لدراسة مسببات الأمراض البشرية الرئيسية. الأوراق الكلاسيكية والتأسيسية في المؤلفات الحديثة حول التسبب في الأمراض وعلم الوراثة والبيولوجيا الجزيئية عن مسببات الأمراض البكتيرية مثل السالمونيلا و / أو فيبريو و / أو يرسينيا. مناهج تجريبية متنوعة: الكيمياء الحيوية ، وعلم الجينوم ، والتسبب في المرض ، وبيولوجيا الخلية. المتطلبات الأساسية: يجب أن تكون تخصصات البيولوجيا المُعلن عنها قد أخذت BIO 82 (علم الوراثة) و BIO 83 (الكيمياء الحيوية). يقتصر التسجيل للطلاب الجامعيين على تخصصات علم الأحياء في السنة الإعدادية أو العليا. مصطلح مشترك أو دكتوراه. يمكن للطلاب في أقسام علوم الحياة الأساسية مثل علم الأحياء والهندسة الحيوية وعلم الوراثة التسجيل في BIO 278. تقدم بطلب على https://forms.gle/4NTtcBdWYMqRFvGc9.
مثل: BIO 278

السيرة الذاتية 179. التقييم المتكامل لخدمات النظام الإيكولوجي والمفاضلات. 1-3 وحدة.

يستكشف هذا المقرر علم تقدير الطبيعة من خلال مسارين متشابكين. أحدهما فيزيائي حيوي ، ويركز على الاعتماد البشري والتأثيرات على أنظمة دعم الحياة على الأرض. إذا تمت إدارتها بشكل جيد ، فإن الأراضي والمياه والتنوع البيولوجي تؤدي إلى تدفق الفوائد الحيوية التي تحافظ على حياة الإنسان وتحققها. تطير نحلة برية في مزرعة لتلقيح الخضروات أثناء سيرها. في الجوار ، تزيل الأراضي الرطبة المواد الكيميائية من جريان المزارع ، مما يحمي مصدر مياه الشرب. في الحدائق الواقعة على أطراف المدن ، يلعب الأطفال ويمشي البالغون ويتحدثون ، ويعزز تعرضهم للطبيعة النشاط البدني ويحسن الصحة العقلية. تساعد الأشجار في الحفاظ على مناخ ملائم محليًا وعالميًا. سنطور إطارًا وأدوات عملية لقياس تدفق الفوائد من الطبيعة إلى الناس. n المسار الثاني هو المسار الاجتماعي والاقتصادي والفلسفي ، والذي ينسج من خلال مفاهيم الرفاهية والتنمية البشرية والحفظ وأخلاقيات وتأثيراتهم. السعي وراء. سوف ننظر إلى الوراء ، إلى المستقبل ، وإلى الداخل ، مع الأخذ بنظرة عالمية والنظر في وجهات النظر الثقافية المتنوعة. ستكون مناقشاتنا في سياق جائحة COVID-19 ، وحركات العدالة العرقية والمساواة الاجتماعية والاقتصادية ، والجهود المبذولة لتمكين الناس والطبيعة من الازدهار في المدن والبلدان في جميع أنحاء العالم. . سنغوص في أمثلة من العالم الواقعي لنرى كيف يمكن للعلم أن يخبرنا لماذا وأين وكيف وكم يحتاج الناس إلى الطبيعة. سوف نتعلم أساسيات أدوات إنفيست (للتقييم المتكامل لخدمات النظم البيئية والمفاضلات) لتحديد فوائد الطبيعة ، والإنصاف في الوصول إلى هذه الفوائد ، وتحويل السياسة ، والتمويل ، والإدارة ، والممارسة للحفاظ عليها وتعزيزها. . n هذه الدورة مخصصة للطلاب المتنوعين والمتقدمين ، الذين لديهم اهتمامات في البحث والانتقال من العلوم إلى العمل من أجل عالم أكثر عدلاً واستدامة. يهدف المدربون إلى توفير فرصة ممتعة ومثمرة للتواصل عن بُعد ولكن مع الكثير من القلب وكذلك الدافع الفكري والالتزام ، مما يجلب التعاطف والمرونة ونأمل بعض الفكاهة في التحديات اليومية التي نواجهها جميعًا في مختلف طرق صعبة. المتطلبات الأساسية: مهارات نظم المعلومات الجغرافية (نظم المعلومات الجغرافية) الأساسية إلى المتوسطة ضرورية. سوف نساعد في ذلك ، ولكن لن نقوم بتدريس نظم المعلومات الجغرافية على وجه التحديد في الفصل. تشمل المهارات الأساسية ، على سبيل المثال: العمل مع البيانات النقطية والمتجهية والجداول النقطية ، وملفات الأشكال ، والجداول إلى نظام معلومات جغرافي ، وتغيير رموز البيانات النقطية وملفات الأشكال في جداول البيانات النقطية وملف الشكل المختار لتحرير GIS ، وفهم أنظمة الإحداثيات وكيفية إعادة طبقات المشروع تبحث في قيم الخلايا النقطية الفردية وتؤدي العمليات الحسابية الأساسية النقطية.
مثل: BIO 279

بيو 180. علم وظائف الأعضاء الميكروبية. 3 وحدات.

مقدمة في فسيولوجيا الميكروبات بما في ذلك التركيب الخلوي والنسخ والترجمة والنمو والتمثيل الغذائي وآليات مقاومة الإجهاد وتشكيل المجتمعات الميكروبية. ستتم تغطية هذه الموضوعات فيما يتعلق بتطور الحياة المبكرة على الأرض ، والنظم البيئية القديمة ، وتفسير سجل الصخور. مستحسن: علم الأحياء والكيمياء التمهيدية.
مثل: EARTHSYS 255، ESS 255، GEOLSCI 233A

بيو 182. نمذجة التطور الثقافي. 3 وحدات.

ندوة. النماذج الكمية لتطور السمات المنقولة اجتماعياً. معدلات تغيير السمات المكتسبة في السكان وأنماط التنوع الثقافي كدالة للابتكار ونقل الثقافة. التعلم في بيئات ثابتة ومتغيرة. السبل الممكنة للتطور المشترك للثقافة الجينية.
مثل: بيو 282

BIO 183. علم الوراثة السكانية النظري. 3 وحدات.

نماذج في علم الوراثة والتطور السكاني. الانتقاء ، الانجراف العشوائي ، الارتباط الجيني ، الهجرة ، زواج الأقارب ، وتأثيرها على تطور الترددات الجينية وبنية الكروموسوم. ترتبط النماذج بتطور تسلسل الحمض النووي. الشروط: حساب التفاضل والتكامل والجبر الخطي أو موافقة المعلم.
مثل: بيو 283

السيرة الذاتية 187. علم الأحياء الرياضي للسكان. 3 وحدات.

النماذج الرياضية في علم الأحياء السكانية ، في المجالات البيولوجية بما في ذلك الديموغرافيا والبيئة وعلم الأوبئة والتطور وعلم الوراثة. تشمل الأساليب الرياضية تقنيات في مجالات مثل التوافقية والمعادلات التفاضلية والأنظمة الديناميكية والجبر الخطي والاحتمالية والعمليات العشوائية. سلسلة الرياضيات 50 أو 60 مطلوبة ، ويوصى بشدة باستخدام اثنتين على الأقل من (BIO 81 ، BIO 82 ، BIO 85).
مثل: CME 187

BIO 193. مناهج متعددة التخصصات لبحوث صحة الإنسان. وحدة 1.

للطلاب الجامعيين المشاركين في برنامج Stanford ChEM-H للطلبة الجامعيين. ستعرض هذه الدورة للطلاب أسئلة وأساليب بحثية متعددة التخصصات تشمل الكيمياء والهندسة وعلم الأحياء والطب. ينصب التركيز على تطوير وممارسة مهارات القراءة والكتابة والعرض العلمي التي تهدف إلى استكمال البحث العملي في المختبر. سيقوم الطلاب بقراءة المقالات العلمية وكتابة مقترحات البحث وإعداد الملصقات وتقديم العروض التقديمية.
مثل: BIOE 193 ، CHEM 193 ، CHEMENG 193

بيو 196 أ. انعكاس كبير في علم الأحياء. 3 وحدات.

سلسلة دورات كابستون لكبار السن. مشاريع إبداعية ، عاكسة للذات وذات صلة علمية تم تصميمها وإنتاجها وعرضها على مدار ثلاثة أرباع. استكشف المحتوى العلمي ذي الاهتمام الشخصي من خلال الأشكال الإبداعية بما في ذلك على سبيل المثال لا الحصر الكتابة أو الموسيقى أو الفنون الجميلة أو الفنون المسرحية أو التصوير الفوتوغرافي أو الأفلام أو الوسائط الجديدة. سيصاحب العمل الإبداعي مقال مكتوب حول العملية الإبداعية والأهمية العلمية للموضوع المختار. قد يتم تضمين المشاريع المكتملة في محفظة إبداعية. القيد المطلوب في 196 أ ، ب ، ج. يرضي WIM في علم الأحياء. قد يتكرر للحصول على الائتمان.

بيو 196 ب. انعكاس كبير في علم الأحياء. 3 وحدات.

سلسلة دورات كابستون لكبار السن. مشاريع إبداعية ، عاكسة للذات وذات صلة علمية تم تصميمها وإنتاجها وعرضها على مدار ثلاثة أرباع. استكشف المحتوى العلمي ذي الاهتمام الشخصي من خلال الأشكال الإبداعية بما في ذلك على سبيل المثال لا الحصر الكتابة أو الموسيقى أو الفنون الجميلة أو الفنون المسرحية أو التصوير الفوتوغرافي أو الأفلام أو الوسائط الجديدة. سيصاحب العمل الإبداعي مقال مكتوب حول العملية الإبداعية والأهمية العلمية للموضوع المختار. قد يتم تضمين المشاريع المكتملة في محفظة إبداعية. القيد المطلوب في 196 أ ، ب ، ج. قد يتكرر للحصول على الائتمان.

بيو 196 ج. انعكاس كبير في علم الأحياء. 3 وحدات.

سلسلة دورات كابستون لكبار السن. مشاريع إبداعية ، عاكسة للذات وذات صلة علمية تم تصميمها وإنتاجها وعرضها على مدار ثلاثة أرباع.استكشف المحتوى العلمي ذي الاهتمام الشخصي من خلال الأشكال الإبداعية بما في ذلك على سبيل المثال لا الحصر الكتابة أو الموسيقى أو الفنون الجميلة أو الفنون المسرحية أو التصوير الفوتوغرافي أو الأفلام أو الوسائط الجديدة. سيصاحب العمل الإبداعي مقال مكتوب حول العملية الإبداعية والأهمية العلمية للموضوع المختار. قد يتم تضمين المشاريع المكتملة في محفظة إبداعية. القيد المطلوب في 196 أ ، ب ، ج. قد يتكرر للحصول على الائتمان.

السيرة الذاتية 198. القراءة الموجهة في علم الأحياء. 1-15 وحدة.

مرتبة بشكل فردي تحت إشراف أعضاء هيئة التدريس.

السيرة الذاتية 198X. القراءة الموجهة من خارج القسم. 1-15 وحدة.

مرتبة بشكل فردي تحت إشراف أعضاء هيئة التدريس. يقتصر رصيد العمل الذي يتم ترتيبه مع أعضاء هيئة التدريس خارج القسم على تخصصات علم الأحياء ويتطلب موافقة القسم. راجع https://biology.stanford.edu/academics/undergraduate-research/directed-reading للحصول على معلومات وعرائض. يمكن ان تتكرر للحصول على الائتمان.

بيو 199. مختبر أبحاث متقدم في علم الأحياء التجريبي. 1-15 وحدة.

البحث الفردي الذي يتم إجراؤه بالتنسيق مع المدربين في القسم. راجع http://biohonors.stanford.edu للحصول على معلومات حول رعاة الأبحاث والوحدات وائتمان البحث الصيفي. يمكن ان تتكرر للحصول على الائتمان.

بيو 199 واط. رسالة مرتبة الشرف العليا: كيف تكتب بشكل فعال عن البحث العلمي. 3 وحدات.

الهدف من هذا الفصل هو تدريب الطلاب على التواصل العلمي الفعال. إنه مصمم لخدمة الطلاب الذين يعملون في أبحاثهم الخاصة بدرجات الشرف العليا للمساعدة في تسهيل إكمال أطروحة مرتبة الشرف الخاصة بهم. ستشمل الموضوعات التي يتم تناولها عروض المصاعد ، وإنشاء وتحسين أقسام الأطروحة والعروض التقديمية الشفوية والملصقات في سياق المشاريع البحثية الفردية للطلاب. سيكون التركيز على بناء وممارسة المهارات من أجل 1) إكمال أطروحتك والملصق والعروض التقديمية و 2) اكتساب فهم مفاهيمي للكتابة العلمية الفعالة والتواصل الذي سيكون قابلاً للتطبيق على نطاق أوسع. يفي بمتطلبات WIM في علم الأحياء.

بيو 199X. مختبر أبحاث متقدم خارج القسم في علم الأحياء التجريبي. 1-15 وحدة.

