معلومة

ما العلاقة بين القيمة e التي أبلغ عنها HMMER و BLAST؟ (هل هما متكافئان؟)

ما العلاقة بين القيمة e التي أبلغ عنها HMMER و BLAST؟ (هل هما متكافئان؟)


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

يبلغ كل من HMMER و BLAST عن قيمة e للمحاذاة. هل يتم حسابها بنفس الطريقة - وبفرض استخدام الإعدادات الافتراضية - هل يمكن مقارنتها مباشرة (هل هي مكافئة)؟ إذا لم يكن مكافئًا ، فما هي الإعدادات التي يمكن تغييرها لجعلها مكافئة؟


يستخدمون خوارزميات مختلفة جدًا لذا لا ينبغي أن يكون لديهم نفس القيمة الإلكترونية. يستخدم BLAST مصفوفة استبدال مستقلة عن الموضع (مثل BLOSUM) بينما يستخدم HMMER مصفوفة استبدال تعتمد على الموضع تختلف عن كل ملف تعريف. تحقق من قسم "الخلفية والمحفوظات الموجزة" في دليل مستخدم HMMER. يشرح الاختلافات المفاهيمية على مستوى واسع للغاية.

لذلك ، لا أعتقد أن هناك طريقة لجعلها متساوية.


باختصار ، القيمة الإلكترونية هي مقياس إحصائي لمدى احتمالية نشوء تسلسل اهتمامك الصدفة وحدها. هذا التعريف "على مستوى الانضباط" ، لذا يجب الالتزام به من قبل أي برنامج معلوماتية بيولوجية يختار توفيره.

وبالتالي ، كلما كان التسلسل أطول وأكثر تعقيدًا ، كانت قيمة E (الأقل) أفضل عند إجراء محاذاة التسلسل.

على حد علمي ، يجب أن تكون قابلة للمقارنة مباشرة. لا أفهم سبب عدم احتسابهم بالطريقة نفسها تمامًا.

يوضح موقع HMMERs أنه يستخدم نوعين مختلفين من القيمة الإلكترونية ومع ذلك:

ثم هناك قيمتان E للمجال:

القيمة الإلكترونية المشروطة - هذه هي القيمة الإلكترونية التي يُقاس عليها التضمين والإبلاغ عن العتبات المهمة التي يتم قياسها (إذا تم تعريفها على أنها قيم E). القيمة الإلكترونية المشروطة هي محاولة لقياس الأهمية الإحصائية لكل مجال ، بالنظر إلى أنه قد تقرر بالفعل أن التسلسل المستهدف هو متماثل حقيقي. إنه العدد المتوقع للنطاقات أو النتائج الإضافية التي يمكن العثور عليها بنطاق / درجة نتيجة بهذا الحجم الكبير في مجموعة التسلسلات الواردة في قائمة النتائج الأعلى ، إذا كانت تلك التسلسلات تتكون فقط من تسلسل عشوائي غير متماثل خارج المنطقة التي تكفي للتعريف لهم كمتجانسين.

القيمة الإلكترونية المستقلة - هذه هي أهمية التسلسل في بحث قاعدة البيانات بالكامل ، إذا كان هذا هو المجال / النتيجة الوحيدة التي تم تحديدها. إذا لم تكن هذه القيمة الإلكترونية جيدة ، لكن القيمة الإلكترونية للتسلسل الكامل جيدة ، فهذه علامة حمراء محتملة. يتم تلخيص الضربات الضعيفة ، والتي لا يكون أي منها جيدًا بما يكفي من تلقاء نفسها ، لرفع التسلسل إلى درجة عالية.

يمكن العثور على حساب القيمة الإلكترونية عبر بلاست هنا:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html


تحديد الجينوم الأساسي للحلأ واستكشاف علاقتها التطورية مع Caudovirales

يشمل ترتيب Herpesvirales مجموعة واسعة من مسببات الأمراض البشرية المهمة والموزعة على نطاق واسع. خلال العقود الماضية ، أدت أوجه التشابه في الدورة الفيروسية وبنية بعض بروتيناتها مع تلك الموجودة في رتبة Caudovirales ، الفيروسات البكتيرية الذيل ، إلى ظهور تكهنات بشأن وجود علاقة تطورية بين هذه الكتل. لتقييم هذه الفرضية ، استخدمنا أكثر من 600 Herpesvirales و 2000 Caudovirales جينومًا كاملاً للبحث عن وجود أو عدم وجود مجموعات من مجالات البروتين المتعامد وقمنا ببناء مخطط شجري بناءً على أوجه التشابه التركيبية. النتائج التي تم الحصول عليها تشير بقوة إلى وجود علاقة تطورية بين الأمرين. علاوة على ذلك ، سمحوا باقتراح جينوم أساسي لـ Herpesvirales ، يتألف من 4 بروتينات ، بما في ذلك الوحدة الفرعية ATPase من محطة تعبئة الحمض النووي ، وهو البروتين الوحيد الذي تم التحقق منه مسبقًا. وفقًا لذلك ، فإن شجرة النشوء والتطور التي تم إنشاؤها باستخدام تسلسلات مشتقة من المجموعات المرتبطة بهذه البروتينات جمعت سلالات Herpesvirales وفقًا للعائلات والعائلات الفرعية المنشأة. بشكل عام ، يوفر هذا العمل نتائج تدعم الفرضية القائلة بأن الأمرين مرتبطان تطوريًا ويساهمان في فهم تاريخ Herpesvirales.


خلفية

تكمن الشبكات البيوكيميائية أساسًا في جميع الوظائف الخلوية [1 ، 2]. لا تعمل البروتينات وحدها. بدلاً من ذلك ، يتواصلون مع بعضهم البعض لتشكيل مسارات ، مثل شلالات MAP kinase ومسار تحلل السكر. غالبًا ما تكون الوصلات عبارة عن تفاعلات بروتينية فيزيائية مباشرة أو علاقات إنزيمية ركيزة. يمكن أن تكون أيضًا غير مباشرة. على سبيل المثال ، عادةً ما ترتبط الإنزيمات الأيضية من خلال سلسلة من التفاعلات الكيميائية الحيوية التي تحفزها ، على الرغم من أن الإنزيمات قد لا تكون مرتبطة ماديًا ببعضها البعض. وتتحد المسارات بدورها معًا لتشكل شبكات ، مثل الإشارات وشبكات التمثيل الغذائي. من خلال هذه الشبكات ، تؤدي المعلومات الجينية إلى ظهور الوظائف الخلوية ويتم ترجمة الأنماط الجينية إلى أنماط ظاهرية. وبالتالي ، عملت نماذج الشبكة البيوكيميائية لفترة طويلة بشكل فعال كمنصات لتحليل البيانات التجريبية عالية الإنتاجية ، على سبيل المثال ، المصفوفة الدقيقة أو بيانات التعبير الجيني القائمة على التسلسل من الجيل التالي [3 & # x020135].

فئة بارزة من المكونات في الشبكات الكيميائية الحيوية هي البروتينات المشفرة بواسطة جينات مكررة ، وتسمى أيضًا paralogs [6]. نشأت الجينات المكررة من أحداث الازدواج الجينومي ، والتي يمكن أن تكون تكرار الجينوم الكامل (WGD) أو الازدواج على نطاق صغير (SSD). الازدواجية الجينومية هي القوة الدافعة الرئيسية للتطور البيولوجي [6 & # x020138]. وبالتالي ، فإن بروتينات الجينات المكررة وفيرة في الشبكات البيوكيميائية. علاوة على ذلك ، تزداد وفرتها جنبًا إلى جنب مع التعقيد الجينومي ، والذي يتم قياسه من خلال حجم الجينوم ، وعدد الجينات ، ووفرة الإنترونات الوراثية والعناصر الوراثية المتنقلة ، من حقيقيات النوى البكتيرية إلى أحادية الخلية ، إلى الأنواع متعددة الخلايا [9]. تعمل بروتينات الجينات المكررة وتتطور في شبكات الكيمياء الحيوية [10 ، 11]. كثيرًا ما يتم تحليل تطور الجينات المكرر في سياق الشبكات البيوكيميائية ، مثل شبكات تفاعل البروتين والبروتين [12 & # x0201314] وشبكات التمثيل الغذائي [15 ، 16] ، بالإضافة إلى الشبكات البيولوجية الأخرى [17 ، 18].

القضية الحاسمة هي ازدواجية الجينات. يلتقط هذا المصطلح نمط تكرار الجينات الانتقائي الذي لوحظ عالميًا في الجينوم المتسلسل [19 & # x0201322]. يحتوي جزء صغير من الجينات في الجينوم على أعداد مكررة عالية بشكل غير عادي ، في حين أن الغالبية العظمى إما فردية أو لديها عدد قليل من التكرارات. بمعنى آخر ، يتم توسيع عدد صغير من عائلات الجينات بشكل انتقائي أثناء عملية التطور الجيني. من الناحية الكمية ، غالبًا ما يتم وصف هذه الظاهرة بعلاقة قانون القوة بين عدد الجينات (P(ك)) مع تكرارات K والعدد المكرر K ، P(ك) & # x0221d k - & # x003b1 ، مع & # x003b1 كثابت موجب. هذه العلاقة صحيحة بغض النظر عن طرق الكشف عن الجينات المكررة التي تم استخدامها جميعًا ، تم استخدام طرق FASTA و BLAST بالإضافة إلى طرق تعتمد على مجال البروتين [19 ، 22 & # x0201324]. علاوة على ذلك ، فإن هذه العلاقة صحيحة في الجينومات البكتيرية وحقيقية النواة ومتعددة الخلايا ، ويمكن استخدام التغييرات في قيمة & # x003b1 لتقدير إثراء الجينات المكررة مع زيادة التعقيد الجينومي [22]. نحن نحدد قابلية التكرار الجيني عمليًا ، كما هو شائع ، مثل عدد التكرارات التي يمتلكها الجين أو حجم عائلة الجين في الجينوم [25 & # x0201328] ، على الرغم من وجود تعريفات مختلفة قليلاً أيضًا [29].

كيف ولماذا ظهر نمط تكرار الجينات الانتقائي الموصوف أعلاه؟ يجب أن يساهم عاملان متناقضان بشكل كبير: فرصة استنباط مواد وراثية جديدة من تلك الموجودة والحاجة إلى تقليل الآثار الضارة لتكرار الجينات. الأول هو الميزة التطورية التي يمنحها الازدواج الجيني للأنواع. سيكون للجين في المناطق المكررة نسختان. في وقت لاحق ، زوج من الجينات المكررة سوف تتراكم الطفرات. في كثير من الأحيان ، شكلت إحدى النسختين جينًا زائفًا ، وأصبحت صامتة [6 ، 30]. والأهم من ذلك ، أن الطفرات أدت في بعض الأحيان إلى التنويع الوظيفي ، إما وظيفية جديدة أو فرعية ، بين الزوجين [7 ، 22 ، 31 ، 32]. يمكن أن يكون هذا الاختلاف في أنماط التعبير المكاني والزماني ، أو شركاء التفاعل ، أو الخصائص الأنزيمية لبروتيناتهم أو المواقع الخلوية لبروتيناتهم ، وما إلى ذلك. & # x02013 الآثار الضارة المحتملة لازدواج الجينات بسبب اختلال التوازن المتكافئ بين منتجات البروتين من الجينات المكررة وغير المكررة [28 ، 33 ، 34]. على سبيل المثال ، النسب المحددة بين الوحدات الفرعية مطلوبة لتكوين مجمعات البروتين ، والتي تعد مكونات رئيسية للشبكات البيوكيميائية. ما لم تتكرر جميع الجينات الخاصة بكل وحدة فرعية ، فإن حدث الازدواج الجيني من شأنه أن يخل بالتوازن. من شأن التفعيل السريع الجديد أو الفرعي بين النسختين أن يعيد التوازن المتكافئ ويخفف من قيود جرعات الجين ، وبالتالي تعزيز قابلية الجين للازدواجية. على سبيل المثال ، في الجينومات متعددة الخلايا ، ارتبط التنويع الوظيفي المعزز من خلال تراكم الإنترونات بمعدلات بقاء أعلى للجين المضاعف [9 ، 35].

وبالتالي ، فإن التنويع الوظيفي للجينات المكررة لا يعزز الابتكار الوظيفي الجينومي فحسب ، بل يخفف أيضًا من التأثير الضار المحتمل لتكرار الجينات. من المحتمل جدًا أن يكون توسع عائلة الجينات الانتقائية والتنويع المعزز داخل العائلات المتوسعة قد سارا جنبًا إلى جنب بشكل لا ينفصم. بعبارة أخرى ، يجب أن تكون الجينات المضاعفة في العائلات الجينية الأكبر قد تباعدت عن بعضها البعض إلى حد أعلى من تلك الموجودة في العائلات الأصغر. من أجل الاتساق مع استخدام & # x0201cduplicability & # x0201d للإشارة إلى ميل الجين إلى التكرار (معدل التكرار واستمرار البقاء على قيد الحياة) [27] ، نستخدم المصطلح & # x0201cdiversifiability & # x0201d كمصطلح شقيق له تشير إلى ميل الجينات المكررة للخضوع للتنويع (وظائف جديدة أو فرعية). على غرار التكرار الذي يتم حسابه تشغيليًا مثل عدد التكرارات التي يمتلكها الجين أو حجم عائلة الجينات المكررة ، يمكن حساب التنويع على أنه درجة التنويع بين الجينات المكررة. افترضنا وجود ارتباطات إيجابية بين قابلية التنويع الجيني والتنوع.

يتطلب اختبار الفرضية قياس التنويع الكمي للجينات المكررة. تم استخدام ثلاثة مقاييس في هذه الدراسة. تم تطوير اثنين منهم في سياق الشبكة البيوكيميائية ، أحدهما يقيس مدى تباعد الجينات المكررة بشكل كافٍ لبروتيناتها للمشاركة في مسارات معادية بشكل متبادل في شبكة ، والآخر هو أقصر مسافة شبكة بين بروتينات الجينات المكررة. كمقياس ثالث ، تم استخدام معامل التجميع القائم على تسلسل البروتين لتحديد تباعد التسلسل بين الجينات المكررة. أبلغنا ، لكل من المقاييس الثلاثة ، عن ارتباط إيجابي بين قابلية التنويع الجيني والتنوع.


8 إجابات 8

مجموعة من الأفكار حول هذا:

  • تم تحديد معظم تاريخ Stack Overflow من خلال البحث المحموم عن & quott تلك الخدعة الغريبة التي من شأنها أن تجلب ، وليس الربحية ، ولكن تضخم بشكل كبير. أنت تعرف نوع الشيء الذي تشتريه شركة صغيرة مقابل مليار أو نحو ذلك. الذي - التي. يؤدي إلى بعض التفكير السيئ قصير المدى. قاد. أدى إلى بعض التفكير السيئ قصير المدى. يمكن أن تؤدي الكثير من العوامل الأخرى بالطبع إلى التفكير السيئ قصير المدى. لكن على الأقل هناك عامل واحد أقل في اللعب الآن.
  • هذا المالك الجديد مشترك بالفعل في الفضاء التعليمي للبرامج. وهو ما يشبه القول بأنهم في معول & quotselling للمنقبين & quot الفضاء. هذا ليس مناسبًا لـ SO ، أو بالأحرى استطاع يكون مناسبا ل SO. لكن ، يمكن أن تصبح هذه الأنواع من الأشياء بسهولة أكثر طفيلية من كونها تكافلية. من الأهمية بمكان مراقبة هذا التوازن حتى ينقلب. انتبه: قد يكون بقشيش ل أنت شخصيًا قبل فترة طويلة من النصائح كل واحد.
  • لن يتحدث أحد عن تغيير الخطط الآن. لا احد علبة تغيير الخطط الآن. الأفضل للجميع إذا كانت & quot؛ البقاء في الدورة & quot هي الرسالة المتسقة. هذا الإعلان هو بداية وليس خاتمة. توقع أن تتغير الخطط بشكل كبير بعد فترة وجيزة من الانتهاء من ذلك ، مع المزيد من التغييرات الدراماتيكية القادمة مع صرف الإدارة الحالية مع مرور الوقت. ماذا او ما سيتغير هو تخمين أي شخص. افترض أن هناك سببًا للشراء ، وهو جزء مهم وفريد ​​من نوعه يراه المالك الجديد ويرغب في رعايته. ربما من الآمن أيضًا افتراض أنها ليست Teams في شكلها الحالي.
  • هذا يبدو واضحا ، ولكن. توقع المزيد من الانقطاع في الأشخاص الذين يعملون في الشركة أثناء تفاعلهم معك جميعًا. لقد غادر أشخاص لوتا بالفعل على مدار السنوات القليلة الماضية ، وقد شعروا بذلك - حسنًا ، التغيير في الملكية يميل إلى عدم توقف ذلك. لا يتعلق هذا فقط بمن تتحدث إليه عندما ترسل بريدًا إلكترونيًا للدعم ، فقد يكون له تأثيرات خفية وبعيدة المدى على ما يتم إنجازه وكيفية القيام به وكيفية توصيله. يمكن أن تكون هذه التأثيرات جيدة - أعتقد أننا رأينا جميعًا بعض الجوانب الإيجابية لـ بعض التحولات الأخيرة - ولكن هناك إرادة يكون التغيير.
  • أكثر من أي شيء آخر ، أصبح الموقع الآن منتجًا. هذا ليس تعبيرًا ملطفًا اشتراه شخص ما ، إنه منتج ، لقد اشتروه لغرض ما ، تمامًا مثل الرجل الذي يشتري سكين شريحة لحم ولكنه يحتاج إلى منشار إرادة انظر إلى قطع 2 × 4 حتى لو استغرق الأمر طوال الليل. سيخدم المنتج غرض المشتري. الموقع الذي رأيناه ينبثق منذ 13 عامًا ، وكان هدفه الأول والأساسي هو تسهيل التواصل بين المبرمجين. هذا ليس ما هذا بعد الآن. قد تستمر في أداء هذا الدور - أتمنى ذلك بالتأكيد! - لكن هذا رسميًا ، ليس سببًا محددًا لوجودها.

نشأ Stack Overflow. مثل CodeGuru ، مثل LiveJournal ، مثل GitHub ، مثل كثيرين آخرين. لقد ولت براءة المراهقين ، وما يحدث الآن يجب أن يحدث بقصد وهدف. سيتعين علينا أن نرى ما يعنيه ذلك في النهاية.

إخلاء المسؤولية

  1. ليس لدي معرفة من الداخل. هذا مجرد تخمين ورأي
  2. هناك احتمال أن أستفيد مالياً من هذا البيع. لذا ، تعلم ، خذ الأشياء الإيجابية أعلاه بحبة ملح.
  3. هناك احتمال أن أكون متعود الاستفادة على الإطلاق من هذا البيع. لذا ، تعلم ، خذ الأشياء السلبية أعلاه كعنب حامض.
  4. توقف - هل رأيت هذا الوميض في السماء؟ هل كانت تلك طائرة أم. قمر صناعي؟
  5. إن محاولة التنبؤ بالمستقبل أمر ممتع دائمًا ، ودائمًا لا طائل من ورائه. الحروب وشائعات الحروب.

إن TLDR ليس كثيرًا هذا العام. لدينا استراتيجيتنا الحالية وخرائط الطريق والخطط لهذا العام وما زلنا نركز عليها. إنه عمل كالمعتاد ، كما ورد في منشور المدونة الخاص بنا ، سنعمل بشكل مستقل. فريق القيادة باق ، بما فيهم أنا. اكتشفت معظم الشركات هذا الأمر للتو اليوم والعديد منهم في حالة صدمة ومتحمسون بشأن المستقبل. يركز برنامج Prosus على المجتمع بشكل كبير ومتحمس لما قمت ببنائه جميعًا. مع بدء التخطيط لعام 2022 ، أعتقد أننا سنرى المزيد من الفرص للاستثمار في مواقع ومجتمع منصتنا العامة. سوف أنشر مدونة حالة Stack الخاصة بي ومنشور التعريف هذا الشهر وسأخوض في مزيد من التفاصيل هناك.

في الوقت الحالي ، إذا كنت تريد معرفة المزيد ، فلدينا المزيد من التفاصيل حول منشور المدونة الخاص بنا

الحالة المتشائمة هي شيء من هذا القبيل:

أنفقت الشركة الجديدة مبلغًا ضخمًا من المال على Stack Overflow and Want النتائج. هذا يعني بيع إجاباتنا مرة أخرى ، أو فرض رسوم عضوية أو تنشيط الإعلانات. مهما قرروا القيام به ، فإنه سيعطي الأولوية لكسب المال على المجتمع الذي جعل هذه المواقع ذات قيمة.

من الواضح أن استطاع يحدث. إذا كان الأمر كذلك ، فسيكون ذلك مخيبا للآمال على أقل تقدير. ومع ذلك ، فإن السؤال هو ما الذي تتوقعه الشركة من استثمار بقيمة 1.8 مليار دولار؟

شركة Prosus هي شركة قابضة. ربما تكون أشهر شركة قابضة هي شركة Warren Buffett's Berkshire Hathaway. (الإفصاح: أنا مستثمر في بيركشاير. لدي أيضًا خيارات مكتسبة في Stack Overflow منذ وقتي كموظف.) تشير مدونة Joel Spolsky إلى أنه سيتم السماح لشركة Stack Overflow بالعمل بشكل مستقل ، وهو أمر غير معتاد بالنسبة لشركة قابضة. تتمثل الكفاءة الأساسية للشركة القابضة في تخصيص الموارد للشركات التابعة الواعدة بدلاً من إدارتها بفعالية.

من المحتمل جدًا أن تدخل Stack Overflow في قسم & quotVentures & quot الذي يتضمن:

يعطينا التقرير السنوي للشركة بعض الأدلة حول نواياهم:

تدور المشاريع حول بناء الموجة التالية من النمو للمجموعة. نحن نستثمر مع وضع رؤية طويلة الأجل في الاعتبار ولكن تأكد من ربط هذه الرؤية بحقائق التشغيل قصيرة ومتوسطة المدى حول المخاطر والديناميكيات التنافسية واحتياجات رأس المال المستقبلية واعتبارات أخرى. تتناسب التزاماتنا الرأسمالية مع هذا التقييم المتوازن. بمرور الوقت ، بينما نبني فهمنا وخبرتنا ، قد تنمو المبالغ المستثمرة بشكل كبير. وخير مثال على هذا النهج هو Food Delivery ، الذي تمت رعايته كجزء من Ventures قبل أن يصبح قطاعًا أساسيًا قائمًا بذاته العام الماضي. - Martin Tschopp COO، Ventures

من خلال اختراق حديث الأعمال ، فإن هذا يعني أن قطاع المشاريع يأمل في الاستثمار في الشركات التابعة حتى تصبح مربحة في السنوات المقبلة. خلال السنوات القليلة الماضية ، كان مستثمرو Stack Overflow يبحثون عن مخرج. الآن يتطلع المستثمرون لبناء القيمة. إنه تغيير حقيقي في الحوافز التي من المحتمل أن تكون إيجابية صافية للأشخاص الذين يستفيدون من المعلومات المربوطة في الشبكة. (هذا يعني لنا!)

من المهم أن نتذكر أن مساهمات CC BY-SA يمكن استخدامها من قبل أطراف ثالثة. يمكن لأي شخص تنزيل البيانات وإنشاء موارده الخاصة. لذا فإن 1.8 مليار دولار لا تتعلق بالمحتوى. بدلاً من ذلك ، تأتي القيمة من:

  1. العلامة التجارية،
  2. رمز الملكية ،
  3. الموظفين الذين يواصلون العمل في الشركة و
  4. الاتصال بمجتمع المساهمين.

في رأيي ، يقلل هذا الاستحواذ من احتمالات أن تصبح Stack Overflow مظلمة. هناك حافز للاستمرار في الاستثمار حتى لو كانت حقائق التشغيل قصيرة ومتوسطة المدى حول المخاطر والديناميكيات التنافسية واحتياجات رأس المال المستقبلية واعتبارات أخرى تمنع بروسوس من زيادة استثماراتهم.

الآن لا تزال هناك مخاطر. لسبب واحد ، لم يذكر أي من الإعلانات Stack Exchange. لا شيء يقول أن المالك الجديد سيكون أفضل من المالك الحالي في التعرف على إمكانات أسئلة وأجوبة غير مشفرة. أنا أيضًا قلق بشكل معتدل بشأن سطر من بيان صحفي لـ Prosus:

& quot

ومع ذلك ، من المرجح أن يسير التأثير في الاتجاه الآخر. بالصدفة ، أجريت مقابلة مع CM في Brainly قبل بضعة أسابيع.أثناء حديثنا ظللت أفكر في وجود انسجام محتمل بين موقع مخصص للمساعدة في الواجبات المنزلية (Brainly) وشبكة تشك في أسئلة الواجبات المنزلية (Stack Exchange). مرة أخرى ، الشركات القابضة أفضل من معظم الشركات في السماح لبعض الشركات التابعة بقدر من الاستقلالية.

أظن أن شركة كبيرة متعددة الجنسيات ستكون بمثابة تحسين للموظفين غير الأمريكيين و Stack Overflows الدولية. (ربما تكون أكثر ودية مع الصين).

من بين جميع الخيارات (الاكتتاب العام أو الاستحواذ أو الوضع الراهن) يبدو أن هذا هو أفضل نتيجة. لم تعد الإدارة بحاجة إلى وضع أحمر الشفاه على الخنزير. لن يحتاجوا إلى قضاء الوقت في البحث عن مستثمرين. لن يكون أداؤهم مرتبطًا بالنمو ربع السنوي (على الأقل ليس فورًا). لا أحد يجب أن يقلق بشأن قيام الشركة بعمل كشوف رواتب. لا أعرف الكثير عن Prosus ، لكن يبدو أنه منزل جيد مثل أي منزل.