البحث الفردي بالتنسيق مع مدربين من خارج القسم. يقتصر رصيد 199X على تخصصات البيولوجيا المعلنة ويتطلب موافقة الإدارة. راجع https://biology.stanford.edu/academics/undergraduate-research/research للحصول على معلومات حول رعاة الأبحاث والوحدات والالتماسات والمواعيد النهائية والائتمان للبحث الصيفي والأبحاث خارج جامعة ستانفورد. يمكن ان تتكرر للحصول على الائتمان.

بيو 19S. علم كوفيد -19. 4 وحدات.

تم تصميم هذه الدورة لمساعدة الطلاب على تطبيق المعرفة من دورة تمهيدية في علم الأحياء في المدرسة الثانوية على المشكلات المتعلقة بـ Covid-19. سوف ندرس كيف يهاجم فيروس SARS-CoV-2 جسم الإنسان ، وكيف يستجيب الجهاز المناعي ، وكيف يعمل الاختبار ، وكيف يمكن استخدام هذه المعلومات لتصميم الأدوية واللقاحات لوقف انتشار الفيروس. كان هناك انفجار في الأوراق البحثية والعديد من المزاعم في وسائل الإعلام حول الفيروس. سنقوم بتقييم الادعاءات بشكل نقدي واستكشاف العلوم الأساسية من خلال قراءة بعض الأوراق المختارة.

بيو 200. البيولوجيا الجزيئية المتقدمة: علم التخلق والبروتين. 5 وحدات.

الآليات الجزيئية التي تحكم النسخ المتماثل وإعادة التركيب والتعبير عن جينومات حقيقية النواة. الموضوعات: تكرار الحمض النووي ، إعادة تركيب الحمض النووي ، نسخ الجينات ، ربط الحمض النووي الريبي ، تنظيم التعبير الجيني ، تخليق البروتين ، وطي البروتين. المتطلبات المسبقة: جوهر علم الأحياء أو BIO 83 (ينصح بشدة بيو 82 و 86).
مثل: بيو 104

BIO 202. الإحصاء البيئي. 3 وحدات.

هذه الدورة مخصصة لطلاب الدراسات العليا (والطلاب الجامعيين المتقدمين في ظروف خاصة بموافقة المدربين) في علم الأحياء والعلوم البيئية ذات الصلة ، وهي مقدمة للطرق الإحصائية لتحليل البيانات البيئية ، باستخدام لغة البرمجة R. ستحتوي الدورة على محاضرات ومناقشات ، والمشاريع البحثية المستقلة باستخدام بيانات الطلاب الخاصة أو بيانات محاكاة أو بيانات متاحة للجمهور.

السيرة الذاتية 203. صحة الإنسان والكوكب. 2 وحدة.

اثنان من أكبر التحديات التي يتعين على البشرية مواجهتها - وهما تعزيز صحة الإنسان ووقف التدهور البيئي - مرتبطان ارتباطًا وثيقًا. يدرك المجال الناشئ لصحة الكواكب هذه الروابط المتداخلة ويعزز الحلول الإبداعية متعددة التخصصات التي تحمي صحة الإنسان وصحة النظم البيئية التي نعتمد عليها. من خلال سلسلة من المحاضرات ومناقشات دراسة الحالة ، سيطور الطلاب فهمًا متعمقًا لمفهوم "صحة الكواكب" وأسسه وأهدافه ومجالات العمل ذات الأولوية وأساليب التحقيق والتحديات المباشرة الأكثر صلة.
مثل: بيو 103

BIO 204. المرونة العصبية: من نقاط الاشتباك العصبي إلى السلوك. 3 وحدات.

يركز هذا المقرر الدراسي على المرونة العصبية من منظور واسع ، من الآلية الخلوية الجزيئية إلى مشاركتها في السلوك والأمراض. سيكون التركيز على: أ) الآليات الجزيئية والخلوية الكامنة وراء الأشكال المختلفة من المرونة العصبية ب) المرونة العصبية أثناء نمو الدماغ ج) المرونة العصبية في دماغ البالغين فيما يتعلق بالتعلم والذاكرة ، د) المرونة العصبية غير القادرة على التكيف في الأمراض التنكسية العصبية وإدمان المخدرات. تم تصميم هذه الدورة لدرجة الدكتوراه. طلاب من كل من برامج علم الأحياء وعلم الأعصاب. مفتوح للطلاب الجامعيين المتقدمين بموافقة المعلم.

السيرة الذاتية 208. اللغة الإسبانية في العلوم / العلوم باللغة الإسبانية. 2 وحدة.

لطلاب الدراسات العليا والجامعية المهتمين بالعلوم الطبيعية واللغة الإسبانية. سيكتسب الطلاب القدرة على التواصل باللغة الإسبانية باستخدام اللغة العلمية وسيعززون قدرتهم على قراءة المؤلفات العلمية المكتوبة باللغة الإسبانية. التركيز على تطوير العلوم في البلدان أو المناطق الناطقة بالإسبانية. يتم إجراء الدورة باللغة الإسبانية وهي مخصصة للطلاب الذين يسعون للحصول على درجات علمية في العلوم ، ولا سيما التخصصات مثل علم البيئة وعلوم البيئة والاستدامة وإدارة الموارد والأنثروبولوجيا وعلم الآثار.
مثل: EARTHSYS 207، LATINAM 207

بيو 210. الجينوم المنظم بالكروماتين. 3 وحدات.

الحفاظ على الجينوم شرط أساسي للحياة. في حقيقيات النوى ، ترتبط جميع العمليات المقولبة للحمض النووي ارتباطًا وثيقًا ببنية الكروماتين ووظيفته. يستكشف هذا المقرر الدراسي التنظيم اللاجيني والكروماتين للعمليات الخلوية المتعلقة بالشيخوخة والسرطان وتعدد الخلايا الجذعية والتوازن الأيضي والتطور. تدمج مادة الدورة الأدبيات الحالية مع المراجعة التأسيسية لتعديلات الهيستون وتكوين النوكليوزوم في الوراثة اللاجينية والنسخ والتكرار وانقسام الخلايا واستجابات تلف الحمض النووي. المتطلبات المسبقة: BIO 41 أو BIO 83 أو موافقة المعلم.
مثل: بيو 110

بيو 211. البروتينات: من المبادئ الأساسية للشيخوخة والتنكس العصبي. 3 وحدات.

يظهر التحكم في استتباب البروتين الخلوي ، والذي يُطلق عليه أيضًا Proteostasis ، باعتباره العملية الخلوية المركزية التي تتحكم في استقرار البروتين ووظائفه ومراقبة جودته ، وهو أمر أساسي لفهمنا لمجموعة واسعة من الأمراض. تحافظ آلية البروتينات على وظيفة البروتينات غير المستقرة والمتحولة التي تساعد في تحلل البروتينات التالفة والمجمعة وتراقب صحة البروتين ، وتعديله استجابة للضغوط البيئية أو الأيضية. يرتبط اختلال البروتينات بأمراض تتراوح من التنكس العصبي إلى الشيخوخة. n سيقدم هذا الفصل للطلاب الاكتشافات المتطورة والمثيرة في هذا المجال من خلال العروض التقديمية التي يقدمها القادة في هذا المجال ومناقشات الأدبيات الأولية التي توضح كيف يمكن الاستفادة من فهم الانصمام البروتيني لفهم العمليات البيولوجية الأساسية ، مثل التطور والشيخوخة وللتخفيف من مجموعة واسعة من الأمراض.

بيو 214. بيولوجيا الخلية المتقدمة. 4 وحدات.

للدكتوراه. الطلاب. تم تدريسها من الأدبيات الحالية حول بنية الخلية ووظيفتها وديناميكياتها. تشمل الموضوعات ظواهر الخلايا المعقدة مثل انقسام الخلايا ، وموت الخلايا المبرمج ، والإشارات ، والتجزئة ، والنقل والاتجار ، والحركة والالتصاق ، والتمايز. القراءة الأسبوعية للأوراق الحالية من الأدب الابتدائي. يمكن للطلاب الجامعيين المتقدمين المشاركة بإذن من مدير الدورة.
مثل: BIOC 224 ، MCP 221

بيو 220. بيولوجيا بدائية النواة - نهج كمي. 3 وحدات.

للعيش ، يجب على الميكروبات أن تنسق بنجاح العمليات الخلوية المختلفة ، بما يتماشى مع الموارد المتاحة وما تتطلبه الظروف البيئية. يقدم هذا المقرر الدراسي التطورات الكمية في فهم هذا التنسيق وعواقبه عبر المقاييس: من البيولوجيا الجزيئية عبر النمو إلى ديناميكيات السكان والبيئة. جلسات المعمل الجاف تكمل المحاضرات لتقديم الأساليب الحسابية. سيتم تقديم أدوات التحليل القائمة على بايثون. متطلب: رياضيات 51 أو رياضيات 19 ، 20 ، 21. موصى به: علم الأحياء الدقيقة (مثل BIO 62 أو 162) ودورات البيولوجيا الجزيئية / الكيمياء الحيوية / علم الوراثة (على سبيل المثال BIO 82 أو 83) والإلمام الأساسي بالشفرات.
مثل: بيو 120

بيو 221. علم الأورام. 3 وحدات.

مسح جامعي متقدم لعلم الطيور ، وتعريف الطلاب ببيولوجيا الطيور وإعطائهم أدوات لاستخدام الطيور كنظم نموذجية للبحث. ستشمل الموضوعات تطور الطيور وعلم وظائف الأعضاء والتكيفات والسلوك والبيئة. ركز طوال الوقت على تحديد طيور كاليفورنيا والتطبيقات على قضايا الحفاظ على الطيور الحالية. ستشمل الدورة محاضرات ومكونًا ميدانيًا سيعرض الطلاب على تقنيات بحث الطيور القياسية مثل الخطأ في الشبكة ، والنطاقات ، واستطلاعات عدد النقاط. المتطلبات المسبقة: BIO 81 أو BIO 105 أو موافقة المعلم.
مثل: BIO 121

بيو 222. استكشاف الدوائر العصبية. 3 وحدات.

ندوة. يركز هذا المقرر الدراسي على منطق كيفية معالجة الدوائر العصبية للمعلومات وسلوك التحكم ، وكذلك كيفية تجميع الدوائر العصبية أثناء التطور وتعديلها بالتجربة. يتم التركيز على الأدبيات الأولية. تشمل الموضوعات: الخلايا العصبية كوحدات معالجة المعلومات ، الدوائر البسيطة والمعقدة الكامنة وراء معالجة المعلومات الحسية ، والتحكم في المحركات ، والوظيفة المعرفية وتطوير ومرونة الدوائر العصبية. يمكن للطلاب الجامعيين المتقدمين وطلاب الدراسات العليا الذين لديهم خلفية في العلوم الفيزيائية والهندسة والبيولوجيا التقدم للتسجيل. التسجيل عن طريق التطبيق فقط. موصى به: خلفية في علم الأعصاب.

بيو 223. الديناميات العشوائية وغير الخطية. 3 وحدات.

التحليل النظري للعمليات الديناميكية: الأنظمة الديناميكية ، والعمليات العشوائية ، والديناميات الزمانية المكانية. الدوافع والتطبيقات من علم الأحياء والفيزياء. يتم التركيز على الأساليب بما في ذلك الأساليب النوعية ، والتقارب ، والتحليل متعدد المقاييس. المتطلبات الأساسية: المعادلات التفاضلية العادية والجزئية ، والتحليل المعقد ، والاحتمالات أو الفيزياء الإحصائية.
مثل: أبفيز 223 ، بيو 213 ، فيزياء 223

بيو 226. مقدمة في الفيزياء الحيوية. 3-4 وحدات.

دورة أساسية مناسبة للطلاب الجامعيين المتقدمين وطلاب الدراسات العليا الذين لديهم معرفة مسبقة بحساب التفاضل والتكامل ودورة في الفيزياء بالكلية. مقدمة لكيفية تقديم المبادئ الفيزيائية رؤى ثاقبة في علم الأحياء الحديث ، فيما يتعلق بالتنظيم الهيكلي والديناميكي والوظيفي للأنظمة البيولوجية. تشمل الموضوعات أدوار الطاقة الحرة ، والانتشار ، والقوى الدافعة الكهربائية ، وديناميات عدم التوازن ، والمعلومات في العمليات البيولوجية الأساسية.
مثل: APPPHYS 205 ، BIO 126

BIO 227. أسس إيكولوجيا المجتمع. 3 وحدات.

مناقشة الأوراق الكلاسيكية في علم البيئة المجتمعية (فوربس ، كليمنتس ، غليسون ، غرينيل ، ليندمان ، بريستون ، إلتون ، هاتشينسون ، ماي ، ماك آرثر ، أودوم ، كونيل ، باين ، تيلمان ، إلخ) والأوراق المعاصرة حول الموضوعات ذات الصلة ، لتطوير وجهات النظر التاريخية لفهم القضايا الحالية وتحديد الاتجاهات المستقبلية. الشرط الأساسي للطلاب الجامعيين: موافقة المعلم.

BIO 228. تطور النظم الإيكولوجية الأرضية. 4 وحدات.