الهدف من التحليل التفاضلي هو العثور على تلك المركبات التي تظهر اختلافًا في الوفرة بين مجموعات التجربة ، مما يدل على أنها قد تشارك في بعض العمليات البيولوجية التي تهم الباحث. بسبب الصدفة ، سيكون هناك دائمًا بعض الاختلاف في الوفرة بين المجموعات. ومع ذلك ، فإن حجم هذا الاختلاف بالمقارنة مع التباين (أي النطاق الذي تقع فيه قيم الوفرة) هو الذي سيخبرنا ما إذا كان هذا الاختلاف في الوفرة كبيرًا أم لا. وبالتالي ، إذا كان الاختلاف كبيرًا ولكن التباين كبير أيضًا ، فقد لا يكون الاختلاف كبيرًا. من ناحية أخرى ، قد يكون الاختلاف الصغير المقترن بتباين صغير جدًا كبيرًا. نستخدم اختبارات Anova لإضفاء الطابع الرسمي على هذا الحساب. تُرجع الاختبارات قيمة p تأخذ في الاعتبار متوسط ​​الفرق والتباين وكذلك حجم العينة. القيمة p هي مقياس لمدى احتمالية حصولك على هذه البيانات المركبة إذا لم يكن هناك فرق حقيقي. لذلك ، تشير القيمة الاحتمالية الصغيرة إلى وجود فرصة ضئيلة للحصول على هذه البيانات إذا لم يكن هناك فرق حقيقي ، وبالتالي قررت أن الاختلاف في بيانات وفرة المجموعة كبير. نعني بالصغير عادة احتمال 0.05.

ما هي قيم q ولماذا هي مهمة؟

ايجابيات مزيفة

النتيجة الإيجابية هي نتيجة مهمة ، أي أن القيمة الاحتمالية أقل من القيمة المقطوعة ، عادةً 0.05. الإيجابي الكاذب هو عندما تحصل على فرق كبير حيث لا يوجد في الواقع أي فرق. كما ذكرت أعلاه ، فإن القيمة p هي فرصة حدوث هذه البيانات نظرًا لعدم وجود فرق بالفعل. لذا ، فإن اختيار قطع قدره 0.05 يعني أن هناك فرصة بنسبة 5٪ لاتخاذ قرار خاطئ.

مشكلة الاختبار المتعدد

عندما نضع حدًا للقيمة p ، على سبيل المثال ، 0.05 ، فإننا نقول إن هناك احتمال بنسبة 5٪ أن تكون النتيجة إيجابية خاطئة. بعبارة أخرى ، على الرغم من أننا وجدنا نتيجة ذات دلالة إحصائية ، إلا أنه في الواقع ، لا يوجد فرق في مجموعة الوسائل. في حين أن نسبة 5٪ مقبولة لاختبار واحد ، إذا أجرينا الكثير من الاختبارات على البيانات ، فإن هذه النسبة 5٪ يمكن أن تؤدي إلى عدد كبير من الإيجابيات الخاطئة. على سبيل المثال ، إذا كان هناك 2000 مركب في التجربة وقمنا بتطبيق Anova أو اختبار t لكل منهما ، فإننا نتوقع أن نحصل على 100 (أي 5٪) من الإيجابيات الخاطئة بالصدفة وحدها. يُعرف هذا بمشكلة الاختبار المتعدد.

الاختبارات المتعددة ومعدل الاكتشاف الخاطئ

في حين أن هناك عددًا من الأساليب للتغلب على المشكلات الناتجة عن الاختبارات المتعددة ، فإنهم جميعًا يحاولون تعيين قيمة p معدلة لكل اختبار أو تقليل عتبة القيمة p من 5٪ إلى قيمة أكثر منطقية. العديد من التقنيات التقليدية مثل تصحيح Bonferroni متحفظة للغاية ، بمعنى أنها تقلل عدد الإيجابيات الخاطئة ، ولكنها تقلل أيضًا من عدد الاكتشافات الحقيقية. نهج معدل الاكتشاف الخاطئ هو تطور أحدث. يحدد هذا النهج أيضًا قيم p المعدلة لكل اختبار. ومع ذلك ، فإنه يتحكم في عدد الاكتشافات الخاطئة في تلك الاختبارات التي تؤدي إلى اكتشاف (أي نتيجة مهمة). وبسبب هذا ، فإن نهج Bonferroni أقل تحفظًا ولديه قدرة أكبر (أي القوة) على إيجاد نتائج مهمة حقًا.

هناك طريقة أخرى للنظر إلى الفرق وهي أن القيمة الاحتمالية البالغة 0.05 تعني أن 5٪ من جميع الاختبارات ستؤدي إلى نتائج إيجابية خاطئة. تشير القيمة الاحتمالية المعدلة (أو القيمة q) البالغة 0.05 إلى FDR إلى أن 5٪ من الاختبارات المهمة ستؤدي إلى نتائج إيجابية خاطئة. هذا الأخير سيؤدي إلى عدد أقل من الإيجابيات الخاطئة.

Q- القيم

قيم Q هي الاسم الذي يطلق على قيم p المعدلة التي تم العثور عليها باستخدام نهج FDR محسّن. تم تحسين نهج FDR باستخدام خصائص توزيع القيمة p لإنتاج قائمة من القيم q. فيما يلي ، سوف أقوم بربط بعض الأفكار وآمل أن يساعد ذلك في توضيح ما قلناه عن قيم p و q.

من المعتاد اختبار عدة مئات أو آلاف من المتغيرات المركبة في تجربة الأيض. كل من هذه الاختبارات ستنتج قيمة p. تأخذ القيم p قيمة بين 0 و 1 ويمكننا إنشاء مدرج تكراري للحصول على فكرة عن كيفية توزيع قيم p بين 0 و 1. يتم عرض بعض التوزيعات النموذجية للقيمة p أدناه. على المحور x ، لدينا أشرطة مدرج تكراري تمثل قيم p. يبلغ عرض كل شريط 0.05 وهكذا في الشريط الأول (أحمر أو أخضر) لدينا قيم p التي تتراوح بين 0 و 0.05. وبالمثل ، يمثل الشريط الأخير تلك القيم p بين 0.95 و 1.0 ، وهكذا. يعطي ارتفاع كل شريط إشارة إلى عدد القيم الموجودة في الشريط. يسمى هذا بتوزيع الكثافة لأن مساحة جميع الأشرطة تضيف دائمًا ما يصل إلى 1. على الرغم من أن التوزيعين يظهران مختلفين تمامًا ، ستلاحظ أنهما يستويان باتجاه يمين المدرج التكراري. يمثل الشريط الأحمر (أو الأخضر) القيم المهمة ، إذا قمت بتعيين حد قيمة p 0.05.

الآن ، قيم q هي ببساطة مجموعة من القيم التي تقع بين 0 و 1. أيضًا ، إذا طلبت قيم p المستخدمة لحساب قيم q ، فسيتم ترتيب قيم q أيضًا. يمكن ملاحظة ذلك في لقطة الشاشة التالية من ملاحظة Progenesis CoMet أنه يمكن تكرار قيم q:

لتفسير قيم q ، تحتاج إلى إلقاء نظرة على القائمة المرتبة لقيم q. يوجد 3516 مركب في هذه التجربة. إذا أخذنا المركب المجهول 1723 كمثال ، فسنجد أن له قيمة p تساوي 0.0101 وقيمة q تساوي 0.0172. تذكر أن القيمة الاحتمالية البالغة 0.0101 تدل على احتمال 1.01٪ للإيجابيات الخاطئة ، وبالتالي مع 3516 مركبًا ، نتوقع حوالي 36 من الإيجابيات الخاطئة ، أي 3516 × 0.0101 = 35.51. في هذه التجربة ، يوجد 800 مركب بقيمة 0.0101 أو أقل ، وبالتالي فإن 36 منها ستكون إيجابية خاطئة.

من ناحية أخرى ، فإن قيمة q هي 0.0172 ، مما يعني أننا يجب أن نتوقع أن تكون 1.72٪ من جميع المركبات ذات القيمة q أقل من هذه إيجابية كاذبة. هذا وضع أفضل بكثير. نحن نعلم أن 800 مركب لها قيمة q تساوي 0.0172 أو أقل ، لذا يجب أن نتوقع 800 × 0.0172 = 13.76 إيجابيات خاطئة بدلاً من 36 متوقعة. فقط للتكرار ، الإيجابيات الخاطئة وفقًا لقيم p تأخذ جميع قيم 3516 في الاعتبار عندما تحديد عدد الإيجابيات الخاطئة التي يجب أن نتوقع رؤيتها بينما تأخذ قيم q في الاعتبار فقط تلك الاختبارات التي تحتوي على قيم q أقل من العتبة التي نختارها. بالطبع ، ليست الحالة دائمًا أن القيم q ستؤدي إلى نتائج إيجابية أقل خطأ ، ولكن ما يمكننا قوله هو أنها تعطي مؤشرًا أكثر دقة لمستوى الإيجابيات الخاطئة لقيمة حدية معينة.

عند إجراء الكثير من الاختبارات ، كما هو الحال في تجربة الأيض ، يكون من البديهي تفسير قيم p و q من خلال النظر إلى قائمة القيم بأكملها بهذه الطريقة بدلاً من النظر إلى كل منها على حدة. بهذه الطريقة ، يكون للعتبة 0.05 معنى عبر التجربة بأكملها. عند اتخاذ قرار بشأن قيمة حدية أو حدية ، يجب عليك القيام بذلك من وجهة نظر عدد الإيجابيات الخاطئة التي سينتج عنها هذا ، بدلاً من مجرد الاختيار العشوائي لقيمة p- أو q بقيمة 0.05 والقول أن كل مركب به قيمة p أقل وهذا أمر مهم.


أدوات لتحديد الهوية

يتضمن UNITE العديد من الأدوات التي تساعد في تحديد التسلسلات غير المعروفة. نظرًا لأن التحديد القاطع هو الهدف الرئيسي وراء UNITE ، فإن تنفيذ الأدوات التي تتجاوز عمليات البحث عن التشابه البسيطة (كما هو متاح من خلال التفجير وأشكاله المختلفة) كان جزءًا أساسيًا من تطوير قاعدة البيانات. تم تلبية هذا المطلب من خلال تطوير galaxie (Nilsson وآخرون، 2004) ، والذي يسمح بإجراء تحليلات أساسية لتطور النشوء والتطور على شبكة الإنترنت. يوفر Galaxie أقصى قدر من الاستدلال على مجريات الأمور وتحليلات الانضمام إلى الجار في ظل نماذج تطورية مختلفة. حتى الآن ، تم تنفيذ مجرتين (galaxie blast ، galaxieHMM) ونص واحد للانفجار. نوصي باستخدام galaxie blast باعتباره الأداة الأكثر ملاءمة لتحديد تسلسل أنظمة النقل الذكية غير المعروفة. سيتم النظر في طرق تحديد أخرى لإدراجها في المستقبل. نؤكد مرة أخرى أن قاعدة بيانات UNITE ، في شكلها الحالي ، تقتصر على تسلسلات ITS الخاصة بفطريات ECM ، ولا يُنصح بإدخال تسلسل الاستعلام من الفطريات الأخرى التي لا تغطيها قاعدة البيانات (الفطريات الفطرية أو الطفيلية) لأسباب واضحة. يقدم الشكل 1 لمحة عامة عن عملية تحديد الهوية واسترجاع البيانات.

مركب من لقطات شاشة تعرض بعض ميزات UNITE. (أ) داخل الصفحة الرئيسية UNITE ، يمكن أن تخضع تسلسلات ITS إما للبحث عن الانفجار مقابل قاعدة البيانات أو لمزيد من التحليلات التطورية من خلال انفجار galaxie أو وحدة galaxieHMM. (ب ، ج ، د) في صفحات نتائج البحث عن المجرات وأفضل التطابقات والأصناف النهائية ، على التوالي ، لها روابط تفاعلية لبيانات العينة. (هـ) تحتوي أسماء الأنواع في صفحة المخرجات النهائية على روابط تفاعلية لوصف الأنواع إذا كانت متاحة. (و - ط) يتضمن وصف الأنواع نصًا بالإضافة إلى مواد توضيحية وروابط إلى قاعدة بيانات التسمية الطبيعية Cortbase.

انفجار المجرة

يستخدم galaxie blast التسلسل الوارد كاستعلام في بحث n blast مقابل بيانات UNITE. إما أن أفضل 15 مباراة (وفقًا لتقدير ه value) أو أفضل ثلاث مطابقات متبوعة بـ 12 تطابقًا مختلفًا بشكل متبادل ه يتم جمع القيم ، ويمكن استخدام الخيار الأخير لتقليل تأثير التسلسلات المتطابقة على التحليل. من المحتمل أن يؤدي تضمين عدد كبير جدًا من المتواليات المتطابقة في تحليل النشوء والتطور إلى وجود شجرة ذات دقة قليلة ، إن وجدت. تعتبر هذه الأشجار بشكل عام غير آمنة لاستنتاج ارتباط التسلسل. تتم محاذاة التطابقات وتسلسل الاستعلام في العنقودية W (Thompson وآخرون. ، 1994) للتحليل الوراثي المشترك في phylip (Felsenstein ، 1993) ، باستخدام إما انضمام الجار أو معيار أمثل البخل. تتميز تحليلات التطور الوراثي بإضافة تسلسل عشوائي ، وتأصيل خارج المجموعة ، وإقلاع التمهيد ومبادلة الفروع (البخل). يتم عرض نتائج الانفجار وشجرة النشوء والتطور مع المحاذاة المتعددة.