ماذا ومتى وأين وكيف نعرفه فيما يتعلق بالحياة على الأرض عبر الزمن. تمت تغطية جميع النباتات الأحفورية والفطريات واللافقاريات والفقاريات (نعم ، الديناصورات) ، بما في ذلك كيفية تفاعل كل هذه المكونات مع بعضها البعض ومع تغير المناخ ، والانجراف القاري ، وتكوين الغلاف الجوي ، والاضطرابات البيئية مثل التجلد والانقراض الجماعي. تتضمن الدورة كلاً من المحاضرات ومكونات المختبر. يُتوقع من طلاب الدراسات العليا المسجلين على مستوى 200 كتابة ورقة بحثية ، ولكن يمكنهم إلغاء الاشتراك في بعض المعامل عند الاقتضاء.
مثل: BIO 148 ، EARTHSYS 128 ، GEOLSCI 128 ، GEOLSCI 228

السيرة الذاتية 229. أساسيات وحدود في بيولوجيا النبات. 3 وحدات.

ستكون هذه الدورة بمثابة كتاب تمهيدي لجميع مستويات الخريجين ، والمشتركين ، والطلاب الجامعيين من المستوى الأعلى المهتمين بالتعرف على الجوانب الأساسية لبيولوجيا النبات ، وأحدث التطورات في الأدوات والتقنيات والنظريات التي تربط العلوم الأساسية بالعلوم الترجمية. وتطبيقات حل التحديات المجتمعية الكبرى في الحاضر والمستقبل. بالإضافة إلى ذلك ، ستعمل هذه الدورة على تقديم اتساع نطاق البحوث النباتية في الحرم الجامعي وتساعد في ترسيخ مجموعة من الطلاب المهتمين ببيولوجيا النبات.
مثل: بيو 129

بيو 231. نمذجة المعادلات الهيكلية لعلماء البيئة. وحدة 1.

سنركز على تعلم استخدام نمذجة المعادلات الهيكلية (SEM) كأسلوب للاستدلال البيئي. سيتضمن الفصل محاضرات قصيرة ومناقشات ورقية وورش عمل حول البرمجة عبر محركات البحث (SEM) في R. ستستمر الاجتماعات بشكل عام 60 دقيقة فقط.

بيو 232. مختبر التصوير المتقدم في الفيزياء الحيوية. 4 وحدات.

المختبر والمحاضرات. الفحص المجهري والتصوير المتقدمان ، مع التركيز على الخبرة العملية بأحدث التقنيات. يقوم الطلاب ببناء وتشغيل جهاز العمل. تشمل الموضوعات البصريات المجهرية ، وإضاءة كوهلر ، وآليات توليد التباين (المجال الساطع / المظلم ، والتألق ، وتباين الطور ، وتباين التداخل التفاضلي) ، وحدود الدقة. تختلف الموضوعات المختبرية حسب السنة ، ولكنها تشمل تألق جزيء واحد ، ونقل طاقة الرنين الفلوري ، والفحص المجهري متحد البؤر ، والفوتون المجهري ، والتنظير المجهري ، والمحاصرة البصرية. تسجيل محدود. موصى به: الفيزياء الأساسية ، وبيولوجيا الخلية الأساسية ، وموافقة المدرب.
مثل: APPPHYS 232، BIO 132، BIOPHYS 232، GENE 232

بيو 234. بيولوجيا الحفظ: منظور أمريكا اللاتينية. 3 وحدات.

مبادئ وتطبيق علم الحفاظ على التنوع البيولوجي. من الناحية المفاهيمية ، تم تصميم هذه الدورة لاستكشاف المكونات الرئيسية ذات الصلة بحفظ التنوع البيولوجي ، كما يتضح من منطقة أمريكا اللاتينية. ومع ذلك ، يجب أن تكون الأطر والمبادئ المفاهيمية قابلة للتطبيق بشكل عام ، وتوفر رؤى لجميع مناطق العالم. يُتوقع من جميع الطلاب إجراء تمرين بحث في الأدب يؤدي إلى تقرير مكتوب ، يتناول موضوعًا من اختيارهم ، مستمدًا من أي من الموضوعات التي تمت مناقشتها في الفصل. المتطلبات المسبقة: BIO 101 أو BIO 43 أو HUMBIO 2A أو BIO 81 و 84 أو موافقة المدرب.
مثل: BIO 144 ، HUMBIO 112

بيو 235. علم الأعصاب. 3 وحدات.

علم الأعصاب هو دراسة الأساس العصبي لسلوك الحيوان. سوف نستكشف الآليات العصبية للسلوكيات الطبيعية في مجموعة متنوعة من الكائنات الحية. تشمل الموضوعات الآليات الجزيئية لوظيفة الجهاز العصبي ، والتفاعلات بين المفترس والفريسة ، والسلوك الاجتماعي ، والسلوكيات المعقدة الأخرى مثل التعلم والذاكرة ، والتنقل ، والتواصل. يشمل التقييم عروض تقديمية شفوية جماعية للأوراق العلمية ، ومطالبات أسبوعية بالواجبات المنزلية التي تؤدي إلى اقتراح منحة صغيرة ، والكتابة العلمية والتواصل مع الجمهور الأوسع حول موضوع علم الأعصاب. المتطلبات المسبقة: BIO 84.
مثل: بيو 135

بيو 236. التطور الكلي. 3 وحدات.

ستركز الدورة على التطور الكبير للحيوانات. سنستكشف كيف ساهم علم الأحياء القديمة وعلم الأحياء التطوري / علم الجينوم في فهمنا لأصول الحيوانات ، وكيف شكلت أنماط التطور والانقراض تنوع أشكال الحيوانات التي نلاحظها اليوم.
مثل: BIO 136 ، GEOLSCI 136 ، GEOLSCI 236

بيو 238. خدمات النظام الإيكولوجي: الحدود في علم تقدير الطبيعة. 3 وحدات.

يستكشف هذا المقرر الدراسي علم تقدير الطبيعة ، بدءًا من أصولها التاريخية ثم التركيز الأساسي على تطورها الحديث وحدودها. الهدف الرئيسي من الدورة هو تمكين البحث الجديد والتطبيقات الواقعية لأدوات ونهج إنفيست (التقييم المتكامل لخدمات النظام الإيكولوجي والمفاضلات). سنناقش الترابط بين الناس والطبيعة وحدود البحث الرئيسية ، كما هو الحال في مجالات التنوع البيولوجي ، والمرونة ، وصحة الإنسان ، والتخفيف من حدة الفقر ، والتنمية المستدامة. العلم الذي سنستكشفه في خدمة القرارات ، وسنستخدم أمثلة من الحياة الواقعية لتوضيح سبب أهمية هذا العلم لإعلامنا لماذا وأين وكيف ومقدار الناس بحاجة إلى الطبيعة. المتطلبات المسبقة. مهارات نظم المعلومات الجغرافية الأساسية إلى المتوسطة مطلوبة (بما في ذلك العمل مع تحميل البيانات النقطية والمتجه والجداول وتحرير البيانات النقطية وملفات الأشكال والجداول في فهم نظم الإحداثيات وفهم نظم المعلومات الجغرافية وإجراء العمليات الحسابية الأساسية النقطية).
مثل: بيو 138 ، إيرثسيس 139 ، إيرثسيس 239

بيو 239. المملكة الخفية - تطور وبيئة وتنوع الفطريات. 4 وحدات.

تعتبر الفطريات مكونات مهمة ، ولكنها غالبًا ما تكون مخفية ، في المحيط الحيوي. إنهم ينظمون التحلل ، وهم شركاء أساسيون في تعايش النبات ويؤثرون بشدة على الزراعة والاقتصاد. سيستكشف الطلاب العالم الرائع لبيولوجيا الفطريات والبيئة والتطور من خلال المحاضرات والمختبرات والتمارين الميدانية والرحلات الميدانية يوم السبت التي ستوفر الخبرات التقليدية والجزيئية في جمع الفطريات المتنوعة وتحليلها واستخدامها الصناعي. سيختار الطلاب مكانًا بيئيًا ، ويجمعون ويحددون الفطريات المقيمة ، ويفترضون حول علاقتهم المجتمعية. المتطلب السابق: BIO 81، 85 موصى به.
مثل: بيو 115

BIO 240. علم البيئة والكيمياء الحيوية. 3 وحدات.

مقدمة لبيئة النظام البيئي والكيمياء الحيوية الأرضية. ستركز هذه الدورة على ديناميكيات الكربون والعناصر البيولوجية الأساسية الأخرى في نظام الأرض ، على المقاييس المكانية من المحلية إلى العالمية. المتطلبات: علم الأحياء 117 ، أنظمة الأرض 111 ، أو مكانة الخريجين.
مثل: BIO 147، EARTHSYS 147، EARTHSYS 247

بيو 244. أساسيات التطور الجزيئي. 4 وحدات.

استنتاج العمليات التطورية الجزيئية الرئيسية من تسلسل الحمض النووي والبروتين. تشمل الموضوعات الانجراف الجيني العشوائي ، والنماذج الموحدة ، والتأثيرات والاختبارات الخاصة بالانتقاء الطبيعي ، والتأثيرات المجمعة للربط والانتقاء الطبيعي ، وتحيز الكودون ، وتطور الجينوم. المتطلبات الأساسية: علم الأحياء الأساسي أو BIO 82 أو 85 أو خريج يقف في أي قسم ، وموافقة المعلم.
مثل: بيو 113

بيو 245. علم البيئة وتطور سلوك الحيوان. 3 وحدات.

المنظورات البيئية والتطورية لسلوك الحيوان ، مع التركيز على السلوك الاجتماعي والجماعي. هذه دورة قائمة على المشاريع في شكل محاضرة / ندوة. ستستند الندوات إلى مناقشة مقالات المجلات. مشاريع بحثية مستقلة عن سلوك الحيوانات في الحرم الجامعي. المتطلبات الأساسية: علم الأحياء أو جوهر علم الأحياء البشري أو BIO 81 و 85 أو موافقة مدرس الأحياء / ES 30. يوصى به: الإحصائيات.
مثل: بيو 145

BIO 247. النهج الجينومية لدراسة الأمراض التي تصيب الإنسان. 3 وحدات.

سيغطي هذا المقرر الدراسي مجموعة من الأساليب الجينية والجينومية لدراسة الاختلاف الظاهري للإنسان والمرض. سنناقش الأساس الجيني للأمراض المندلية والمعقدة ، بالإضافة إلى التطبيقات السريرية بما في ذلك اختبارات ما قبل الولادة ، وتشخيصات الأطفال والسرطان. ستتضمن الدورة محاضرات بالإضافة إلى القراءة النقدية ومناقشة الأدبيات الأولية. المتطلب السابق: 82 بيو أو ما يعادلها. مفتوح للطلاب الجامعيين المتقدمين.
مثل: GENE 247

بيو 249. البيولوجيا العصبية للنوم. 4 وحدات.

الكيمياء العصبية والفيزيولوجيا العصبية للتغيرات في نشاط الدماغ والوعي الواعي المرتبط بالتغيرات في حالة النوم / الاستيقاظ. الظواهر السلوكية والبيولوجية العصبية بما في ذلك تنظيم النوم ، واستتباب النوم ، وإيقاعات الساعة البيولوجية ، واضطرابات النوم ، ووظيفة النوم ، والبيولوجيا الجزيئية للنوم. nn تفضيل لكبار السن وطلاب الدراسات العليا. nn يقتصر التسجيل على 16.
مثل: BIO 149، HUMBIO 161، PSYC 149، PSYC 261

بيو 24N. رؤى الجنة: تصميم حديقة. 3 وحدات.

من خلال قراءات الأدب والرحلات الميدانية إلى الحدائق المحلية ، تعلم مبادئ وجماليات تصاميم الحدائق الكلاسيكية: عصر النهضة الإيطالية ، والتعليم النباتي ، والكوخ الياباني ، والإنجليزي ، وغيرها. صمم رؤية شخصية عن الجنة مع تفاصيل عن الأنواع ، والتأثير البصري والرائحي ، وخصائص المياه ، والصلب. افتح عينيك على تقدير جديد لعالم النباتات وتعلم بعض علم وظائف الأعضاء وعلم الوراثة الذي يشرح الخصائص المحددة للأنواع الفردية.

BIO 251. الديناميات التطورية الكمية وعلم الجينوم. 3 وحدات.

لقد غذت ثورة علم الجينوم دفعة متجددة لنمذجة العمليات التطورية من الناحية الكمية. سيوفر هذا المساق مقدمة للنمذجة التطورية الكمية من خلال عدسة الفيزياء الإحصائية. ستتنوع الموضوعات من أسس علم الوراثة النظري للسكان إلى التطور التجريبي للميكروبات المختبرية. سيشمل عمل الدورة التدريبية مزيجًا من الرياضيات بالقلم الرصاص والورق ، وكتابة عمليات محاكاة الكمبيوتر الأساسية ، وتنزيل بيانات تسلسل الحمض النووي من مجموعات البيانات المنشورة ومعالجتها. هذه الدورة مخصصة لطلاب المستوى الأعلى في الفيزياء والرياضيات الذين ليس لديهم خلفية في علم الأحياء ، وكذلك طلاب الأحياء الذين يشعرون بالراحة تجاه المعادلات التفاضلية والاحتمالات.
مثل: APPPHYS 237

BIO 254. علم الأعصاب الجزيئي والخلوي. 3-5 وحدات.

لطلاب الدراسات العليا. يتضمن محاضرات عن BIO 154. الآليات الخلوية والجزيئية في تنظيم ووظائف الجهاز العصبي. الموضوعات: توصيلات الدائرة العصبية ، هيكل المشبك ونقل المشابك ، نقل الإشارات في الجهاز العصبي ، الأنظمة الحسية ، الأساس الجزيئي للسلوك بما في ذلك التعلم والذاكرة ، التسبب الجزيئي للأمراض العصبية.
مثل: NBIO 254

BIO 255. البيولوجيا الخلوية والنمائية للنباتات. 3 وحدات.