GalaxieHMM

تُستخدم حزمة hmmer (Eddy ، 1998) لحساب نماذج Markov المخفية (HMMs) لمصفوفات النيوكليوتيدات المصممة مسبقًا. في الوقت الحاضر هناك أربعة محاذاة من هذا القبيل: واحد من أجل Hymenoscyphus ericae (Ascomycetes، Helotiales) يتجمع وثلاثة للفطريات المستأنسة (الأجناس) بسيودوتومينتيلا, ثليفورا, تومينتيلا و تومينتيلوبسيس). تتم مقارنة تسلسل الاستعلام مع كل من HMMs إذا كان ينتج تطابقًا كبيرًا مع أي من المحاذاة ، يتم تحديد محاذاة المطابقة (الأفضل) بشكل كبير لتحليل النشوء والتطور ، والذي يشبه الإجراء الخاص بانفجار galaxie. للحصول على قيم العتبة للدلالة على التطابق مقابل عدم التطابق ، تمت مطابقة 30 تسلسلًا للمجموعة و 30 مجموعة خارجية (إن أمكن) مع HMMs وتم تحديد قيم القطع المناسبة. يفتح استخدام المحاذاة المعدلة يدويًا إمكانية استخدام galaxieHMM للحصول على تقديرات دقيقة جدًا لموضع التسلسل ضمن مجموعة من المتواليات ، لا سيما على مستوى الجنس أو العائلة. نحن بصدد إضافة المزيد من المحاذاة العامة.

البحث عن تشابه الانفجار

من أجل تشابه التسلسل ، ابحث عن برنامج blast n (Altschul وآخرون. ، 1997) في UNITE. يعتمد هذا البرنامج المجاني على خوارزمية الانفجار ويستخدمه NCBI والعديد من قواعد البيانات الأخرى. الافتراضي ه (توقع) يتم تعيين حد القيمة لبحث التشابه على 1ه−80. صرامة الافتراضي ه تمثل القيمة محاولة لاستبعاد التسلسلات المطابقة الضعيفة.


مقدمة

في العقود الماضية ، نظرًا لفعاليته وتكلفته المعقولة ، مثل الكلوروكين أفضل الأدوية المضادة للملاريا وأكثرها استخدامًا. لسوء الحظ ، في غضون عقد من تقديمه ، المتصورة المنجلية لوحظت مقاومة الطفيليات للكلوروكين في معظم البلدان الموبوءة بالملاريا. في الوقت الحاضر ، يعتبر تمرد المقاومة ضد الكلوروكين عقبة كبيرة أمام مكافحة الملاريا [1].

في مرحلة كريات الدم الحمراء ، المتصورة المنجلية يغزو خلايا الدم الحمراء حيث يشكل حجرة حمضية معزولة من الليزوزومات تعرف بالفجوة الهضمية (DV). في كريات الدم الحمراء ، ينمو الطفيل عن طريق تناول الهيموجلوبين من العصارة الخلوية المضيفة وإيداعه في DV ، حيث يتحلل البروتين إلى مكونه من الببتيدات والهيم ، والذي يتم دمجه في هيموزوين بوليمر خامل وغير ضار [2].

الكلوروكين هو قاعدة ضعيفة ثنائية البروتونات ، وفي درجة الحموضة الفسيولوجية (∼7.4) ، يمكن العثور عليه في أشكاله غير البروتونية (CQ) ، أحادي البروتونات (CQ +) وثنائي البروتونات (CQ ++). الكلوروكين غير المشحون هو الشكل الوحيد للغشاء المنفذ للجزيء وينتشر بحرية في كريات الدم الحمراء حتى DV. في هذا الجزء ، تصبح جزيئات الكلوروكين بروتونية ، وبما أن الأغشية غير منفذة للأنواع المشحونة ، فإن الدواء يتراكم في الفجوة الهضمية الحمضية [3] ، [4] حيث يُعتقد أنه يربط الهيماتين ، وهو منتج ثانوي سام لتحلل بروتين الهيموجلوبين [3] ، [4] 5] ، [6] ، منع اندماجها في بلورة الهيموزوين [2] ، [7] ، [8] ، [9] ، [10]. يبدو أن الهيماتين الحر يتداخل مع عمليات إزالة السموم من الطفيليات وبالتالي يتلف أغشية البلازموديوم [11].

تتراكم الطفيليات الحساسة للكلوروكين (CQS) في DV أكثر بكثير من السلالات المقاومة للكلوروكين (CQR) [4] ، [12] ، [13]. ربطت الدراسات الحديثة انخفاض تراكم الكلوروكين الذي لوحظ في فجوة الطفيلي في السلالات المقاومة [12] مع الطفرات النقطية في ترميز الجين لـ المتصورة المنجلية بروتين ناقل مقاومة الكلوروكين (PfCRT) (للمراجعة ، انظر [14] ، [15]). يتم توطين PfCRT في غشاء فجوة الجهاز الهضمي ويحتوي على 10 نطاقات غشائية متوقعة [16] ، [17]. تم العثور على جميع عزلات النمط الظاهري CQR لتحمل طفرة PfCRT الحرجة لفقدان الشحنة K76T أو ، في حالتين فرديتين ، K76N أو K76I [18] ، [19] ، [20] ، [21]. طفرة أخرى ، S163R ، تعيد حساسية الكلوروكين لطفيليات CQR [22] ، [23]. قد تسمح طفرة الأحماض الأمينية K76T بتفاعل PfCRT مع الكلوروكين موجب الشحنة (CQ + أو CQ ++) وتسمح لها بالخروج من الفجوة ، مع النتيجة الصافية لتقليل تركيز الكلوروكين داخل DV [16] ، [24 ]. يُعتقد أن تغيير الحمض الأميني الفردي S163R ، عن طريق إعادة إدخال شحنة موجبة ، يمنع تسرب الكلوروكين المشحون من DV ، وبالتالي استعادة حساسية الكلوروكين [22] ، [23]. في عمل حديث ، تمكن مارتن والمتعاونون معه [25] من التعبير عن كل من النوع البري وأشكال المقاومة من PfCRT على سطح Xenopus laevis أظهرت البويضات بوضوح أن مقاومة الكلوروكين ترجع إلى النقل المباشر لشكل بروتوني للدواء من فجوة الطفيلي عبر متحولة K76T PfCRT. ومن المثير للاهتمام ، أنهم أظهروا أيضًا أن إدخال طفرة واحدة K76T في PfCRT لطفيليات CQS ضروري ولكنه غير كافٍ لنقل الكلوروكين عبر PfCRT. تتوافق هذه الأدلة مع نموذجين بديلين لـ PfCRT [26]: (1) نموذج القناة (أي قناة سلبية تمكن الكلوروكين المشحون من التسرب من فجوة الطعام إلى أسفل تدرجه الكهروكيميائي) أو (2) النموذج الحامل ( على سبيل المثال ، ناقل تدفق نشط يقذف الكلوروكين من فجوة الطعام).

تم استخدام العديد من التركيبات التجريبية للإجابة على سؤال ما إذا كانت PfCRT قناة أم ناقل ، أي مقاييس تراكم الكلوروكين ، والتحفيز العابر وقياسات تدفق الكلوروكين. ومع ذلك ، تم تفسير البيانات المتاحة بطرق مختلفة من قبل مؤلفين مختلفين ولا يزال الجدل حول طبيعة PfCRT مستمرًا.

أظهر سانشيز وزملاؤه أن تراكم الكلوروكين يعتمد على الطاقة في كل من CQR و CQS [27]. راقب هؤلاء المؤلفون المسار الزمني لامتصاص الكلوروكين المسمى في غياب الجلوكوز وفي وجوده. تمت إضافة الجلوكوز بعد 20 دقيقة من إضافة choloroquine (أي عند الوصول إلى الحالة الثابتة). ووجدوا أنه بعد إضافة الجلوكوز ، كانت الدورات الزمنية لامتصاص choroquine مختلفة بشكل ملحوظ في CQS و CQR: الكلوروكين المتراكم إلى حد متزايد في سلالة CQS ، لكنه انخفض في سلالة CQR. تم تكرار تجربة مماثلة من قبل نفس المؤلفين في عام 2004 [28] باستخدام مجموعة واسعة من الأدوية المختلفة المضادة للملاريا. استنتج المؤلفون أن البيانات متوافقة مع معظم النماذج التي تحاول حساب مقاومة الكلوروكين وأن بعض الآليات المعتمدة على الطاقة تؤدي إلى فقدان الكلوروكين من خلايا CQR وتراكمه في خلايا CQS.

قام Bray et al [29] ، في عام 2006 ، بقياس نسبة التراكم الخلوي (CAR) للكلوروكين في ستة ظروف تجريبية ، وبالتحديد في السلالات الحساسة والمقاومة ، في غياب ووجود كربونيل سيانيد p-trifluoromethoxyphenylhydrazone (FCCP) ، وهو عامل فصل أيوني ، وفي غياب ووجود الجلوكوز. على وجه الخصوص ، وجدوا أنه في حالة عدم وجود الجلوكوز ، فإن الكلوروكين يكون CAR متساويًا في سلالات CQS و CQR (∼700) ، ويصل إلى مستوى متوسط ​​تقريبًا بين المستوى الذي لوحظ في سلالات CQS (∼1200) و CQR (∼350) في وجود الجلوكوز. استخدموا العديد من سلالات المتصورة المختلفة وأظهروا أنه في غياب FCCP ، أي عندما يكون الرقم الهيدروجيني للفجوة أقل من الرقم الهيدروجيني الخارجي ، يكون الكلوروكين CAR أعلى بثلاث إلى أربع مرات (حوالي 1200 مقابل حوالي 350) في السلالات الحساسة مع فيما يتعلق بالسلالات المقاومة ، في حين أن إضافة FCCP يلغي الاختلافات التي تؤدي إلى قيمة CAR تبلغ حوالي 700 في كلتا الحالتين. يوضحون أيضًا أنه في حالة عدم وجود الجلوكوز ، فإن CAR متطابقة مع تلك التي تم الحصول عليها في وجود FCCP مما يشير إلى أن الطاقة التي يوفرها الجلوكوز ضرورية للحفاظ على فرق الأس الهيدروجيني بين السيتوبلازم و DV. وفقًا للمؤلفين ، لا يبدو أن الفرضية القائلة بأن PfCRT عبارة عن ناقل نشط لتدفق التدفق تشرح النتائج التي توصلوا إليها بشكل كامل. في هذه الفرضية ، في الواقع ، يمكن لطفرة واحدة تحويل عملية امتصاص الكلوروكين المعتمدة على الطاقة في عملية تدفق الكلوروكين المعتمدة على الطاقة. لذلك فهم يفضلون الفرضية القائلة بأن حركة الكلوروكين من خلال PfCRT ليست عملية نشطة.

التحفيز العابر للكلوروكين المسمى ([3 H] -CQ)) بعد أن تم تحميل الطفيليات مسبقًا بتركيزات متزايدة من الكلوروكين غير المسمى [27] ، [28] ، [29] ، [30] لوحظ في سلالات CQR و ليس في عزلات CQS. استنتج سانشيز وزملاؤه أن ظاهرة التحفيز العابر هي سمة لا لبس فيها لأنظمة النقل القابلة للإشباع التي يتوسطها الناقل [31]. من ناحية أخرى ، اقترح براي وزملاؤه [29] أن بيانات التحفيز العابر التي أبلغ عنها سانشيز وآخرون لا يمكن استخدامها في حد ذاتها لاستنتاج ما إذا كان نقل الكلوروكين في الاتجاه الداخلي أو الخارجي: تحفيز [3 H] -CQ يمكن أن يكون الامتصاص بسبب تسريع دورة الناقل بواسطة الكلوروكين الخارج غير الموسوم أو ، كما يؤكد سانشيز وآخرون ، يمكن أن ينتج عن انخفاض تدفق [3 H] -CQ بسبب التثبيط التنافسي للناقل من CQ المحملة مسبقًا غير الموسومة . في النموذج الأخير ، يجب أن يكون الكلوروكين المسمى وغير الموسوم على نفس الجانب من الغشاء عندما يتفاعل مع الناقل ، أي أنهما مختلطان معًا. من أجل التحقق من هذه الفرضية ، قام براي وزملاؤه [29] باحتضان خطوط CQR مع الكلوروكين الممزوج مسبقًا (المسمى وغير الموسوم) ، لكنهم لم يلاحظوا التحفيز العابر لامتصاص الكلوروكين ، مما يشير إلى أن الكلوروكين المسمى وغير الموسوم يجب أن يكون على جوانب متقابلة من غشاء لتأثير التحفيز العابر ، أي أن نقل الكلوروكين غير الموسوم عبر الناقل سيكون في الاتجاه الخارجي بينما يحدث نقل الكلوروكين المسمى في الاتجاه الداخلي بمعنى آخر ، سيعمل PfCRT المتحولة كحامل ثنائي الاتجاه ، وهو غير متوافق مع مضخة تدفق نشطة. على وجه الخصوص ، يخمن هؤلاء المؤلفون أن نتائج التحفيز العابر يمكن أيضًا تفسيرها من حيث القناة المسورة.

قام العديد من المؤلفين بقياس تدفق الكلوروكين من عزلات CQS و CQR [27] ، [29] ، [32] ، [33] في ظل ظروف مختلفة: في وجود وغياب الجلوكوز ، مع أو بدون فصل التدرج البروتوني ، مع أو بدون فيراباميل ، L - نوع مانع قنوات الكالسيوم من فئة فينيل ألكيل أمين. تم تفسير نتائج هذه التجارب بطرق مختلفة من قبل مؤلفين مختلفين ولم تؤد إلى رأي إجماعي حول طبيعة PfCRT.

درس سانشيز وزملاؤه [34] حركية تدفق الكلوروكين في ظروف "انتقال متغير عكسي" [31] من عزلات CQR و CQS. يبحث هذا الإجراء فيما إذا كان الكلوروكين خارج الخلية غير الموسوم سيحفز إطلاق [3 H] -CQ المحمّل مسبقًا. توقع هؤلاء المؤلفون أنه في وجود ناقل نشط ، يجب أن يزيد ترانس الكلوروكين من معدل التدفق الأولي. لقد وجدوا معدل تدفق أولي متزايد لكل من خطوط CQR و CQS ، وبناءً عليه اقترحوا أن طفيليات CQR و CQS تمتلك حاملًا للكلوروكين بخصائص نقل مختلفة.

يجب أن يظهر واضحًا من هذا المسح أن التفسيرات النوعية للنتائج التجريبية غير كافية لاستخلاص استنتاجات حول طبيعة PfCRT وأن هناك حاجة إلى مزيد من التحليلات الكمية.

لا يمكن اشتقاق النموذج الكمي من التجارب العابرة لأن المعلمات الحركية ، مثل معدل موازنة الأس الهيدروجيني الفجوة أثناء امتصاص الكلوروكين والثوابت الحركية لربط الكلوروكين والهيموزوين ، غير معروفة ومن المستحيل استخلاصها من البيانات المتاحة بطريقة لا لبس فيها. البيانات الوحيدة التي يمكن استخدامها لاشتقاق نموذج كمي دون عمل عدد غير معقول من الفرضيات على المعلمات غير المعروفة هي تلك التي يتم قياسها عند التوازن.

كما سنوضح ، يشير النموذج التحليلي الذي قمنا بتطويره واستخدامه هنا إلى أن بيانات التوازن متوافقة مع كل من نموذج الناقل والقناة لـ PfCRT ، وهو ما يفسر سبب إمكانية تفسيرهما بشكل مختلف من قبل مؤلفين مختلفين. من ناحية أخرى ، فإن فرضيات الناقل والقناة متوافقة فقط مع افتراضات محددة حول حالة البروتون للأنواع المنقولة والأنواع المرتبطة بالجزيئات المرتبطة بالهايم في الفجوة. على سبيل المثال ، لا يتوافق النموذج الحامل إلا مع البيانات إذا كان الجزيء المنقول بروتونيًا.

هناك طريقة أخرى لفهم طبيعة الجزيء الكبير وهي دراسة علاقته التطورية مع البروتينات الأخرى ذات الوظيفة المعروفة. أيضا في هذه الحالة ، تفسير البيانات مثير للجدل. اقترحت التحليلات الحسابية السابقة لـ PfCRT [14] ، [16] أن PfCRT ينتمي إلى عائلة نقل الدواء / المستقلب (DMT) ، بينما اقترحت دراسات أخرى أنه يشبه قنوات كلوريد ClC [35].

هنا ، نستخدم أحدث أدوات المعلوماتية الحيوية لتحديد علاقات التماثل PfCRT وتقديم دليل على أنه بالفعل عضو في عائلة DMT الفائقة. تتوافق الطية الشبيهة بـ DMT مع البيانات التجريبية حول الطفرات المتضمنة في التمرد وعكس مقاومة CQ في المتصورة.

من خلال الجمع بين هذا الاستنتاج الأخير ونتائج الطريقة التحليلية ، نقترح أن PfCRT هو ناقل لـ CQ + أو CQ ++ أو كليهما وأن إما جميع أنواع الكلوروكين أو غير المشحونة فقط يمكن أن تربط هام الأنواع ذات الصلة بالهام داخل الفجوة. .


المواد والأساليب

تم البحث في قاعدة البيانات غير الزائدة عن الحاجة (NR) لتسلسل البروتين (المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية ، المعاهد الوطنية للصحة ، بيثيسدا) باستخدام برنامج BLASTP [11]. تم إجراء عمليات البحث عن الملف الشخصي باستخدام برنامج PSI-BLAST إما بتسلسل فردي أو محاذاة مستخدمة كاستعلام ، مع توقع قيمة افتراضية لتضمين ملف التعريف (E) بقيمة 0.01 (ما لم يتم تحديد خلاف ذلك) ، وتم تكرارها حتى التقارب [11 ، 13]. بالنسبة لجميع عمليات البحث باستخدام البروتينات المنحازة من الناحية التركيبية ، استخدمنا تصحيحًا إحصائيًا لهذا التحيز لتقليل الإيجابيات الخاطئة في عمليات البحث هذه. تم إنشاء محاذاة متعددة باستخدام برامج T_Coffee [20] أو PCMA [50] ، متبوعة بالتصحيح اليدوي بناءً على نتائج PSI-BLAST. تم تنفيذ جميع إجراءات تحليل التسلسل على نطاق واسع باستخدام حزمة SEALS [51].

تم تنفيذ التلاعبات الهيكلية باستخدام برنامج عارض Swiss-PDB [52] وتم إنشاء المخططات الشريطية باستخدام MOLSCRIPT [53]. أجريت عمليات بحث في قاعدة بيانات PDB مع هياكل الاستعلام باستخدام برنامج DALI [54]. تم التنبؤ بالبنية الثانوية للبروتين باستخدام محاذاة متعددة كمدخل لبرنامج الدكتوراه [21]. تم إجراء تجميع البروتينات على أساس التشابه باستخدام برنامج BLASTCLUST [55]. تم إجراء التحليل الوراثي باستخدام طرق الاحتمالية القصوى وربط الجار والمربعات الصغرى [56 ، 57]. باختصار ، تضمنت هذه العملية إنشاء شجرة المربعات الصغرى باستخدام برنامج FITCH [58] أو شجرة الانضمام المجاورة باستخدام NEIGHBOR [57] أو برنامج MEGA [59] ، متبوعًا بإعادة ترتيب محلية باستخدام برنامج ProtML لحزمة Molphy [57] للوصول إلى شجرة الاحتمال الأقصى (ML). تم تقييم الأهمية الإحصائية للعقد المختلفة لشجرة ML هذه باستخدام التقدير النسبي لإقلاع الاحتمال اللوغاريتمي (ProtML RELL-BP) ، مع 10000 مكرر. تم تحديد الأحياء الجينية من خلال البحث في جداول NCBI PTT بنص مكتوب خصيصًا بواسطة المؤلفين. باختصار ، تضمن الإجراء تجميع الأحياء الثابتة التي تركز على مجموعة من جينات الاستعلام ، متبوعة بتجميع منتجاتها باستخدام برنامج BLASTCLUST لتحديد المنتجات ذات الصلة. إن وجود مجموعات من الجينات ذات الصلة بين جيران مجموعة الاستعلام يعني ضمناً وجود أحياء جينية محفوظة. تم استخدام هذا مع شاشة تم الإبلاغ عنها سابقًا للأحياء الجينية المحفوظة [15 ، 35]. يمكن الوصول إلى هذه الجداول من قسم الجينوم في قاعدة بيانات Genbank [60].


العلاقات بين الإنسان والغابات: القيم القديمة في وجهات النظر الحديثة

كانت العلاقة بين البشر والغابات مهمة لتنمية المجتمع. وهو يقوم على مختلف الوظائف الإنتاجية والبيئية والاجتماعية والثقافية للغابات. غالبًا ما لا يتم التعامل مع الوظائف الثقافية ، بما في ذلك الدور الروحي والرمزي للغابات ، بنفس الاهتمام مثل الوظائف الأخرى. الهدف من هذه الورقة هو التركيز بشكل أقوى على حقيقة أن الاعتراف بالروابط الثقافية أمر ضروري في مناقشة التنمية المستدامة. لا ينبغي اعتبار الغابات فقط كوسيلة تقنية لحل المشكلات البيئية والاقتصادية. لتحقيق فهم أعمق لاعتماد المجتمع على الغابات ، من الضروري الاعتراف بدور الغابات في وعينا بكوننا بشرًا. بإعطاء لمحة تاريخية عن الروابط الثقافية بين الناس والغابات ، يركز الجزء الأول من الورقة على الجوانب غير المنتجة في العلاقات بين الإنسان والغابات. عبر التاريخ ، تغيرت قيم الغابات وظهرت وظائف جديدة. ساهم التصنيع والتحضر في الابتعاد عن الطبيعة وإضعاف ارتباط البشر بالغابات. تمت مناقشة عواقب هذه التغييرات على تنمية المجتمع وبيئته في الجزء الثاني من الورقة. أخيرًا ، يتم توضيح كيفية تعزيز الوعي بالروابط الثقافية بين السكان وخاصة في إدارة الغابات ، وهي إدارة يجب أن تتعلق بالجوانب الثقافية والعاطفية والجمالية ، بالإضافة إلى الوظائف الاقتصادية والبيئية والاجتماعية ، وتؤدي إلى علاقة مستدامة بين الغابات والمجتمع.

هذه معاينة لمحتوى الاشتراك ، والوصول عبر مؤسستك.


اثنان من علوم العقل

في عام 1979 ، قام عالمان معرفيان ، فرانسيسكو فاريلا وإلينور روش ، وعالم كمبيوتر يُدعى نيوكومب جرينليف - وجميعهم بوذيون حديثو العهد - بتنظيم ما كان ليكون مؤتمرًا رائدًا في معهد ناروبا في بولدر ، كولورادو. تم إنشاء المعهد مؤخرًا من قبل سيد التأمل التبتي Chögyam Trungpa Rinpoche ، وقد تم تصميمه ليكون مكانًا تلتقي فيه تقاليد التأمل والمنح الدراسية الغربية على أرضية مشتركة.

المؤتمر ، بعنوان & # 8220Comparative Approaches to Cognition: Western and Buddhist، & # 8221 سيكون التقاء مثير بين الشرق والغرب. في حين أن بعض المشاركين يتذكرونها على أنها محفزة بطرق جديدة ومختلفة ، يصفها روش بأنها قتالية ، مشاجرة فكرية لا تقترب من رمي الكرسي. كما تقول ، & # 8220 اعتقدنا بسذاجة أن الأشياء التي نكتشفها عن العقل من خلال البوذية كانت ذات مغزى وصحيح لدرجة أن زملائنا يريدون على الفور الجلوس ومناقشة كيف يتناسب هذا الفهم العميق للعقل مع العلوم المختلفة . أشياء رائعة ستحدث. بدلاً من ذلك ، نظروا إلى القارئ السميك الذي جمعناه ، إلى حد كبير من مصادر بوذية ، وقالوا ، "ما هذا؟" عندما ألقى فرانسيسكو وبقية منا محادثات ، كانوا يقولون ، "هاه؟" عندما تكون جلسات التأمل في الجدول الزمني فشلوا في تقديم "المعلومات" التي يحتاجونها على الفور "لفهم" ما كنا نقوله ، وردوا ، "نحن في مؤتمر وتطلب منا الجلوس هنا وعدم القيام بأي شيء؟" عندما حان الوقت للمناقشة ، لقد ثاروا ببساطة. من الواضح أننا لم نذهب إلى حيث كانوا. & # 8221 كان الحوار بين البوذية والعلم بداية صعبة.

كان فرانشيكو فاريلا ، رائد المؤتمر ، حوارًا يسيرًا بين البوذية والعلم. كطالب جامعي في علم الأحياء في موطنه تشيلي في أوائل الستينيات ، اقتحم مكتب الأستاذ هامبرتو ماتورانا وصرح بأنه يريد دراسة & # 8220 دور العقل في الكون. & # 8221 ماتورانا ، دائمًا المفكر الحر ، أجاب ، & # 8220 ، يا ولدي ، لقد أتيت إلى المكان الصحيح. & # 8221 أصبح الأستاذ معلمه وسمح له باستكشاف أفكار حول العقل والجسم من خلال دمج الأفكار من الفينومينولوجيا الفرنسية. ذهب فاريلا إلى جامعة هارفارد وأثبت أنه لا يخشى التفاصيل بحصوله على درجة الدكتوراه. لدراسة معالجة المعلومات في شبكية عين الحشرات. كان واثقًا من أن مسيرته المهنية ستنطلق في تشيلي الجديدة لسلفادور أليندي ، ولكن بعد فترة وجيزة من عودته إلى الوطن ، تحول المد السياسي ، واضطر إلى الفرار من النظام العسكري للعقيد أوغستو بينوشيه مع 100 دولار فقط في جيبه.