في هذه الدورة سوف نتعلم كيف يتم بناء النباتات على مستويات تنظيمية مختلفة من مستوى الخلية والأنسجة والعضو ونظام الأعضاء. سنتعرف أيضًا على الأساليب التجريبية المستخدمة في دراسة النباتات على هذه المستويات التنظيمية المختلفة وكيفية تفسير وتقييم التجارب التي تستخدم هذه الأساليب. تشمل المهارات ذات الصلة على نطاق واسع والتي سيتم صقلها في الدورة: تقييم الأدب في المقام الأول ، وتحديد الفجوات في المعرفة ، وصياغة أسئلة البحث وتصميم استراتيجيات تجريبية جديدة. المتطلبات الأساسية: سلسلة بيو 80.
مثل: BIO 155

بيو 258. علم الأعصاب التنموي. 4 وحدات.

للطلاب الجامعيين المتقدمين والطلاب المشتركين. مبادئ تطور الجهاز العصبي من التحكم الجزيئي للتشكيل والتفاعلات بين الخلايا والعوامل الغذائية إلى مستوى الأنظمة العصبية ودور الخبرة في التأثير على بنية الدماغ ووظيفته. الموضوعات: الحث العصبي ونسب الخلايا ، تكوين الخلايا العصبية ، هجرة الخلايا العصبية ، تحديد المسار المحوري ، القضاء على المشبك ، دور النشاط ، الفترات الحرجة ، وتطور السلوك. المتطلبات: BIO 82، 83، 84، 86.
مثل: BIO 158

السيرة الذاتية 25Q. التليف الكيسي: من اللغز الطبي إلى قصة نجاح الطب الدقيق. 3 وحدات.

سوف يستكشف الفصل التليف الكيسي (CF) ، وهو المرض الوراثي القاتل الأكثر انتشارًا في الولايات المتحدة ، باعتباره وحدة علمية وطبية. من خلال قراءة ومناقشة الأدبيات الطبية والعلمية ، سنتناول أسئلة تشمل: كيف زاد متوسط ​​العمر المتوقع مع التليف الكيسي من أسابيع إلى عقود دون فهم آلية المرض؟ لماذا المرض منتشر جدا؟ هل هناك ميزة لكونك شركة نقل؟ هل التليف الكيسي مرض واحد أم سلسلة متصلة من التباين الفسيولوجي أم- ما هو المرض؟ كيف أدى البحث في التليف الكيسي إلى اكتشاف السبب الكامن وراء معظم الأمراض الوراثية الأخرى أيضًا؟ من خلال القراءة النقدية للأدبيات العلمية والطبية ، والمناقشات الصفية ، والرحلات الميدانية ، والاجتماعات مع المستشارين الوراثيين ، ومقدمي الرعاية ، والمرضى ، والأطباء والباحثين ، سنعمل على بناء فهم عميق لهذا المرض ، من الأساس الكيميائي الحيوي إلى الجدل الحالي حوله. الآليات المسببة للأمراض واستراتيجيات العلاج وأخلاقيات واقتصاديات الاختبارات الجينية وتكاليف الأدوية الفلكية.

BIO 267. الآليات الجزيئية لمرض التنكس العصبي. 4 وحدات.

وباء الاضطرابات التنكسية العصبية مثل مرض الزهايمر ومرض باركنسون الناجم عن شيخوخة السكان. الآليات الجينية والجزيئية والخلوية. الجوانب السريرية من خلال عروض الحالة. nnn هذا الفصل مفتوح لكل من طلاب الدراسات العليا والجامعيين ، ولكنه يتطلب خلفيات كافية في علم الوراثة على مستوى الكلية وبيولوجيا الخلية والكيمياء الحيوية. يتعين على الطلاب الجامعيين المهتمين الاتصال بمدير الدورة أولاً.
مثل: GENE 267 ، NENS 267

BIO 268. طرق التعلم الإحصائي والآلي لعلم الجينوم. 3 وحدات.

مقدمة في الأساليب الإحصائية والحسابية لعلم الجينوم. تشمل موضوعات العينة: تعظيم التوقعات ، ونموذج ماركوف المخفي ، وسلسلة ماركوف مونت كارلو ، وتعلم المجموعات ، والنماذج الرسومية الاحتمالية ، وطرق النواة وغيرها من نماذج التعلم الآلي الحديثة. المبررات والتقنيات الموضحة بالتطبيقات الحالية المستخدمة في علم الوراثة السكانية ، وترابط الأمراض ، ودراسات الجينوميات التنظيمية الوظيفية. يتضمن التدريس محاضرات ومناقشة قراءات من الأدب الابتدائي. تتطلب الواجبات المنزلية والمشاريع تنفيذ بعض الخوارزميات واستخدام مجموعات الأدوات الموجودة لتحليل مجموعات البيانات الجينومية.
مثل: BIOMEDIN 245، CS 373، STATS 345

BIO 271. مبادئ التحكم في دورة الخلية. 3 وحدات.

التحليل الجيني للدوائر التنظيمية الرئيسية التي تحكم التحكم في انقسام الخلايا. توضيح للمبادئ الأساسية التي يمكن تعميمها على الدوائر البيولوجية الاصطناعية والطبيعية الأخرى. التركيز على التحكم في نمو الكائنات الحية النموذجية التي يمكن تتبعها ، والمفاتيح الكيميائية الحيوية التي لا رجعة فيها ، والمفاتيح الكيميائية الحيوية التي لا رجعة فيها ، والانقسام المزدوج للكروموسوم ، ونقاط التفتيش الخاصة بتلف الحمض النووي ، ونقاط تفتيش MAPK ، وتكوين واجهة دورة الخلية في مسار الخلية. تحليل الأدب الأساسي الكلاسيكي والحالي.
مثل: BIO 171، CSB 271

BIO 272. الديناميات البيئية: النظرية والتطبيقات. 4 وحدات.

نماذج السكان المهيكلة مع العمر والاختلاف المظهرى. نماذج السكان المتكاملة ونماذج التركيب والديناميكيات. اللياقة البدنية وعدم التجانس الديناميكي. أمثلة من التجمعات الطبيعية (الأغنام ، اليحمور ، النباتات ، الطيور). سيكون طلاب الدراسات العليا مسؤولين عن مجموعات مشاكل إضافية. الشروط: حساب التفاضل والتكامل والجبر الخطي.
مثل: BIO 172

بيو 273 أ. الأحياء الدقيقة البيئية I. 3 وحدات.

أساسيات علم الأحياء الدقيقة والكيمياء الحيوية. المبادئ البيوكيميائية والفيزيائية الحيوية للتفاعلات البيوكيميائية وعلم الطاقة وآليات الحفاظ على الطاقة. تنوع الهدم الميكروبي ، وتدفق المواد العضوية في الطبيعة: دورة الكربون ، والدورات البيوجيوكيميائية. علم وظائف الأعضاء البكتيري ، وعلم الوراثة ، وبيئة الميكروبات في التربة والرواسب البحرية ، والالتصاق البكتيري ، وتكوين الأغشية الحيوية. الميكروبات في تحلل الملوثات. المتطلبات الأساسية: CHEM 33 ، CHEM 121 (سابقًا CHEM 35) ، و BIOSCI 83 ، CHEMENG 181 ، أو ما يعادلها.
مثل: CEE 274A، CHEMENG 174، CHEMENG 274

بيو 273 ب. أنظمة الطاقة الحيوية الميكروبية. 3 وحدات.

مقدمة في مسارات التمثيل الغذائي الميكروبي ومنطق المسار مع التركيز بشكل خاص على أنظمة الطاقة الحيوية الميكروبية. يركز الجزء الأول من الدورة على المبادئ الأيضية والكيميائية الحيوية للمسارات ، في حين أن الجزء الثاني موجه بشكل أكثر تحديدًا نحو استخدام هذه المعرفة لفهم الأنظمة الحالية وتصميم أنظمة الطاقة الحيوية الميكروبية المبتكرة للوقود الحيوي والمصفاة الحيوية والتطبيقات البيئية. هناك أيضًا تركيز على الآثار المترتبة على إعادة توجيه الطاقة وتقليل المعادلات من أجل لياقة الكائن الحي وبيئته. المتطلبات الأساسية: CHEMENG 174 أو 181 والكيمياء العضوية أو ما يعادلها.
مثل: CEE 274B، CHEMENG 456

BIO 274. تشريح الهيكل العظمي البشري. 5 وحدات.

دراسة الهيكل العظمي البشري (مثل علم العظام البشري) ، كما أنها تتناول تخصصات أخرى ، بما في ذلك الطب ، والطب الشرعي ، وعلم الآثار ، وعلم الإنسان القديم (التطور البشري). علم الأحياء الأساسي للعظام ، وعلم التشريح ، والتنمية ، مع التركيز على الفحص العملي وتحديد أجزاء الهيكل العظمي البشري ، وآثارها على تحديد عمر الفرد ، والجنس ، والأصل الجغرافي ، والحالة الصحية ، والتاريخ التطوري لجنسنا البشري. ثلاث ساعات من المحاضرات وثلاث ساعات على الأقل من الدراسة تحت الإشراف والمستقلة في المختبر كل أسبوع.
مثل: ANTHRO 175 ، ANTHRO 275 ، BIO 174 ، HUMBIO 180

بيو 274S. دورة هوبكنز لعلم الأحياء الدقيقة. 3-12 وحدة.

(سابقًا GES 274S.) أربعة أسابيع ، مكثفة. التفاعل بين العمليات الجزيئية والفسيولوجية والبيئية والتطورية والجيوكيميائية التي تشكل التنوع الميكروبي وتسببه وتحافظ عليه. كيفية عزل الكائنات الحية الدقيقة الرئيسية التي تقود التنوع البيولوجي والجيوكيميائي البحري ، وتفسير التوصيف الجزيئي المستقل عن الثقافة للأنواع الميكروبية ، والتنبؤ بالأسباب والعواقب. مكون المختبر: ما الذي يشكل التنوع الميكروبي الفسيولوجي والاستقلابي كيف تنوع العمليات التطورية والبيئية الخلايا الفردية إلى مجموعات غير متجانسة من الناحية الفسيولوجية ومبادئ التفاعلات بين الأفراد وسكانهم والكيانات البيولوجية الأخرى في نظام بيئي ميكروبي متغير ديناميكيًا. المتطلبات الأساسية: CEE 274A و CEE 274B ، أو ما يعادلها.
مثل: BIOHOPK 274، CEE 274S، ESS 253S

BIO 276. الأساس التنموي لتطور خطة جسم الحيوان. 4 وحدات.

يتم تصنيف الحيوانات في مجموعات ذات خصائص تنظيمية محددة مثل تعدد الخلايا ، وتنظيم المحور ، وتنظيم الجهاز العصبي ، بالإضافة إلى المستجدات المورفولوجية مثل العيون والأطراف والشرائح. يستكشف هذا المقرر الأصول التطورية والجزيئية للابتكارات الحيوانية هناك. عرضت سنوات بديلة. الشروط: لا يوجد.
مثل: BIO 176

BIO 277. تفاعل ميكروب النبات. 3 وحدات.

الأساس الجزيئي لتعايش النبات والتسبب في المرض. تشمل الموضوعات آليات التعرف والإشارة بين الميكروبات ومضيفي النبات ، مع أمثلة مثل دور الجزيئات الصغيرة ، والببتيدات المفرزة ، ومسارات نقل الإشارة في التفاعلات التكافلية أو المسببة للأمراض. تشمل القراءات أوراقًا تاريخية مع قراءات في الأدب المعاصر. المتطلبات الأساسية: علم الأحياء الأساسي ودورتان أو أكثر في القسم العلوي في علم الوراثة أو البيولوجيا الجزيئية أو الكيمياء الحيوية. يوصى به: علم الوراثة النباتية أو الكيمياء الحيوية للنبات.
مثل: BIO 177

BIO 278. أدب علم الأحياء الدقيقة. 3 وحدات.

للطلاب الجامعيين المتقدمين وطلاب الدراسات العليا في السنة الأولى. قراءة نقدية للأدبيات البحثية في علم الوراثة بدائية النواة والبيولوجيا الجزيئية ، مع تطبيقات خاصة لدراسة مسببات الأمراض البشرية الرئيسية. الأوراق الكلاسيكية والتأسيسية في المؤلفات الحديثة حول التسبب في الأمراض وعلم الوراثة والبيولوجيا الجزيئية عن مسببات الأمراض البكتيرية مثل السالمونيلا و / أو فيبريو و / أو يرسينيا. مناهج تجريبية متنوعة: الكيمياء الحيوية ، وعلم الجينوم ، والتسبب في المرض ، وبيولوجيا الخلية. المتطلبات الأساسية: يجب أن تكون تخصصات البيولوجيا المُعلن عنها قد أخذت BIO 82 (علم الوراثة) و BIO 83 (الكيمياء الحيوية). يقتصر التسجيل للطلاب الجامعيين على تخصصات علم الأحياء في السنة الإعدادية أو العليا. مصطلح مشترك أو دكتوراه. يمكن للطلاب في أقسام علوم الحياة الأساسية مثل علم الأحياء والهندسة الحيوية وعلم الوراثة التسجيل في BIO 278. تقدم بطلب على https://forms.gle/4NTtcBdWYMqRFvGc9.
مثل: BIO 178

BIO 279. التقييم المتكامل لخدمات النظام الإيكولوجي والمفاضلات. 1-3 وحدة.