انتهى الأمر بباريلا مرة أخرى في الولايات المتحدة ، وفي عام 1974 ، عندما شعر بالضياع ، التقى بصديق قديم التقى به أثناء إقامته في بوسطن ، جيريمي هايوارد ، الفيزيائي الذي كان طالبًا في ترونجبا رينبوتشي. رتب هايوارد لقاء Varela و Trungpa ، وعندما سمح Varela أنه كان يكافح للعثور على ما يجب فعله بالضبط ، عرض Trungpa Rinpoche أن يعلمه كيف & # 8220 لا يفعل شيئًا ، & # 8221 إنجازًا رائعًا لشخص لديه عقل مثل نشط مثل Varela.

تولى التأمل مع الانتقام. لقد رآه كوسيلة للاستعلام عن موضوعه المفضل ، & # 8220mind in the universe. & # 8221 بينما كانت السلوكية منذ فترة طويلة قد ألقت البحث الذاتي على أنه الكثير من الهراء ، فقد تم تحديد Varela ، وفقًا لإليانور روش ، & # 8220 لإعادة وضعها. تجربة الشخص الأول كمصدر للمعرفة العلمية ، وفتح البحث العلمي لأساليب مثل التأمل. & # 8221

عندما التقت روش بباريلا في أواخر السبعينيات في أحد برامج ترونجبا ، كانت قد بدأت لتوها ممارسة البوذية. كانت قد حققت بعض الاكتشافات الرائدة في مجال علم النفس المعرفي الناشئ ، ومثل فاريلا ، رأت أن التأمل هو أداة البحث النهائية ، التي كانت تبحث عنها طوال حياتها. أثار اجتماع Naropa شهيتهم ، لكنه تركهم يريدون شيئًا أكثر & # 8211 وأفضل.

اشترك في النشرات الإخبارية الأسد و # 8217S ROAR

احصل على المزيد من الحكمة البوذية التي يتم تسليمها مباشرة إلى بريدك الوارد! اشترك في النشرات الإخبارية المجانية من Lion & # 8217s Roar.

يناقش قداسة الدالاي لاما والمشاركون المرونة العصبية في المؤتمر الثاني عشر للعقل والحياة في دارامسالا ، 2004. صورة (ج) 2005 معهد العقل والحياة.

في هذه الأثناء ، كان الرجل المدرج اسمه الآن باسم Tenzin Gyatso في أعلى القائمة في كل اجتماع للعقل والحياة كان يجري بهدوء مناقشات مع العلماء في كل فرصة حصل عليها. نشأ قداسة الدالاي لاما الرابع عشر في مكان يتسم بالتعلم المتقدم للغاية والذي لم تنعم به يد العلوم والتكنولوجيا الغربية. ومع ذلك ، فإن كل كتاب ، وكل مركبة ، وكل آلة ، وكل جهاز جاء إليه من الغرب أثناء نشأته ، أصبح موضوعًا للفضول الشديد ، شيئًا يمكن تمزيقه وإعادة تجميعه. كان عالم الآليات يقابل عالم التأمل.

عندما فر الدالاي لاما من التبت في عام 1959 في سن الرابعة والعشرين ، سرعان ما رأى إلى أي مدى سيطرت الروح العلمية الغربية على الشؤون في العالم الأكبر. كان لديه بعض اللحاق بالركب. كان مصممًا على تعلم المزيد واختبار ما يعرفه ، بعد أن اجتاز للتو الاختبارات الصعبة للحصول على درجة Geshe Lharampa ، التي تعادل درجة الدكتوراه في الفلسفة البوذية.

قبل أن يصبح الدالاي لاما من المشاهير والحائز على جائزة نوبل ، كان راهبًا متواضعًا يقود بلدًا لم يكن له مقعد في الأمم المتحدة. لم يذعن له الناس بالطريقة التي يفعلونها الآن. ومع ذلك ، فقد كان قادرًا على تكوين صداقات مع عدد من العلماء الأوروبيين البارزين ، الذين كانوا لطفاء معه حقًا واستمتعوا بصدق بشركته كمحاور. كان أول من كان كارل فون فايزاكر ، شقيق الرئيس السابق لألمانيا الغربية ومساعد النجم في الفيزياء الكمومية فيرنر هايزنبرغ. لعدة أيام في كل مرة ، كان von Weizsäcker يجلس مع الدالاي لاما يدرسه في فيزياء الكم وآثارها الفلسفية. كان من حسن حظ قداسته أيضًا أن يصادق الفيزيائي ديفيد بوم ، الذي قضى وقتًا طويلاً مع كريشنامورتي. أجرى قداسته محادثة استمرت عقودًا مع بوم ، والتي ، على حد قوله ، & # 8220 ، غذت تفكيري حول الطرق التي قد ترتبط بها أساليب الاستقصاء البوذية بتلك المستخدمة في العلوم الحديثة. & # 8221 كما طور علاقة وثيقة مع السير كارل بوبر ، أبرز فيلسوف العلم. لقد تعلم من تعاليم بوبر كيف أن منطق العلم يعتمد على التجريد ، عادة في شكل رياضي ، وأدوات (مجاهر ، تلسكوبات ، إلخ). على النقيض من ذلك ، اعتمد منطق البوذية على لغة طبيعية وأمثلة مستمدة من تجربة شخصية بدون وسيط.

لم تكن كل تفاعلات الدالاي لاما مع العلم إيجابية للغاية. في عام 1979 ، بينما كان فاريلا يتصارع مع الجماهير في ناروبا ، واجه الدالاي لاما مجموعة معادية من العلماء في مؤتمر في روسيا ، حيث شعر أحدهم أنه كان يفترض وجود روح. إذا كان هذا الحوار سيبدأ ، فمن الواضح أنه يتعين على شخص ما صياغة شروط أفضل للمشاركة.

من جانبه ، كان فاريلا مصممًا على عدم تكرار ما حدث في اجتماع ناروبا ، لذلك وضع بعض الإرشادات لأي اجتماع مستقبلي حول البوذية والعلوم: يجب ألا يكون المشاركون على دراية فحسب ، بل يجب أن يكون لديهم شيء يساهمون فيه ويكونون منفتحين عليه. حوار. سيستغرق الأمر بضع سنوات أخرى ، لكنه ستتاح له الفرصة لتنظيم هذا النوع من الاجتماع الذي تصوره ، وسيكون الدالاي لاما هو الشخص الذي يصنع الفارق. في عام 1983 ، عاد الآن إلى تشيلي ، وسافر فاريلا لحضور مؤتمر حول العلوم والروحانية في النمسا ، حيث انتهى به الأمر جالسًا بجوار الدالاي لاما ، الذي أمطره بأسئلة حول الدماغ. لقد كانوا أرواحًا عشيرة & # 8211 متأمل جاء إلى العلم وعالمًا جاء إلى التأمل. تعهدوا بالتحدث مرة أخرى.

في عام 1985 ، سمع فاريلا من صديقه جوان هاليفاكس عن خطة وضعها رجل الأعمال والبوذي آدم إنجل لإجراء حوار بين الدالاي لاما والعلماء حول الأرضية المشتركة بين البوذية والفيزياء الحديثة. أقنع فاريلا إنجل أن علم الدماغ سيكون مكانًا أفضل للبدء ، وشكلوا شراكة أدت إلى أول اجتماع للعقل والحياة ، & # 8220 الحوارات بين البوذية والعلوم المعرفية ، & # 8221 الذي عقد في دارامسالا ، الهند ، في أكتوبر 1987.

كان فاريلا المنسق العلمي للاجتماع ، وقد طور نموذجًا دعا إلى مجموعة صغيرة وملتزمة من المشاركين ، كل منهم يقدم عرضًا تقديميًا حول جانب مختلف من مجال الموضوع. سيتم تسهيل المناقشة من قبل المنسق وسيكون الدالاي لاما مشاركًا نشطًا طوال الوقت. كان هذا هو التنسيق ، مع بعض الاختلافات الطفيفة ، لجميع حوارات العقل والحياة الاثني عشر التي عقدت حتى الآن.

ريتشارد ديفيدسون ، أقصى اليمين ، يوضح ماسح PET أثناء جولة Dalai Lama & # 8217s في مختبر Keck في جامعة ويسكونسن في ماديسون. تصوير جيف ميلر.

بعد عدة سنوات من الاجتماع الأول للعقل والحياة ، وجد فاريلا نفسه يتنقل بين الجبال والكهوف فوق دارامسالا. كان هناك في جهد أقره الدالاي لاما لاستخدام أدوات متطورة لقياس ما كان يحدث عندما كان اليوغيون يتأملون. كان شريكه في هذا الجهد ، ريتشارد ديفيدسون ، & # 8211 وهو & # 8211 سلطة رائدة في العلاقة بين الدماغ والعاطفة ورائد في تطوير وتطبيق تقنيات لقياس نشاط الدماغ.وهو حاصل على العديد من الكراسي الأكاديمية في علم النفس والطب النفسي ، وهو مدير مختبر علم الأعصاب الوجداني و W.M. مختبر كيك للتصوير الوظيفي للدماغ وسلوكه بجامعة ويسكونسن في ماديسون.

كان ريتشي ديفيدسون ، كما يحب أن يُعرف ، مهتمًا منذ فترة طويلة بمحاولة إثبات ما يمكن أن يفعله التأمل علميًا. في أوائل السبعينيات ، كان زميلًا لدانيال جولمان في جامعة هارفارد ، والذي سيصبح بعد ذلك بطلًا لمبدأ & # 8220 الذكاء العاطفي & # 8221 وكتابة أفضل الكتب مبيعًا بهذا الاسم. في أيام هارفارد ، شارك ديفيدسون وجولمان في تأليف ورقة بحثت أن تدريب الانتباه من خلال التأمل سيخلق & # 8220 تغييرات نفسية بيولوجية دائمة ومفيدة. & # 8221 بينما يمكن للشخص العادي الاعتماد على الحكايات والتقارير الشخصية لتحديد ما إذا كانت هناك أم لا & # 8220 تغييرات مفيدة ، & # 8221 عالم يحتاج إلى بيانات صلبة.

لحسن الحظ ، مع تقدم مهنة Davidson & # 8217 ، تقدم علم وظائف الدماغ أيضًا. جمعية علم الأعصاب ، التي تأسست فقط في 1970 ، ستستمر في أن تصبح المجتمع الأكبر والأسرع نموًا في جميع البيولوجيا التجريبية. بحلول أواخر الثمانينيات ، كان علماء الأعصاب يلتقطون صورًا مفصلة للغاية لنشاط الدماغ ، وبحلول أواخر التسعينيات كانوا يلتقطون مقاطع فيديو. بسبب هذه التطورات في تكنولوجيا تصوير الدماغ ، يمكن للباحثين الآن جمع بيانات ثابتة حول الآثار المفيدة للتأمل. كان الحديث عن مثل هذه البيانات أحد النقاط الرئيسية التي ركز عليها مؤتمر العقل والحياة لعام 2000 ، الذي نسقه جولمان ، مع ديفيدسون ، وفاريلا ، وبول إيكمان ، وباحث عاطفي بارز آخر ، وغيرهم من الحاضرين. نتائج هذا الاجتماع وجلسة متابعة العام المقبل في مختبر Davidson & # 8217s ، هي موضوع كتاب Goleman & # 8217s ، العواطف المدمرة.

تمكن الباحثون في مختبر Davidson & # 8217s من رسم مخطط لنشاط الدماغ في المتأملين بطريقة لم يتم إجراؤها من قبل ، في المقام الأول باستخدام التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي ، الذي يقوم بتصوير وظائف المخ بالفيديو (على عكس التصوير بالرنين المغناطيسي القياسي ، الذي يأخذ لقطات فقط). يجمعون هذه المعلومات مع بيانات من مخطط كهربية الدماغ (EEG) ، الذي يقيس النشاط الكهربائي على سطح الدماغ. في حين أن فني EEG في المستشفى المحلي الخاص بك قد يعلق عدة عشرات من أجهزة الاستشعار برأس المريض ، فإنهم في مختبر Davidson & # 8217s يستخدمون ما يصل إلى 256. يتم تحسين بيانات EEG الخام بواسطة برنامج يقوم بتثليث من أجهزة الاستشعار وتقارير عن النشاط ليس فقط على السطح ولكن في عمق الدماغ. أخبرني ديفيدسون مؤخرًا أن هدفه هو & # 8220 تحديد من خلال البحث العلمي صلاحية الأساليب التي تم تطويرها في البوذية منذ 2500 عام. & # 8221 من خلال التحقق الموضوعي من فوائدها ، يعتقد ديفيدسون ، & # 8220 أن هذه الممارسات يمكن أن تحظى بقبول أوسع في كل من الثقافة السائدة والمجتمع الطبي. & # 8221

أجرى فريق Davidson & # 8217s ومعاونوه نوعين من الدراسات ، أحدهما مع أشخاص يتعلمون التأمل أولاً والآخر مع ممارسين ذوي خبرة ومهارة للغاية. في النوع الأول من الدراسة ، يحاولون معرفة الفوائد التي تعود على شخص تأمله منتظم ولكنه محدود المدة. أجرى جون كابات زين بحثًا مكثفًا حول الفوائد الصحية للتأمل اليقظ وشارك منذ فترة طويلة مع العقل والحياة ، لذلك تعاون ديفيدسون معه في دراسة حديثة للعاملين في شركة ذات تقنية عالية وخضعوا لبرنامج تدريبي لمدة شهرين في التأمل. وأظهرت تغيرات كبيرة في نشاط الدماغ ، وتراجع في القلق ، وتغيرات مفيدة في وظائف المناعة.