يستكشف هذا المقرر علم تقدير الطبيعة من خلال مسارين متشابكين. أحدهما فيزيائي حيوي ، ويركز على الاعتماد البشري والتأثيرات على أنظمة دعم الحياة على الأرض. إذا تمت إدارتها بشكل جيد ، فإن الأراضي والمياه والتنوع البيولوجي تؤدي إلى تدفق الفوائد الحيوية التي تحافظ على حياة الإنسان وتحققها. تطير نحلة برية في مزرعة لتلقيح الخضروات أثناء سيرها. في الجوار ، تزيل الأراضي الرطبة المواد الكيميائية من جريان المزارع ، مما يحمي مصدر مياه الشرب. في الحدائق الواقعة على أطراف المدن ، يلعب الأطفال ويمشي البالغون ويتحدثون ، ويعزز تعرضهم للطبيعة النشاط البدني ويحسن الصحة العقلية. تساعد الأشجار في الحفاظ على مناخ ملائم محليًا وعالميًا. سنطور إطارًا وأدوات عملية لقياس تدفق الفوائد من الطبيعة إلى الناس. n المسار الثاني هو المسار الاجتماعي والاقتصادي والفلسفي ، والذي ينسج من خلال مفاهيم الرفاهية والتنمية البشرية والحفظ وأخلاقيات وتأثيراتهم. السعي وراء. سوف ننظر إلى الوراء ، إلى المستقبل ، وإلى الداخل ، مع الأخذ بنظرة عالمية والنظر في وجهات النظر الثقافية المتنوعة. ستكون مناقشاتنا في سياق جائحة COVID-19 ، وحركات العدالة العرقية والمساواة الاجتماعية والاقتصادية ، والجهود المبذولة لتمكين الناس والطبيعة من الازدهار في المدن والبلدان في جميع أنحاء العالم. . سنغوص في أمثلة من العالم الواقعي لنرى كيف يمكن للعلم أن يخبرنا لماذا وأين وكيف وكم يحتاج الناس إلى الطبيعة. سوف نتعلم أساسيات أدوات إنفيست (للتقييم المتكامل لخدمات النظم البيئية والمفاضلات) لتحديد فوائد الطبيعة ، والإنصاف في الوصول إلى هذه الفوائد ، وتحويل السياسة ، والتمويل ، والإدارة ، والممارسة للحفاظ عليها وتعزيزها. . n هذه الدورة مخصصة للطلاب المتنوعين والمتقدمين ، الذين لديهم اهتمامات في البحث والانتقال من العلوم إلى العمل من أجل عالم أكثر عدلاً واستدامة. يهدف المدربون إلى توفير فرصة ممتعة ومثمرة للتواصل عن بُعد ولكن مع الكثير من القلب وكذلك الدافع الفكري والالتزام ، مما يجلب التعاطف والمرونة ونأمل بعض الفكاهة في التحديات اليومية التي نواجهها جميعًا في مختلف طرق صعبة. المتطلبات الأساسية: مهارات نظم المعلومات الجغرافية (نظم المعلومات الجغرافية) الأساسية إلى المتوسطة ضرورية. سوف نساعد في ذلك ، ولكن لن نقوم بتدريس نظم المعلومات الجغرافية على وجه التحديد في الفصل. تشمل المهارات الأساسية ، على سبيل المثال: العمل مع البيانات النقطية والمتجهية والجداول النقطية ، وملفات الأشكال ، والجداول إلى نظام معلومات جغرافي ، وتغيير رموز البيانات النقطية وملفات الأشكال في جداول البيانات النقطية وملف الشكل المختار لتحرير GIS ، وفهم أنظمة الإحداثيات وكيفية إعادة طبقات المشروع تبحث في قيم الخلايا النقطية الفردية وتؤدي العمليات الحسابية الأساسية النقطية.
مثل: بيو 179

27 س. التطور: من الحمض النووي إلى الديناصورات. 3 وحدات.

تركز هذه الدورة على الفكرة الأساسية للتطور ، والتي تؤثر على مجالات متباينة مثل علم الوراثة وعلم الحفريات. سوف تتعلم عن تاريخ الفكر التطوري ، بما في ذلك فكرة داروين عن التطور عن طريق الانتقاء الطبيعي ، وتستكشف المقاييس الزمنية التطورية الصغيرة والكبيرة. تشمل الموضوعات علم الوراثة السكانية ، وعلم الجينوم ، والتطور الجزيئي ، والقوى التطورية ، وتكوين أنواع جديدة ، والاختلافات التطورية في تاريخ الحياة ، ودليل التطور ، بما في ذلك الأنماط من الحمض النووي والسجل الأحفوري.

BIO 282. نمذجة التطور الثقافي. 3 وحدات.

ندوة. النماذج الكمية لتطور السمات المنقولة اجتماعياً. معدلات تغيير السمات المكتسبة في السكان وأنماط التنوع الثقافي كدالة للابتكار ونقل الثقافة. التعلم في بيئات ثابتة ومتغيرة. السبل الممكنة للتطور المشترك للثقافة الجينية.
مثل: BIO 182

BIO 283. علم الوراثة السكانية النظري. 3 وحدات.

نماذج في علم الوراثة والتطور السكاني. الانتقاء ، الانجراف العشوائي ، الارتباط الجيني ، الهجرة ، زواج الأقارب ، وتأثيرها على تطور الترددات الجينية وبنية الكروموسوم. ترتبط النماذج بتطور تسلسل الحمض النووي. الشروط: حساب التفاضل والتكامل والجبر الخطي أو موافقة المعلم.
مثل: BIO 183

بيو 287 أ. موضوعات متقدمة في علم الأحياء التطوري الرياضي. 3 وحدات.

دراسة مركزة لمواضيع محددة في علم الأحياء التطوري الرياضي. قد تشمل موضوعات الدورة: الخصائص الرياضية للإحصاءات المستخدمة في علم الوراثة البشرية للسكان ، ورياضيات الأشجار التطورية ، وتقاطع علم الوراثة السكانية وعلم الوراثة.

بيو 28S. علم الوراثة الجزيئية والتكنولوجيا الحيوية. 3 وحدات.

يغطي هذا المقرر الدراسي أساسيات علم الوراثة الجزيئي ، بما في ذلك مبادئ كيفية عمل الجينات ، وكيفية تنظيم التعبير الجيني في كل من بدائيات النوى وحقيقيات النوى ، وكيفية تمرير الإشارات من الخلايا إلى الخلايا البعيدة. سنستكشف أيضًا التطورات الرئيسية في التكنولوجيا الحيوية ، بما في ذلك الاستنساخ ، والتسلسل ، وتسلسل الجيل التالي ، ومناقشة دراسات الحالة المتعلقة بالسرطان ، ومرض هنتنغتون ، والمزيد.

بيو 290. التدريس العملي في علم الأحياء. 1-5 وحدة.

مفتوح لطلاب المرحلة الجامعية العليا وطلاب الدراسات العليا. خبرة تدريسية عملية تحت الإشراف في معمل أحياء أو دورة محاضرة. يتضمن التدريب غالبًا حضور المحاضرات ، وبدء وتخطيط أقسام المناقشة ، والمساعدة في إعداد مواد الدورة التدريبية. يمكن تكراره للحصول على ائتمان. n المتطلبات الأساسية: موافقة المعلم.

BIO 291. تطوير وتدريس المعامل التجريبية الأساسية. 1-2 وحدة.

تطوير وتدريس المعامل التجريبية الأساسية - الإعداد لتدريس المقررات المعملية التجريبية الأساسية (45 و 47). يتم التركيز على ممارسة مهارات المختبر والتحدث والكتابة. تم أخذها في وقت واحد أثناء التدريس (لـ BIO 45) أو خلال الربع السابق (لتدريس BIO 47). يمكن ان تتكرر للحصول على الائتمان. أوقات الاجتماع يتم تحديدها لاحقًا.

بيو 292. التدريب العملي المناهج. وحدة 1.

هذه الدورة مطلوبة للطلاب الدوليين الذين يشاركون في التدريب المهني في المنظمات (مثل معاهد البحث والتعليم والطب والأعمال والسياسة) مع التركيز في العلوم البيولوجية. سيشارك الطلاب في التدريب أثناء العمل تحت إشراف مشرفين من ذوي الخبرة في الموقع. تفي هذه الدورة بمتطلبات التدريب العملي على المناهج (CPT) للطلاب الحاصلين على حالة F-1D / S. قبل التدريب ، يتعين على الطلاب تقديم تقرير موجز يوضح بالتفصيل المشروع المقترح وأنشطة العمل. بعد التدريب ، يُطلب من الطلاب تقديم ملخص للعمل المنجز ، والمهارات المكتسبة ، وانعكاس النمو المهني المكتسب نتيجة التدريب. ويمكن تكرار هذه الدورة للحصول على الائتمان. المتطلب السابق: العرض المؤهل للتوظيف وموافقة المستشار.

BIO 294. الفيزياء الحيوية الخلوية. 3 وحدات.

البيولوجيا الفيزيائية للعمليات الديناميكية والميكانيكية في الخلايا. يتم التركيز على الفهم النوعي للوظائف البيولوجية من خلال التحليل الكمي والنماذج الرياضية البسيطة. النقل الحسي ، والإشارات ، والتكيف ، والمفاتيح ، والمحركات الجزيئية ، والأكتين والأنابيب الدقيقة ، والحركة ، والساعات اليومية. الشروط: المعادلات التفاضلية والميكانيكا الإحصائية التمهيدية.
مثل: APPPHYS 294، BIOPHYS 294

BIO 296. التدريس والتعلم في علم الأحياء. وحدة 1.

يزود هذا المساق الطلاب الذين يدرسون في قسم الأحياء بالتدريب الأساسي والدعم والتطوير المهني في أدوارهم التدريسية. تشمل الموضوعات مشاركة الطلاب والتقييم والتغذية الراجعة والمزيد. يجب أن تؤخذ بالتزامن مع أول منصب تدريسي.

299. علم الأحياء دكتوراه مختبر تناوب. 1-10 وحدة.

يقتصر على طلاب الدكتوراه في علم الأحياء في السنة الأولى. مناوبات المختبر مع أعضاء هيئة التدريس في العلوم البيولوجية.

بيو 2 إن. علم البيئة وتطور الأمراض المعدية في عالم متغير. 3 وحدات.

ستستكشف هذه الندوة الطرق التي يؤثر بها التغير البشري ، وتغير المناخ ، وتدمير الموائل ، وتغير استخدام الأراضي ، وغزوات الأنواع على البيئة وتطور الأمراض المعدية. ستشمل الموضوعات الأمراض المعدية للإنسان والحياة البرية والماشية والمحاصيل ، وتأثيرات المرض على الأنواع المهددة ، وانتشار الأمراض ، والأمراض الناشئة ، ودور المرض في النظم الطبيعية. سيتم تدريس الدورة من خلال مجموعة من القراءات الشعبية والعلمية والمناقشات والمحاضرات. .

BIO 3. الحدود في علم الأحياء البحرية. وحدة 1.

مقدمة للبحث المعاصر في علم الأحياء البحرية ، بما في ذلك علم البيئة ، وبيولوجيا الحفظ ، وعلم السموم البيئية ، والسلوك ، والميكانيكا الحيوية ، والتطور ، وعلم الأعصاب والبيولوجيا الجزيئية. يتم التركيز على الاكتشافات الجديدة والتقنيات المستخدمة في صنعها. محاضرات أسبوعية من قبل أعضاء هيئة التدريس من محطة هوبكنز البحرية.

السيرة الذاتية 30. علم البيئة للجميع. 4 وحدات.

علم البيئة هو علم التفاعلات والتغييرات التي تولدها. تربط هذه الدورة التدريبية القائمة على المشروع بين السلوك الفردي والنمو السكاني وتفاعلات الأنواع ووظيفة النظام البيئي. مقدمة في القياس والملاحظة والتصميم التجريبي واختبار الفرضيات في المشاريع الميدانية. الهدف هو تعلم التفكير بشكل تحليلي في العمليات البيئية اليومية ، بما في ذلك تلك التي تشارك فيها ، والتي تشمل البكتيريا والفطريات والنباتات والحيوانات والبشر. يستخدم المقرر الإحصائيات الأساسية لتحليل البيانات ولا توجد شروط مسبقة للرياضيات باستثناء الحساب. مفتوح للجميع ، بما في ذلك أولئك الذين قد يتجهون إلى دورات أكثر تقدمًا في علم البيئة وعلوم البيئة. ستلتقي النسخة عبر الإنترنت بشكل متزامن وستتضمن التحضير خارج الفصل للمناقشات التفاعلية أثناء وقت الفصل. سننظم مشاريع ميدانية يمكنك القيام بها أينما كنت. تبدأ المشاريع في الأسبوع الأول من الربع. للأسئلة ، يرجى الاتصال بالبروفيسور جوردون على [email protected]

بيو 300. بحوث الدراسات العليا. 1-10 وحدة.

لطلاب الدراسات العليا فقط. البحث الفردي بالتنسيق مع المدربين في القسم.

300X السيرة الذاتية. بحث الخريجين خارج القسم. 1-10 وحدة.

البحث الفردي بالتنسيق مع مدربين من خارج القسم. طلاب الماجستير: يقتصر رصيد العمل الذي يتم ترتيبه مع المدرسين من خارج القسم على طلاب الأحياء ويتطلب التماسًا معتمدًا من القسم. انظر http://biohonors.stanford.edu لمزيد من المعلومات. يمكن ان تتكرر للحصول على الائتمان.

BIO 301. الحدود في علم الأحياء. 1-3 وحدة.

مقتصر ومطلوب من دكتوراه السنة الأولى. طلاب في البيولوجيا الجزيئية والخلوية والنمائية. البحث الحالي في علم الأحياء الجزيئي والخلوي والتنموي مع التركيز على الأدبيات البحثية الأولية. عقدت بالتزامن مع سلسلة ندوات الدائرة يوم الاثنين. يجتمع الطلاب وأعضاء هيئة التدريس أسبوعيًا قبل الندوة لعرض تقديمي للطلاب ومناقشة الأوراق القادمة.

BIO 302. الموضوعات الحالية والمفاهيم في بيولوجيا السكان ، وعلم البيئة ، والتطور. وحدة 1.

مطلوب من طلاب الدكتوراه في السنة الأولى في علم الأحياء السكانية وعلم البيئة والتطور. القضايا المفاهيمية الرئيسية ومواضيع التطوير. هذه الدورة غير مفتوحة فقط لطلاب الدكتوراه في علم الأحياء وليست مفتوحة للمراجعين. & quot.

BIO 303. الموضوعات والمفاهيم الحالية في بيولوجيا السكان وعلم البيئة والتطور. وحدة 1.

مطلوب من طلاب الدكتوراه في السنة الأولى في علم الأحياء السكانية وعلم البيئة والتطور. القضايا المفاهيمية الرئيسية ومواضيع التطوير. هذه الدورة غير مفتوحة فقط لطلاب الدكتوراه في علم الأحياء وليست مفتوحة للمراجعين. & quot.

BIO 304. الموضوعات الحالية والمفاهيم في بيولوجيا السكان وعلم البيئة والتطور. وحدة 1.

مطلوب من طلاب الدكتوراه في السنة الأولى في علم الأحياء السكانية وعلم البيئة والتطور. القضايا المفاهيمية الرئيسية ومواضيع التطوير. هذه الدورة مفتوحة فقط لطلاب الدكتوراه في علم الأحياء وليست مفتوحة للمراجعين.

BIO 305. إدارة الدكتوراه. وحدة 1.

ستركز الدورة على 5 موضوعات لإدارة الدكتوراه بفعالية: الاحتراف والمنح الدراسية والرفاهية والمشاركة المجتمعية والتطوير الوظيفي. سنلتقي مرة كل أسبوعين وسنعقد اجتماعًا نشطًا قائمًا على المناقشة لمدة ساعتين. في نهاية ربع السنة ، سيشارك الطلاب والمدرسون في تنظيم ورشة عمل مدتها نصف يوم في القسم حول موضوع معين ذي صلة بالموضوعات التي يتم تناولها في الفصل.

السيرة الذاتية 313. الأخلاق في الأنثروبوسين. وحدة 1.

اليوم ، في الأنثروبوسين ، تؤثر البشرية على البيئة على نطاق واسع ، مع نتائج قاسية للأنواع والنظم الإيكولوجية والمناظر الطبيعية. تثير عواقب هذا التأثير العديد من الأسئلة الأخلاقية ، مع معضلات جديدة تجبرنا على التفكير في القيم الأخلاقية الجديدة وإعادة النظر في القيم القديمة. في هذه الدورة ، سوف نتعرف على أخلاقيات وفلسفة البيئة والحفاظ على البيئة ، ونكتسب مجموعة أدوات من المفاهيم والأفكار التي ستسمح لنا بمعالجة المناقشات الأخلاقية البيئية الحالية. سوف نستكشف دور الأخلاق في علوم البيئة والحفظ من خلال مناقشة الأسس الفلسفية للقيم الأخلاقية في الأنثروبوسين ، وكذلك من خلال دراسة القضايا العملية الحالية ، مثل عمليات إعادة الإدخال والأنواع الغازية والدعوة للحفظ.

السيرة الذاتية 315. أن تصبح عالمًا مرنًا. وحدة 1.

هذه ورشة عمل افتراضية من ستة أجزاء ترعاها المعاهد الوطنية للصحة وتهدف إلى بناء المرونة في مواجهة العقبات الشائعة في البحث. سيشارك الطلاب والميسرون في سلسلة من الندوات عبر الإنترنت ومناقشات جماعية صغيرة حول موضوعات ، مثل الذكاء العاطفي ، والدعوة الذاتية ، ومرونة التعليقات ، وعلاقات التوجيه.

BIO 329. طرق المصفوفة للنماذج الديناميكية وتحليل البيانات. وحدة 1.

أنواع المصفوفات في النماذج الديناميكية والعشوائية ، التغايرات ، البيانات المستطيلة ، الشبكات. النظرية الطيفية ، المقاربات ، نظرية الاستقرار ، المصفوفات غير السالبة ، الشدة ، سلاسل ماركوف. Hermitian ، التغاير ، SVD. نظرية الاضطراب. منتجات مصفوفة عشوائية ، دعاة ليابونوف. مفتوح لدرجة الدكتوراه. طلاب في علم الأحياء. المتطلبات الأساسية: حساب التفاضل والتكامل (مستوى AP) مطلوب. يفضل بعض المعرفة بالجبر الخطي ، R.

بيو 32S. مقدمة في التكنولوجيا الحيوية: الكشف عن الأمراض وعلاجها. 3 وحدات.

يدرس هذا المقرر المفاهيم الأساسية للتكنولوجيا الحيوية والأدوات والتقنيات المستخدمة في معالجة الأحماض النووية (DNA و RNA). سيتعلم الطلاب كيفية استخدام أدوات وتقنيات التكنولوجيا الحيوية للمساعدة في تحديد الأمراض ومكافحتها ، مع التركيز بشكل خاص على الأدوات التي تساعد في اكتشاف العدوى الفيروسية مثل COVID-19. ستدرس هذه الدورة أيضًا القضايا الأخلاقية والمتعلقة بالخصوصية المرتبطة بالاختبارات الجينية.

بيو 330. طرق العشوائية للمحاكاة والديناميات وتحليل البيانات. وحدة 1.

سلاسل ماركوف: الجهد ، CLT ، أوقات المرور ، الامتصاص. المحاكاة: أرقام عشوائية ، سلاسل. عمليات بواسون: التطبيقات والمحاكاة. نماذج السلاسل الزمنية. أساسيات MCMC. مفتوح لدرجة الدكتوراه. طلاب في علم الأحياء. المتطلبات: حساب التفاضل والتكامل (مستوى AP) والجبر الخطي الأساسي مطلوبان. مرفق مع الجبر الخطي ، R ، المفضل.

بيو 332. علم الجينوم التطوري. 2 وحدة.

سنقرأ الأوراق الكلاسيكية والحديثة ذات الصلة بعلم الجينوم التطوري ، ونناقشها. سنغطي مجموعة واسعة من الموضوعات والأساليب والأنواع.

BIO 342. ندوة علم الأحياء النباتية. 1-3 وحدة.

موضوعات في بيولوجيا النبات مقدمة في ندوة أسبوعية. يتم الإعلان عن المواضيع في بداية كل ربع سنة. الأدب الحالي. يمكن ان تتكرر للحصول على الائتمان. انظر https://dpb.carnegiescience.edu/events.

بيو 346. ندوة متقدمة في البيولوجيا الجزيئية الميكروبية. وحدة 1.

يقتصر التسجيل على طلاب الدكتوراه المرتبطين بمجموعات البحث في الأقسام في علم الوراثة أو البيولوجيا الجزيئية.
مثل: CSB 346، GENE 346

بيو 35. الاستدامة والحضارة. وحدة 1.

تواجه حضارتنا تحديات استدامة هائلة ، وستتطلب مواجهتها جميع المواهب الكبيرة ورؤية الجيل الصاعد. لقد أصبح عدم استدامة نظام الطاقة القائم على الكربون والذي يدعم الاقتصاد العالمي واضحًا بشكل متزايد ، كما أن الكثير من العالم البيولوجي ، وكذلك نوعنا ، معرض لخطر النشاط البشري. لقد أثبت النظام السياسي الدولي أنه أقل استقرارًا مما توقعه العديد من مراقبي القرن العشرين ، وعانت الأنظمة الاقتصادية والثقافية على حد سواء من صدمات متزايدة في العقود الأخيرة. لقد حقق العلم والتكنولوجيا تقدمًا هائلاً ، لكن الزيادات الناتجة في قدرتنا على التأثير على العالم تحمل مخاطر ، فضلاً عن الحلول المحتملة. علاوة على ذلك ، ساهمت بعض خصائص المجتمعات الحديثة هذه في ظهور الوباء العالمي ، الذي تذكرنا آثاره المنتشرة بهشاشة حضارتنا المعتمدة على المعرفة. ستجمع هذه الدورة التدريبية المكونة من وحدة واحدة عبر الإنترنت أعضاء هيئة التدريس من جميع أنحاء الجامعة لمعالجة الاستدامة على نطاق واسع. سيقوم المتحدثون بمسح مجموعة التهديدات التي تواجهنا ، واستكشاف الحلول المحتملة ، وإشراك الجيل القادم من قادة المستقبل في مناقشة حية حول هذه القضايا الملحة.
مثل: HISTORY 35، POLISCI 35

BIO 355. الشعاب المرجانية في غرب المحيط الهادئ: وجهات نظر متعددة التخصصات ، والأزمات الناشئة ، والحلول. وحدة 1.

تركز هذه الدورة الجديدة على مستوى الدراسات العليا على التفاعل المعقد للبيولوجيا والفيزياء والكيمياء والأنشطة البشرية التي تعزز وتحد من تطور الشعاب المرجانية. سوف نفحص البيئة الخاصة بهذه الأنظمة المتنوعة بيولوجيًا بالإضافة إلى الخدمة التي تقدمها من حيث إعادة التدوير السريع للمغذيات ، وحماية السواحل ، والحفاظ على أعداد كبيرة من الأسماك. سيتم تسليط الضوء على التطورات الجديدة في فهمنا للشعاب المرجانية ، بما في ذلك دور التقلبات المناخية وتدفق السوائل الجزئي والمتوسط ​​في التحكم في نمو الشعاب المرجانية وثباتها ، وعلم وظائف الأعضاء ، وعلم الجينوم ، والفيزياء التي تدعم المرونة الحرارية في الشعاب المرجانية ، والعوامل المساهمة والمخففة المعنية في التدهور الحالي للشعاب المرجانية ، وتحمض المحيطات ، وصيد الأسماك ، والنمذجة الغذائية على نطاق الشعاب المرجانية ، والتفاعلات البيئية ، والشلالات الغذائية ، والشعاب كجزء من المناظر البحرية المعقدة والروابط مع النظم الإيكولوجية البحرية الأخرى. ستختتم الدورة بتحليل العلوم لدراسات الحالة السياسية والفرص المستقبلية. يتمتع قادة أعضاء هيئة التدريس بشكل جماعي بأكثر من 100 عام من الخبرة الميدانية في العمل في الشعاب المرجانية في المحيط الهادئ ، وعلى الرغم من تنسيق التدريس والتعلم القسري عبر الإنترنت ، فسوف يسعى إلى إعادة الحياة إلى تجربة مجال الشعاب المرجانية في هذه الفئة.
مثل: BIOHOPK 355 ، CEE 363I ، ESS 355

بيو 35N. بيئة تغير المناخ: هل فات الأوان ؟. 3 وحدات.

سوف تستكشف هذه الندوة التمهيدية عواقب تغير المناخ على المجتمعات البيئية ، مع التركيز على مفهومين ناشئين: & quotdisequilibrium & quot ، والذي يؤكد على أن الأمر قد يستغرق وقتًا طويلاً للمجتمعات للاستجابة لتغير المناخ بسبب تفاعلات الأنواع ، والطوارئ quothistorical ، & quot الذي يقترح أن الترتيب الذي تغزو فيه الأنواع وتختفي مع إعادة تجميع المجتمعات استجابة لتغير المناخ سيحدد الأنواع التي ستستمر. ستشمل الندوة محاضرة ومناقشة وكتابة وزيارة محمية جاسبر ريدج البيولوجية.

السيرة الذاتية 380. الاستكشاف والتخطيط الوظيفي. وحدة 1.

يعد التفكير والتخطيط للحياة بعد التخرج من أكثر الأنشطة إثارة للقلق التي يواجهها الطلاب. في هذه الدورة ، سيشارك الطلاب قصصهم الشخصية ومعضلاتهم حول القرارات المهنية ، ويناقشون مختلف الخيارات الوظيفية مع درجة الدكتوراه في علوم الحياة ، ويتعلمون كيفية تصميم مسارهم الخاص. ستكون هناك ثلاث لجان مهنية مع ضيوف مدعوين من مختلف المسارات المهنية ، بما في ذلك البحث والتدريس والإدارة والصناعة وبدء التشغيل والاستثمار والقانون والصحافة والسياسة وغير ذلك. مفتوح لطلاب الدكتوراه في علم الأحياء في العام 3 أو ما بعده. سيجتمع الطلاب في قاعة المؤتمرات في معهد كارنيجي للعلوم ، المبنى رقم 600 ، الكائن في 260 شارع بنما ، ستانفورد ، كاليفورنيا 94305.