تهدف دراسة ما يسميه ديفيدسون & # 8220 الرياضيين الأولمبيين للتأمل ، & # 8221 أولئك الذين مارسوا ما بين 10000 إلى 55000 ساعة من التدريب ، إلى إظهار & # 8220 ما هي حدود اللدونة البشرية. & # 8221 عندما بدأ ديفيدسون عمله مهنته ، لم يستطع الحصول على الكثير من الجاذبية لأن الدماغ كان يعامل كجهاز كمبيوتر من خلال وجهة النظر السلوكية السائدة. من المعروف الآن أن الدماغ ينمو ويتغير بناءً على كيفية استخدامه. لذا يسأل ديفيدسون ، & # 8220 ماذا يفعل التدريب المكثف للعقل؟ لقد توصلنا إلى تقدير قيمة التدريب البدني ، لكننا لم نعط نفس النوع من الاهتمام للعقل. في عملنا ، ننظر الآن إلى السعادة والرحمة كمهارات يمكن تدريبها. عندما ننظر إلى الممارسين المتقدمين ، فإننا نوسع طريقة تفكير الناس في أبعد مجالات التنمية البشرية. & # 8221

من بين النتائج الأخرى ، أظهر عمل Davidson & # 8217s أن المتأملين يمكنهم تنظيم نشاطهم الدماغي ، مما يؤدي إلى مزيد من التركيز ورباطة الجأش. على النقيض من ذلك ، فإن معظم الأشخاص غير المدربين الذين طُلب منهم التركيز على شيء ما لا يمكنهم قصر نشاطهم العقلي على مهمة واحدة. أظهر الرهبان الذين مارسوا التمارين الأطول أكبر تغيرات في الدماغ ، مما دفع ديفيدسون إلى الاعتقاد بأنهم قد يكونون قد أحدثوا تغييرات دائمة. جاءت نتائجه الأكثر إثارة للاهتمام من ملاحظة الممارسين المتقدمين الذين يتأملون في التعاطف. يبدو أن التغيرات الدماغية التي لوحظت خلال هذه الممارسة تظهر أن توليد النوايا الحسنة بشكل مكثف ينتج عنه مؤشرات لحالة قصوى من الرفاهية. في حين أن مصادر جميع أنواع الاضطرابات والاختلالات قد تمت دراستها على نطاق واسع ، إلا أنه لا يوجد أي مؤلفات تقريبًا حول ما يسميه هؤلاء العلماء أحيانًا & # 8220 شفاء العواطف. & # 8221

لم يكن لبول إيكمان ، على عكس ديفيدسون وكابات زين ، اهتمام طويل الأمد بالمتأملين أو التأمل. درس إيكمان ، الذي تقاعد مؤخرًا من منصب رئيس مختبر التفاعل البشري بجامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو ، العواطف لمدة خمسين عامًا. لقد تعثر بشكل أو بآخر في مشاركته الأخيرة في دراسة المتأملين. & # 8220 بدأ كل شيء مع الاجتماع في دارامسالا ، & # 8221 أخبرني مؤخرًا. & # 8220 ذهبت إلى الاجتماع فقط لأن ابنتي كانت تعيش في مخيم للاجئين التبتيين في نيبال وتأثرت كثيرًا بالقضية. اعتقدت أنه سيكون متعة كبيرة لها أن تقابل الدالاي لاما. الآن ، بعد أن قابلت الدالاي لاما بنفسي ، طورت اهتمامي بما يفعله ، لما يمكنني تعلمه كشخص وكعالم.

& # 8220 عندما أكملت تدريبي قبل 45 عامًا ، قال مشرفي ، "إذا كان بإمكانك زيادة الفجوة بين الدافع والعمل ، فستفيد مريضك. & # 8217 لم يكن يعلم أن & # 8217s وجهة نظر بوذية صريحة: شرارة قبل اللهب. قد يكون هذا مكانًا حيث من خلال ممارسات من نوع أو آخر ، قد يكون من الممكن أن تفعل ما لم تقصده الطبيعة أن تفعله ، لتصبح متفرجًا على نفسك وتقرر ما إذا كنت تريد مواكبة ذلك ، وإذا كان الأمر كذلك بأي شكل. & # 8221 يعتقد البعض أن هذا التقارب بين التفكير العلمي العصبي والتعاليم البوذية أمر غير عادي. في أبيدارما (يُطلق عليها أحيانًا & # 8220 علم النفس البوذي & # 8221) يُقال إن المرء يقوي التجربة من خلال سلسلة من اثني عشر حدثًا عقليًا تُعرف باسم nidanas. يعلم بعض الأساتذة أنه يمكن كسر السلسلة في الوقت الحالي بين & # 8220craving & # 8221 و & # 8220attachment و # 8221 ويمكن أن تحدث تجربة مفتوحة غير مشروطة في هذه الفجوة.

يقول إيكمان أن & # 8220 زيادة الفجوة بين الدافع والفعل هو سلوك عاطفي غير عادي للغاية ، ولكن بناءً على الدراسات التي أجريتها مع عدد قليل من الرهبان ، أعتقد أن هذا شيء يمكنهم تحقيقه. ما يمكن أن يفعله هؤلاء الأشخاص غير العاديين يظهر لنا الحد الخارجي لما يستطيع البشر القيام به. & # 8221

نتيجة لاجتماع العقل والحياة لعام 2000 وبناءً على طلب الدالاي لاما ، وافق إكمان على إطلاق مشروع الأشخاص غير العاديين. كان موضوعه الرئيسي في تمهيد لهذا المشروع هو شخص تمت دراسته أيضًا على نطاق واسع في مختبر Davidson & # 8217s ، الراهب وزميله ماثيو ريكارد ، محاور العقل والحياة. كان ريكارد متأملاً منذ فترة طويلة ، وعمل لمدة اثني عشر عامًا كمساعد ومترجم لأستاذ Dzogchen العظيم Dilgo Khyentse Rinpoche.

تخصص Ekman & # 8217s ، الذي تم تطويره على مدار سنوات من الدراسة المضنية لحركات الوجه الدقيقة ، هو نظام ترميز حركة الوجه ، وهو طريقة لفهرسة المشاعر بناءً على التغييرات الدقيقة في عضلات الوجه ، مثل رفع الحاجبين الداخليين ، وشد الجفون ، أو خفض زوايا الفم. يُنظر إلى مدى قدرة شخص ما على اكتشاف مثل هذه التعبيرات الدقيقة على أنه مؤشر على التعاطف ، فضلاً عن كونه مهارة تمكن الشخص من كشف الخداع وسوء النية. وبالتالي ، تم السعي بقوة إلى إيكمان لمساعدة وكالات إنفاذ القانون ومكافحة الإرهاب.

كان إيكمان فضوليًا لمعرفة ما إذا كان المتأملون ، الذين يُتوقع منهم أن يكونوا أكثر انتباهاً وضميرًا ، سيحققون نتائج جيدة في اكتشاف التغيرات السريعة في تعابير الوجه. عند تقديم شريط فيديو يعرض سلسلة عابرة من تعبيرات الوجه التي يجب على المرء أن يربطها بمشاعر ، سجل ريكارد ومتأمّل آخر درجات أعلى من أي من الخمسة آلاف شخص الآخرين الذين تم اختبارهم. كما ورد في Destructive Emotions ، قال إيكمان ، & # 8220 ، إنهم يعملون بشكل أفضل من رجال الشرطة والمحامين والأطباء النفسيين وموظفي الجمارك والقضاة و # 8211 حتى وكلاء الخدمة السرية ، & # 8221 المجموعة التي سبق لها أن حصلت على أعلى مرتبة الشرف.

قرر إيكمان أيضًا اختبار ما إذا كان ريكارد قادرًا على تغيير رد الفعل المفاجئ ، والاستجابة الفسيولوجية للضوضاء الصاخبة المفاجئة. باتباع الإجراء القياسي ، أخبر الباحثون الموضوع أنهم سيعدون من عشرة إلى واحد ، وعند هذه النقطة ستنطلق ضوضاء عالية ، وهو ما يعادل إطلاق مسدس بالقرب من أذن واحدة. & # 8220 لقد وثقت أن ماثيو كان قادرًا على تركيز انتباهه باستخدام ممارسة تأملية لتقليل أي علامة كان قد أذهلها ، & # 8221 يقول إيكمان. أخبر الدالاي لاما ، & # 8220 أعتقد أنها كانت لقطة طويلة للغاية يمكن لأي شخص أن يختارها لمنع هذا المنعكس البدائي للغاية والسريع للغاية. & # 8221

ما اكتشفه إيكمان وديفيدسون في بحثهما لا علاقة له بنظرة بوذية للعالم. من جانبه ، يقول ديفيدسون ، & # 8220 أنا عالم أعصاب غربي صارم. يختلف مستوى وصف العقل ومستوى وصف الدماغ اختلافًا كبيرًا ، لكنني أعتقد أيضًا أن العقل يعتمد على الدماغ وبدون دماغ لا يوجد عقل. & # 8221 بينما في البوذية ، يتجاوز العقل التجسيد ، كما يتضح من التناسخ ، يعتبر العقل أو الوعي في علم الأعصاب خاصية & # 8220emergent & # 8221 ينبثق فقط حيث توجد أدمغة.

في البوذية ، يتم الحديث بشكل عام عن المشاعر مثل & # 8220three Poems & # 8221 & # 8211 العدوانية والتشبث والوهم & # 8211 على أنها شيء يجب مواجهته أو تجاوزه. يتحدث إيكمان عن العواطف من منظور الداروينية ، باعتبارها تكيفات مع البيئة. إنها تسمح لنا بالعمل تلقائيًا ، قبل التفكير. يقول إيكمان ، على سبيل المثال ، أن ما يسميه & # 8220fear & # 8221 مطلوب للتمكن من الحفاظ على الحالة اللازمة للرد عند القيادة بسرعات عالية على طريق سريع. قد تقضي وقتًا طويلاً في الحديث عما إذا كان الخوف جيدًا أم لا ، لكن إيكمان يشعر & # 8220 أنه ليس من المفيد جدًا استخدام الكلمات فقط ، لأننا ربما نستخدمها بطرق مختلفة جدًا. نحن بحاجة إلى الاعتماد على الأمثلة. هذا هو ما أحاول القيام به في الحوارات & # 8221

يبدو أن إيكمان وديفيدسون والبوذيين الذين تحدثوا & # 8217 لم يركزوا على الإطلاق على من & # 8217s على حق ومن هو مخطئ. يتم احترام منهجيات العلم والبوذية بشكل متبادل. على سبيل المثال ، حقيقة أن فكرة & # 8220mood & # 8221 يبدو أنه ليس لها مكان رسمي في التعاليم البوذية ومع ذلك فهي فكرة مستخدمة على نطاق واسع من قبل الناس العاديين والأطباء والباحثين في الغرب تقود المعلمين والعلماء البوذيين إلى التفكير فيها. كيف يدرسون ويعلمون. في حوار البوذية والعلم اليوم & # 8217s ، لا ترتبط الرؤى كثيرًا بالتأليف. من الذي ناقش فضيلة امتلاك & # 8220 مرونة العقل & # 8221؟ بوذا؟ رقم تشارلز داروين ، في التعبير عن العاطفة في الإنسان والحيوان.

صورة مجهرية ضوئية مناعية لخلايا الدماغ مأخوذة من قشرة دماغ الثدييات. توفر الخلايا النجمية ، والخلايا النجمية ، الدعم والتغذية للخلايا العصبية ، وقد تلعب أيضًا دورًا في تخزين المعلومات.

بدأ ماتيو ريكارد حياته المهنية كعالم أحياء جزيئية. الآن ، بعد عدة عقود كراهب ، أصبحت جزيئاته موضوعًا للدراسة لعلماء الأحياء. مناقشاته مع الفيزيائي Trinh Xuan Thuan ، التي نُشرت باسم The Quantum and the Lotus ، وناقشته القوية مع والده ، الفيلسوف الشهير جان فرانسوا ريفيل ، التي نُشرت باسم الراهب والفيلسوف (أكثر الكتب مبيعًا في فرنسا) ) يُظهر قدرته على مناقشة الفهم البوذي ببراعة خارج سياق البوذية. هذا جعله مشاركًا مثاليًا في حوارات العقل والحياة وموضوعًا معملًا يمكنه الإبلاغ عن تجربته الشخصية بدقة تشبه المشرط.