BIO 383. ندوة في علم الوراثة السكانية. 1-3 وحدة.

مراجعة الأدبيات والبحوث والمشاكل الحالية في نظرية وممارسة علم الوراثة السكانية والتطور الجزيئي. يمكن ان تتكرر للحصول على الائتمان. الشرط المسبق: موافقة المعلم.

BIO 386. الحفظ وعلم الجينوم السكاني. وحدة 1.

ستركز مجموعة القراءة والمناقشة هذه مرة واحدة في الأسبوع على القدرة على التكيف: مدى سرعة ومدى استجابة الأنواع والمجموعات والكائنات الفردية لتغير المناخ. يفرض التغيير السريع في البيئة تغييرات قوية في المجتمعات البيئية. اللدونة المظهرية يمكن أن تغير الفسيولوجيا أو التشكل ، وأنماط الانتقاء الطبيعي يمكن أن تغير ترددات الجينات ، والتغيرات الديموغرافية يمكن أن تغير نطاقات الأنواع ، والتغيرات في تفاعلات الأنواع يمكن أن تغير المجتمعات في تكوين الأنواع. ستستكشف هذه الندوة ما نعرفه عن القدرة التكيفية للمجتمعات المختلفة والأنواع المختلفة. ما مدى سرعة حدوث التكيف؟ إلى أي مدى يمكن للتكيف أن "يحل" المشاكل الناتجة عن تغير المناخ؟ كيف نقيس القدرة على التكيف؟ سنقوم بسحب القراءات من الأدبيات ونقوم بتقسيم هذا الموضوع إلى أقسام. سيقدم الطلاب أعمالهم الخاصة أو المنشورة حول القدرة على التكيف لتقديم أمثلة وإطار أسئلة. في النهاية ، سنصمم ندوة دولية حول التكبير / التصغير لتسليط الضوء على الدور الذي يمكن أن تلعبه القدرة التكيفية في إدارة وحماية النظم البيئية المعقدة في مواجهة تغير المناخ ، وتحديده وتوضيحه.

بيو 3 إن. مناظر لبحر متغير: الأدب والعلوم. 3 وحدات.

سيتم فحص حالة محيط العالم المتغير ، ولا سيما في شرق المحيط الهادئ ، من خلال المنشورات العلمية والواقعية والتاريخية والمعاصرة. وستشمل القضايا الحصاد وتربية الأسماك البحرية ، والتفاعلات بين اليابسة والبحر وتغير المناخ المحيطي في كل من المياه السطحية والعميقة.

BIO 45. مقدمة في البحوث المخبرية في الخلية والبيولوجيا الجزيئية. 4 وحدات.

تحقق من سلالات الخميرة المهندسة للتعبير عن بروتين مثبط الورم البشري ، p53 ، واستخدم الأساليب الجزيئية الحديثة لتحديد النتائج الوظيفية لطفرات البروتين p53 المعزولة من الخلايا السرطانية. تعرف على دور البروتين كحارس للجينوم من خلال المحاضرات وقراءة ومناقشة مقالات المجلات. استخدم برامج التصور الجزيئي لفحص بنية البروتينات p53 الطبيعية والمتحولة. تعرف على المقايسات المستخدمة لدراسة قدرة p53 الطافرة لتوجيه التعبير عن العديد من جينات المراسل. أثناء التفكير الموجه ، تحقق أكثر وحدد ما يمكن أن يكون خطأ في طفرات p53 التي كنت تدرسها. تعرف على كيفية طرح سؤال ، واختبار الفرضية ، وإجراء التجارب وتحليل البيانات ، وتقديم نتائجك من خلال عرض تقديمي شفهي للفريق ، بالإضافة إلى ملصق علمي. على الرغم من عدم وجود متطلبات مسبقة للتسجيل في هذا الفصل ، إلا أنه سيكون مفيدًا إذا كنت قد التحقت بالفعل أو تم تسجيلك في نفس الوقت في فصول مؤسسة علم الأحياء المناسبة (أو فصول HumBio الأساسية). بالإضافة إلى ذلك ، سيكون مفيدًا أيضًا إذا كنت قد أخذت بالفعل CHEM 31M أو 31A & amp B.

السيرة الذاتية 459. الحدود في العلوم البيولوجية متعددة التخصصات. وحدة 1.

يسجل الطلاب من خلال الأقسام التابعة لهم ، وإلا يسجلون في CHEMENG 459. للمتخصصين وغير المتخصصين. برعاية برنامج ستانفورد بيوكس. ثلاث ندوات كل ربع سنة تتناول الموضوعات العلمية والتقنية المتعلقة بالمناهج متعددة التخصصات في الهندسة الحيوية والطب والعلوم الكيميائية والفيزيائية والبيولوجية. يقدم المحققون البارزون من جامعة ستانفورد والعالم اختراقات ومساعي تتخطى التخصصات الأساسية. تقدم الندوات التمهيدية المفاهيم الأساسية والخلفية لغير الخبراء. يحضر الطلاب المسجلون جميع الندوات التمهيدية ويرحب بهم الآخرون. انظر http://biox.stanford.edu/courses/459.html. موصى به: الرياضيات الأساسية وعلم الأحياء والكيمياء والفيزياء.
مثل: BIOC 459، BIOE 459، CHEM 459، CHEMENG 459، PSYCH 459

BIO 46. مدخل إلى البحث في علم البيئة وعلم الأحياء التطوري. 4 وحدات.

الهدف من هذه الدورة هو تطوير فهم كيفية إجراء البحوث البيولوجية ، وذلك باستخدام موضوعات في علم البيئة كأمثلة عملية. يتضمن ذلك العملية العلمية الكاملة: تقييم المؤلفات الأساسية ، وإنشاء فرضيات قابلة للاختبار ، وتقنيات التعلم لجمع البيانات ، وتحليل البيانات باستخدام الأساليب الإحصائية المناسبة ، وكتابة النتائج ومشاركتها. لبناء هذه المهارات ، يركز هذا المقرر الدراسي على الكائنات الحية الدقيقة المرتبطة بالنباتات الأشنة وتفاعلاتها مع تلوث الهواء والمتغيرات البيئية الأخرى. يعمل الطلاب في فرق على تطوير فرضيات بحثية جديدة وتنفيذ التجارب والقياسات اللازمة لاختبار هذه الفرضيات. نظرًا لأن الدورة ستكون عبر الإنترنت هذا العام ، فسوف نقوم بتحليل البيانات التي تم جمعها في السنوات السابقة بدلاً من إجراء التجارب الميدانية والمخبرية شخصيًا. بالإضافة إلى ذلك ، سيتعلم الطلاب كيفية التعامل مع البيانات وتصورها وتحليلها في R. ينقل نتائج البحث. ملاحظة مهمة: يجب على الطلاب الذين يحتاجون إلى BIO 46 لتلبية متطلبات WIM لتخصص علم الأحياء أن يأخذوا هذه الدورة للحصول على درجة حرف (ما عدا في 2020-21).

BIO 47. مدخل إلى البحث في علم البيئة وعلم الأحياء التطوري. 4 وحدات.

الهدف من هذه الدورة هو تطوير فهم كيفية إجراء البحوث البيولوجية ، باستخدام موضوع في علم البيئة ، وعلم الأحياء التطوري ، وبيولوجيا النبات كمثال عملي. يتضمن ذلك العملية العلمية الكاملة: تقييم المؤلفات الأساسية ، وإنشاء فرضيات قابلة للاختبار ، وتقنيات التعلم لجمع البيانات الميدانية والمختبرية ، وتحليل البيانات باستخدام الأساليب الإحصائية المناسبة ، وأخيراً كتابة النتائج ومشاركتها. لبناء هذه المهارات ، تركز هذه الدورة على ميكروبات الرحيق في ستانفورد بالقرب من محمية جاسبر ريدج البيولوجية. سيقوم الطلاب ، الذين يعملون في فرق ، بتطوير فرضيات بحثية جديدة وإجراء تحليلات البيانات اللازمة لاختبار هذه الفرضيات. تتويج الدورة التدريبية هي ورقة بحثية مكتوبة بأسلوب مقال في مجلة تمت مراجعتها من قبل الزملاء بالإضافة إلى دفاع شفهي عن نتائج أبحاث الطلاب. نظرًا لأن الدورة سيتم تقديمها عبر الإنترنت هذا العام ، فسوف نقوم بتحليل البيانات التي تم جمعها في السنوات السابقة بدلاً من إجراء التجارب الميدانية والمخبرية شخصيًا.على الرغم من عدم وجود متطلبات مسبقة للتسجيل في الفصل ، إلا أنه سيكون مفيدًا إذا كنت قد التحقت بالفعل بـ BIO 81 أو التحقت بالفعل أو التحقت بالفعل بفصل HumBio الأساسي ذي الصلة. ملاحظة: يرضي WIM في علم الأحياء.

بيو 51S. الجين: تاريخ وعلم كودنا الجيني. 3 وحدات.

ستستخدم هذه الدورة التدريبية القائمة على المناقشة رواية "الجين" لسيدهارثا موخيرجي وقراءات أخرى مختارة لاستكشاف العلم وراء الكود الجيني. سنغطي موضوعات مثل تنظيم التعبير الجيني ، والوراثة ، والاختبار الجيني ، والتلاعب بالجينوم ، والعلاقة بين علم الوراثة والهوية. المتطلبات الأساسية: موافقة المعلم ، يوصى بعلم الأحياء AP.

السيرة الذاتية 52. أنا ، عالم: التنوع يحسن الممارسة العلمية. وحدة 1.

يتم تحديد الأولويات التأديبية وجداول الأعمال البحثية والابتكارات من خلال تنوع المشاركين ويكون حل المشكلات أكثر نجاحًا مع مجموعة واسعة من الأساليب. باستخدام دراسات الحالة في البحث العلمي ، نقترح استخدام هذه الأفكار لمساعدة طلابنا على معرفة سبب قيام مجتمع علمي متنوع باكتشاف أفضل وتحسين صلة العلم بالمجتمع. فرضيتنا هي أن مجموعة متنوعة من وجهات النظر لن تؤثر فقط على كيفية تعلمنا للعلم ، ولكن على كيفية قيامنا بالعلم.
مثل: CSRE 52H

BIO 53. تصوير الحفظ. 3 وحدات.

مقدمة في مجال التصوير الفوتوغرافي المحمي والاستخدام الاستراتيجي للاتصال المرئي في معالجة القضايا المتعلقة بالبيئة والمحافظة عليها. سيتعرف الطلاب على أساسيات التصوير الرقمي ومعالجة الصور الرقمية ونظرية وتطبيق تقنيات التصوير الفوتوغرافي. سيتم فحص دراسات الحالة الخاصة بقضايا الحفظ من خلال الصور ومنصات الوسائط المتعددة بما في ذلك الصور والفيديو والصوت. المحاضرات والبرامج التعليمية والعروض التوضيحية والرحلات الميدانية الاختيارية ستبلغ ذروتها في إنتاج المشاريع الفردية والجماعية. هذه الدورة مماثلة لـ BIO 7N ، لذلك لا ينبغي على الطلاب المسجلين في السابق الالتحاق بهذه الدورة. مفتوح للطلاب الجامعيين وطلاب الدراسات العليا. يجب أن يكون لدى الطلاب إمكانية الوصول إلى كاميرا وعدسات DSLR - يمكننا قبول ما يصل إلى 20 طالبًا يمكنهم مشاركة 10 كاميرات وعدسات مقدمة في الدورة التدريبية ، عن طريق التطبيق. تطبيق لاستخدام الكاميرا: https://forms.gle/1yAD3my8GoDseXw59.

السيرة الذاتية 57. حالة البشر والكوكب. 4 وحدات.

كيف رفاه الإنسان يؤثر على بيئته والعكس؟ تتمثل أهداف هذه الدورة في دراسة طرق قياس رفاهية الإنسان والبيئة ، وتفاعلاتهما الرئيسية الآن وفي العقود العديدة القادمة ، وتحديد التحديات والثغرات في معرفتنا.

بيو 60. حل المشكلات في الأمراض المعدية. 4 وحدات.

لماذا ينتشر مرض لايم؟ كيف يصبح فيروس نقص المناعة البشرية مقاوما للأدوية؟ كيف تؤثر الحيوانات الأخرى على مخاطر مرضنا؟ في BIO 60 سيقوم الطلاب بفحص دراسات الحالة الفعلية لتجربة كيفية استخدام الأساليب العلمية المختلفة لمحاربة الأمراض المعدية. سيقومون بتقييم المعلومات المقدمة في وسائل الإعلام الشعبية والأدبيات العلمية ، وسوف يشاركون مباشرة في العملية العلمية من خلال التدريب العملي على جمع وتوثيق وتحليل البيانات العلمية الموثوقة. سيقوم الطلاب بتنمية فضولهم العلمي من خلال اكتشاف العالم الطبيعي باستخدام "المجهر الورقي للأوريجامي" (https://microcosmos.foldscope.com). سيقوم الطلاب ببناء مهارات التفكير النقدي من خلال وضع الفرضيات وتصميم التجارب التي تتعلق بمشاكل الأمراض المعدية. سيعمل الطلاب في فرق لتوسيع تفكيرهم وسيمارسون توصيل العلوم إلى جماهير مختلفة.

السيرة الذاتية 61. العلم كعملية إبداعية. 4 وحدات.

ما هي عملية العلم ، ولماذا يهم الإبداع؟ سوف نتعمق في إمكانية تطبيق العلم في معالجة مجموعة واسعة من مشاكل العالم الحقيقي. تم تصميم هذه الدورة لتعليم الطريقة العلمية كما يمارسها بالفعل العلماء العاملون. سيغطي كيفية طرح سؤال مطروح جيدًا ، وكيفية تصميم تجربة جيدة ، وكيفية جمع البيانات الكمية وتفسيرها ، وكيفية التعافي من الخطأ ، وكيفية توصيل النتائج. الحقائق مهمة! ستتضمن موضوعات الدورة التصميم التجريبي والإحصاء والأهمية الإحصائية وصياغة الضوابط المناسبة والنمذجة ومراجعة الأقران والمزيد. ستشمل الدورة التدريبية عنصرًا عمليًا مهمًا يتميز بتصنيع الجهاز واختباره وقياسه. من بين أنشطة & quotDorm Science & quot الأخرى ، سنقوم بتوزيع مجموعات Arduino الدقيقة وأجهزة الاستشعار الإلكترونية ، ثم استخدام هذه العناصر ، جنبًا إلى جنب مع المواد الأخرى ، لإكمال مجموعة متنوعة من المشاريع الجماعية والفردية خارج الفصل الدراسي. ستكون مهمة الدورة النهائية هي تطوير وكتابة اقتراح منحة علمية لاختبار أسطورة أو جدل علمي يختاره الطلاب. على الرغم من كونه مفيدًا ، إلا أنه لا يلزم وجود خبرة سابقة في مجال الإلكترونيات أو برمجة الكمبيوتر. موصى به للطلاب الجدد.
مثل: APPPHYS 61

BIO 62. تجارب علم الأحياء الدقيقة. 4 وحدات.

Micro-X هي دورة تدريبية على منحدر نستكشف من خلالها تجارب علم الجراثيم الكلاسيكية والحديثة مع التركيز على التصميم والمنطق. تمت تغطية الكيمياء الحيوية البكتيرية ، والهيكل ، والتمثيل الغذائي ، وعلم الوراثة في المحاضرة. يتضمن المختبر الزراعة الميكروبية والفحص المجهري واكتشاف العاثيات وتوصيفها. طلب التسجيل محدود مطلوب. قدم على https://forms.gle/x37kwXvJxvQmN1sA6 بحلول 3 ديسمبر للحصول على تفضيل التسجيل.

بيو 6N. الحفاظ على المحيطات: مسارات إلى الحلول. 3 وحدات.

سوف نتعلم كيفية تصميم مسارات إلى الحلول من خلال دمج العلوم الاجتماعية والحوكمة في دراسات الحالة لدينا. سنتناول كلاً من الأساليب التقليدية (إدارة مصايد الأسماك ، والحد من آثار الشحن العالمي ، والمناطق البحرية المحمية) ونهج البحث والإدارة الناشئة (التخطيط المكاني البحري ، والإدارة الديناميكية للمحيطات ، والحمض النووي البيئي). تواجه المحيطات تحديات طويلة الأجل ، مثل الصيد الجائر والتلوث اللذين نعرف كيفية حلهما ، وتحديات ناشئة ، مثل تغير المناخ والمواد البلاستيكية للمحيطات ، والتي يصعب تحقيق حلول لها. في نهاية المطاف لتحقيق الاستدامة على المدى الطويل ، يجب أن تعمل الحلول لصالح كل من الناس والكوكب. تقدم هذه الألغاز مشاكل أنظمة معقدة صعبة تتطلب أفضل تفكير متعدد التخصصات لحلها.

بيو 7N. تصوير الحفظ. 3 وحدات.

مقدمة في مجال التصوير الفوتوغرافي المحمي والاستخدام الاستراتيجي للاتصال المرئي في معالجة القضايا المتعلقة بالبيئة والمحافظة عليها. سيتعرف الطلاب على أساسيات التصوير الرقمي ومعالجة الصور الرقمية ونظرية وتطبيق تقنيات التصوير الفوتوغرافي. سيتم فحص دراسات الحالة الخاصة بقضايا الحفظ من خلال الصور ومنصات الوسائط المتعددة بما في ذلك الصور والفيديو والصوت. المحاضرات والبرامج التعليمية والعروض التوضيحية والرحلات الميدانية الاختيارية ستبلغ ذروتها في إنتاج المشاريع الفردية والجماعية.

بيو 802. أطروحة TGR. 0 وحدة.

BIO 81. مدخل إلى علم البيئة. 4 وحدات.

ستعرفك هذه الدورة على المبادئ الأولى لعلم البيئة ، ودراسة التفاعلات بين الكائنات الحية وبيئتها. الشروط: لا يوجد.

بيو 82. علم الوراثة. 4 وحدات.

ينصب تركيز الدورة على الآليات الأساسية الكامنة وراء نقل المعلومات الجينية وعلى استخدام التحليل الجيني لدراسة الأسئلة البيولوجية والطبية. ستتضمن الموضوعات الرئيسية: (1) استخدام التنوع الجيني الموجود في البشر والأنواع الأخرى لتحديد الجينات التي تلعب دورًا مهمًا في تحديد السمات وقابلية الإصابة بالأمراض ، (2) تحليل الطفرات في الكائنات الحية النموذجية واستخدامها في التحقيق في العمليات والأسئلة البيولوجية و (3) استخدام المعلومات الجينية للتشخيص وإمكانية التلاعب الجيني لعلاج المرض. المتطلبات الأساسية: لا شيء ، ولكن يوصى باستخدام BIO 83. لعام 2021 ، سيتم تسجيل محاضرات Live Zoom ونشرها على Canvas للطلاب الذين يعانون من تعارضات. الحضور في قسم المناقشة الذي يعقد مرة واحدة في الأسبوع إلزامي. للأسئلة اللوجستية حول الدورة ، يرجى التواصل مع وحيدة خلفان ([email protected]).

BIO 83. الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية أمبير. 4 وحدات.

مقدمة في الأساس الجزيئي والكيميائي الحيوي للحياة. تشمل موضوعات المحاضرة بنية ووظيفة البروتينات والأحماض النووية والدهون والكربوهيدرات واستقلاب الطاقة ونقل الإشارة وعلم التخلق وإصلاح الحمض النووي. ستنظر الدورة أيضًا في كيفية تسبب العيوب في هذه العمليات في حدوث المرض. الشروط: لا يوجد.

بيو 84. علم وظائف الأعضاء. 4 وحدات.

ينصب تركيز علم وظائف الأعضاء على فهم كيفية معالجة الكائنات الحية للتحديات المادية للحياة على الأرض. ستوفر هذه الدورة لمحة عامة عن فسيولوجيا الحيوان والنبات وتعلم فهمًا لكيفية الحفاظ على الكائنات الحية على التوازن والاستجابة للإشارات البيئية وتنسيق السلوك عبر الأنسجة المتعددة وأنظمة الأعضاء. سوف نفحص بنية ووظيفة الأعضاء وأنظمة الأعضاء وكيف يتم التحكم في هذه الأنظمة وتنظيمها للحفاظ على التوازن. يتطلب التحكم والتنظيم معلومات مثل القدرة على الاستجابة للمحفزات البيئية ، لذلك سنولي اهتمامًا خاصًا لأنظمة المعلومات الهرمونية والعصبية. سنهتم أيضًا بالتفاعلات والتكامل بين أنشطة أنظمة الأعضاء المختلفة التي ندرسها. الشروط: لا يوجد. لعام 2021 ، سيتم تسجيل محاضرات Live Zoom ونشرها على Canvas للطلاب الذين يعانون من تعارضات. الحضور في قسم المناقشة الذي يعقد مرة واحدة في الأسبوع إلزامي. لن يكون هناك امتحانات في الدورة. للأسئلة اللوجستية حول الدورة ، يرجى التواصل مع وحيدة خلفان ([email protected]).

السيرة الذاتية 85. التطور. 4 وحدات.

فهم التطور هو المفتاح لفهم تنوع الحياة على الأرض. سنركز على المبادئ الأساسية لعلم الأحياء التطوري من الانتقاء الطبيعي والجنسي إلى تكوين أنواع جديدة. لفهم هذه المفاهيم ، سوف نتعمق في الآليات التي تكمن وراءها. سيربط المساق أيضًا هذه العمليات الأساسية بالموضوعات التطورية المعاصرة المهمة مثل تطور السلوك وتطور تاريخ الحياة والتطور البشري. المتطلبات الأساسية: BIO 60 أو 61 أو 62 أو ما يعادلها موصى بها: BIO 82 ، أو إذن من المعلم.

بيو 86. بيولوجيا الخلية. 4 وحدات.

تركز هذه الدورة على الهياكل الأساسية داخل الخلايا وكيفية تنفيذها للوظائف الخلوية. تشمل الموضوعات العضيات ، والاتجار بالأغشية ، والهيكل الخلوي ، وانقسام الخلايا ، ونقل الإشارة. سيتم دمج الأدب الأساسي الكلاسيكي والحديث في المحاضرات مع التركيز على أحدث الأساليب التجريبية. المتطلبات الأساسية: ينصح بشدة بيو 83.

بيو 89SI. الطب التطوري. 2 وحدة.

لماذا أجهزة الجسم عرضة للأمراض؟ يستكشف هذا المقرر النظريات حول الأساس التطوري للأمراض ، بما في ذلك السرطان والسكري والأمراض النفسية. سيقوم الطلاب الذين لديهم خلفية في علم الوراثة وعلم وظائف الأعضاء والتطور بتجميع هذه المجالات لفهم صحة الإنسان والمرض بشكل أفضل. ستشمل الدورة قراءات ومناقشات حول الأدبيات الأولية.

بيو 8N. أصول بشرية. 3 وحدات.

مسح للأدلة التشريحية والسلوكية للتطور البشري وللمعلومات المتزايدة الأهمية من علم الوراثة الجزيئي. التأكيد على الانقسام بين سلالات الإنسان والشمبانزي منذ 6-7 ملايين سنة ، وظهور الأسترالوبيث قبل 4.1 مليون سنة ، وظهور جنس هومو منذ حوالي 2.5 مليون سنة ، وانتشار الإنسان من أفريقيا 1.7-1.6 مليون منذ سنوات ، الاختلاف اللاحق للإنسان إلى أنواع مختلفة في قارات مختلفة ، وانتشار البشر المعاصرين بالكامل (الإنسان العاقل) من إفريقيا منذ حوالي 50000 عام ليحلوا محل إنسان نياندرتال وغيرهم من الأوراسيين غير المعاصرين.

بيو 8S. مقدمة في فسيولوجيا الإنسان. 4 وحدات.

السير الطبيعي والفيزيولوجيا المرضية لأنظمة الأعضاء الرئيسية: الجهاز العصبي ، والجهاز التنفسي ، والقلب والأوعية الدموية ، والكلى ، والجهاز الهضمي ، والغدد الصماء. تشمل الموضوعات الإضافية علم وظائف الأعضاء التكاملي ودراسات الحالة السريرية والتطبيقات في الطب الشخصي القائم على علم الجينوم.


مارك كون

يعمل مارك كون في الاحتمالات والمعلومات الكمومية ، والمعلوماتية الحيوية ، والتعلم الآلي والإحصائي ، والفيزياء الرياضية ، وعلم الأعصاب الرياضي والحسابي ، ونظرية التعقيد ، والموجات. يركز بحثه الحالي على مجالين.

الأول يتعلق بالاحتمالات الكمومية والحساب الكمي والمعلومات الكمومية. يعد الحساب الكمي بحل بعض مشاكل التحسين طويلة الأمد الناشئة في الإحصاء وعلم الأحياء الحسابي ، بما في ذلك طي البروتين ، وهيكل الحمض النووي الريبي ، ونشاط نسخ الحمض النووي. يرتبط الاحتمال الكمي أيضًا بالأسئلة التي لها تطبيقات في الميكانيكا الإحصائية.

المجال الثاني للدراسة هو في تطبيقات التعلم الآلي للمعلومات الحيوية والبيولوجيا الحسابية ، في مجالات تتراوح من استدلال شبكات تنظيم الجينات إلى تحديد وتصنيف السرطانات على أساس التباين الجيني ، وتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ، و microRNA ، وغيرها من المؤشرات الحيوية. أدت تطبيقات المعلوماتية الحيوية والنسخ للتعلم الإحصائي والآلي في الواقع إلى تحسينات منهجية ونظرية في الأساليب الإحصائية نفسها ، والتي أصبحت مهمة في العديد من جوانب هذه المشاريع البحثية. ترتبط هذه المناطق أيضًا بنظرية التعقيد الإحصائي ، والشبكات العصبية ، والاستدلال البايزي ، حيث توجد قضايا مماثلة بارزة.


شاهد الفيديو: بناء تصنيع البروتين في الخلية: النسخ والترجمةافضل شرح (شهر نوفمبر 2022).