يشعر ريكارد بالقلق من أن الشخص العادي يخاف من العقل ، وأن هذا الخوف يتسبب في خسائر اجتماعية كبيرة. يقول: إذا طلبت من شخص ما أن ينظر في أذهانه ، & # 8220A رد الفعل الشائع بشكل مدهش هو "أنا لا أريد أن أنظر في ذهني. أنا & # 8217m خائف مما سأجده هناك. & # 8221 يشعر أن الكثير من الناس قد يجدون فكرة التأمل والعمل بالعقل أكثر جاذبية إذا تمكنوا من رؤية ذلك & # 8220 نحن نقلل إلى حد كبير من حجم التغيير هذا محتمل. إذا تمكنت الدراسات من تقديم دليل قوي على تأثير تدريب العقل ، فسيكون ذلك ذا قيمة كبيرة للمجتمع. & # 8221

عندما يتحدى والده الفيلسوف الخرافات في البوذية ، يقدم ريكارد حجة قوية على عكس الاعتقاد السائد ، يعتمد البوذيون على إمكانية التحقق. يُطلب من البوذيين فحص ما تعلموه وهم يثقون عمومًا بما يقوله المعلم لهم & # 8220 من خلال تقييم جميع جوانب شخصيتهم. & # 8221 يقول أن للإيمان مكان في الحياة ، ولكن ليس الإيمان الأعمى. الشخص العادي يحمل معتقدات باستمرار لأنه & # 8220 ؛ يقبل بكفاءة أولئك الذين يقدمون المعلومات. & # 8221 يعتقد أن & # 8220 الكثير من الناس بحاجة إلى سماع معلومات حول التأمل من الأشخاص الذين يرونهم أكفاء. & # 8221 كتابه الحالة من أجل السعادة ، التي تتم ترجمتها الآن إلى اللغة الإنجليزية ، هي جزء من تلك الحملة. & # 8220 أنا على استعداد ، & # 8221 يقول ، & # 8220 للقيام برحلات قليلة في السنة إلى الولايات المتحدة من نيبال لقضاء بضعة أسابيع في هذا البحث. لقد حان الوقت ، إذا كان بإمكاني العمل كجسر بين العوالم. الثقافة تقوم بتدريب الناس وعقول # 8217 في اتجاه واحد في الوقت الحالي. يجب أن يروا أن هناك اتجاهًا آخر ممكنًا. & # 8221

في بيانه الختامي في كتابه The Quantum and the Lotus ، يقول ريكارد أن أحد الأسباب الرئيسية التي دفعت العلم & # 8220 إلى حوار مع البوذية & # 8221 هي المعضلة التي ظهرت من خلال ميكانيكا الكم والنسبية & # 8220 محاولة التوفيق الحقيقة الواضحة للعالم الكبير مع اختفاء الحقيقة الصلبة بمجرد دخولنا إلى عالم الجسيمات. & # 8221 آرثر زاجونك (القوافي مع العلم) ، محرر الفيزياء الجديدة وعلم الكونيات: حوارات مع الدالاي لاما ، عالم فيزياء الذي أطل أحيانًا ، جنبًا إلى جنب مع الدالاي لاما ، إلى عالم مقلوب رأسيًا بعيدًا تحت العين المجردة.

يلاحظ زاجونك أن هناك نوعًا من القرابة الطبيعية بين البوذية وعلم الأعصاب ، لأن البوذية لديها الكثير لتقوله عن العقل ويمكن أن تقدم دليلًا موثوقًا على الفعالية. & # 8220 عندما تنتقل إلى العلوم الفيزيائية ، & # 8221 يقول ، & # 8220 أنت في منطقة مختلفة تمامًا. & # 8221 يمكن القول أن البوذية تقدم علمًا للعقل ، ولكن لا يوجد شيء في البوذية يبدو يشبه إلى حد كبير العالم الرياضي للغاية للفيزياء الغربية. إذا اقتصرت الفيزياء على التنبؤ بما يحدث عندما تصطدم المطرقة بالمسمار ، فلن يكون هناك الكثير لنتحدث عنه ، ولكن نظرًا لأن علماء الفيزياء منذ أينشتاين قد ضلوا في النظر في طبيعة الواقع ، فإنها تشرك الجانب الفلسفي للبوذية ومذاهب مثل خواء الطبيعة المتأصلة والنشأ المعتمد. تؤدي التقاربات الفلسفية إلى ندوات مثل & # 8220Quantum Nonlocality & amp Emptiness in Madhyamika Prasangika ، & # 8221 التي قدمها مؤخرًا أستاذ الفيزياء فيك مانسفيلد كجزء من Namgyal Buddhism and Science Dialogue.

في إشارة إلى اجتماع في عام 1998 مع الدالاي لاما في معهد الفيزياء التجريبية بجامعة إنسبروك في النمسا ، يقول زاجونك ، & # 8220 لقد عملنا حقًا على طبيعة الواقع ، ولماذا تبدو الأشياء كما تبدو ، عندما تكون في أعماقها هي في الواقع مختلفة تمامًا. & # 8221 يتعلق هذا السؤال بمشكلتين & # 8220 & # 8221 في الفيزياء الحديثة. الأول هو مشكلة عدم التواجد: في ما يسمى بالعالم & # 8220macro & # 8221 ، نفكر في الأشياء على أنها منفصلة وغير متصلة ، ولكن على المستوى الكمي ، لا توجد في الحقيقة كائنات كل شيء مرتبط بشكل وثيق بكل شيء آخر. الثانية هي مشكلة القياس: على المستوى الكمي ، تختلف البيانات التي تعود إليك تمامًا اعتمادًا على السؤال. & # 8217s كما لو كنت تسأل شخصًا ، & # 8220 هل أنت ولد؟ & # 8221 ويقولون نعم ، ولكن عندما تسأل ، & # 8220 هل أنت فتاة؟ & # 8221 يقولون أيضًا نعم. هذا النوع من الانهيار في المنطق جعل الفيزيائيين يعتبرون الساحة الكمومية عشوائية ، على الرغم من رد أينشتاين بأن & # 8220 الله لا يلعب النرد مع الكون. & # 8221

يمكن للبوذيين وعلماء الكونيات أيضًا الدخول في حالة من التشابك في بداية الكون ، لأن البوذيين هم بلا بداية. في الوقت نفسه ، يبدو أن مفاهيم الوقت توفر نقطة التقاء ، نظرًا لأن العديد من التعاليم البوذية تزعج المفاهيم التقليدية للوقت بنفس الطريقة التي يعمل بها مبدأ النسبية.

تمامًا مثل علماء العقل ، لا يبدو أن Zajonc متحمسًا لمعرفة من هو الصحيح. يصف في كتابه العديد من النقاط في الحوارات عندما ينفجر الجميع في صخب من الضحك العفوي. & # 8220It & # 8217s مذهلة ، & # 8221 Zajonc يقول. & # 8220 إنه يكسرك حرفياً. إنه يكسر أفكارك ويترك نوعًا من الفكاهة. اللامركزية والعشوائية والترابط # 8211 هذه مثل الكوان الكمومية. إذا حاولت التفكير فيها بطريقة تقليدية ، فسوف تفشل. أعتقد أحيانًا أن المرء يحتاج إلى مستوى جديد من البصيرة ليتمكن من وضع عقلك حوله. علاوة على ذلك ، فإن تقدمنا ​​التكنولوجي يفوق بكثير تطورنا الأخلاقي ، وقدرتنا على إصدار أحكام سليمة حول ما أطلقناه. & # 8221

في هذه النقطة ، Zajonc متحمس. & # 8220 في بداية ثورتنا العلمية & # 8221 يقول ، & # 8220 كان هناك تقسيم للعمل. سيهتم العلم بالمعرفة الطبيعية. سيتم إعطاء جميع الاعتبارات الأخلاقية للكنيسة. يعلم اليوغي أن هذا غير ممكن في الواقع. المعرفة تجلب القوة. كعالم ، لديك القوة ، ولكن يجب أن تعرف أيضًا قيمة الترابط. عندما كان الباحث الجيني إريك لاندر في حوار مع الدالاي لاما ، صُدم عندما سأل الدالاي لاما عن النية وراء كل ذلك. العلم له أخلاقيات ترك النية خارج الصورة ، ولكن مع المشكلة النووية والتكنولوجيا الحيوية ، نجد أنفسنا في معضلات أخلاقية لا تستطيع رؤيتنا التنويرية التعامل معها بشكل كامل.

& # 8220 لا يمكن أن تكون معرفتنا موجهة نحو الهدف.في التقاليد التأملية مثل البوذية ، المعرفة موجهة بالبصيرة. أنت لا تستوعب وحدات المعرفة وتغير نظرتك للواقع. إذا قمنا بتثقيف الناس بطريقة غيرت تجربتهم بدلاً من مجرد ملئهم بالمعلومات ، فستكون هذه مساعدة هائلة ، لكننا نميل إلى عدم القيام بذلك. لدينا أمثلة في الغرب ، مثل محاولة Goethe & # 8217s لتطوير علم تأملي للبصيرة ، لكن البوذيين كانوا يفعلون ذلك بهذه الطريقة منذ ألفي عام. & # 8221

إليانور روش متشككة في الحوار البوذي والعلمي. إنها تعتقد أنه قد يكون يسير في اتجاه غير مفيد. & # 8220 بالنسبة للكثيرين ، لم يكن الأمر & # 8217s حوارًا ، & # 8221 كما تقول. & # 8220 هناك & # 8217s جنون حول هذا النوع من الأشياء. أتلقى رسائل بريد إلكتروني متكررة من الأشخاص الذين يرغبون في دراسة التأمل من وجهة نظر علمية حتى يتمكنوا من التخلص من كل تلك الأشياء الشرقية الغامضة ومعرفة ما يحدث بالفعل & # 8217 & # 8211 الذي يقصدون به الخلايا العصبية اطلاق النار في الدماغ ووظائف مماثلة. ثم هناك بوذيون يريدون "إثبات & # 8217 أن التأمل" يعمل. & # 8217 غالبًا ما تُظهر الأبحاث المزيد حول المفاهيم المسبقة للباحثين والجمهور أكثر مما تفعله حول العقل. على سبيل المثال ، ما المعتقدات الميتافيزيقية التي قد تحملها والتي من شأنها أن تجعلك متحمسًا بشدة لتعلم أنه عندما ينتبه الناس للتأمل ، فإنهم يظهرون نفس نمط نشاط الدماغ كما هو الحال عندما ينتبهون في أي مكان آخر؟ فبدلاً من قيام العلماء والبوذيين بتوسيع أذهانهم معًا ، أرى أن البوذية كثيرًا ما يتم استعمارها على أنها صورة كاريكاتورية تبعث على الشعور بالرضا ، ولا تختلف عن أي عقيدة مادية اختزالية أخرى.

& # 8220 أنا أحترم رغبة الدالاي لاما & # 8217s في تأسيس أخلاقيات عالمية للتعاطف عن طريق العلم ، & # 8221 تواصل ، & # 8220 ولكن بالنظر إلى ديناميكية العالم الحالي ، فهي تحالف البوذية مع التطرف في العقلانية العلمانية كأسلوب للقيام بذلك الذي - التي؟ يتجاهل الناس العلم الجيد طوال الوقت. قد تقدم البوذية شيئًا فريدًا للاستقطاب الديني: طريقة وسطى للروحانية تتجاوز الأنا. يمكن أن تحفز الأديان على التنقيب عن المسارات التأملية والتأملية في تراثها ، مثل حركة التأمل اليهودية والصلاة المركزية المسيحية. ما يحتاجه الناس حقًا هو العثور على تجربة تأملية أعمق قبل أن تقودهم أنظمة التفكير المتنافسة الخاصة بهم إلى حريق هائل. & # 8221

سيخالف ماتيو ريكارد بكل احترام مع روش حول قيمة الحوار واتجاه البحث. & # 8220 لا أرى أن ما نقوم به يؤثر على البوذية بشكل سلبي. نحن لا نجعل البوذية خفيفة. أنا منزعج للغاية عندما يحدث ذلك. البوذية لا تزال البوذية. نحن نقدم الطعام ببساطة. لتقديم طعام لشخص نعرف كيفية إنتاجه ويحتاجون إليه الآن ، لا يتعين علينا تحويلهم إلى متخصصين في البستنة. & # 8221 فيما يتعلق بالاختزال ، يؤكد ريكارد أنه & # 8220 لا يمكن لأي شخص يعمل في مجال العلوم السليمة الحصول على أي شيء دعم وجهة النظر الاختزالية مما نفعله. لا يمكنك أبدًا الإجابة على سؤال من قرر التأمل في الرأفة في المقام الأول. هذا خارج عن نطاق البحث العلمي. & # 8221

ستظل الأسئلة حول تحصين التفكير المادي وإمكانية إشراك البوذية بلا شك. سيتساءل البعض عما إذا كان هذا الحوار يساعد في تطوير تقليد تأملي حقيقي ، كما يبدو أن آرثر زاجونك يعتقد ، أو قد يقودنا بعيدًا عنه ، كما تقترح إليانور روش. لكن البحث سيستمر. طلبات المنح للبحث في مؤسسات بارزة مثل المعاهد الوطنية للصحة ، ومعهد ماساتشوستس للتكنولوجيا ، وبرينستون التي تحتوي على & # 8220mindfulness & # 8221 أو & # 8220meditation & # 8221 لم يعد يتم الاستهزاء بها ، ومن المرجح أن تظهر مراكز البحث التي تركز على التأمل.

ألان والاس ، راهب بوذي سابق درس مع آرثر زاجونك ، كان مترجمًا ومشاركًا نشطًا في كل مؤتمر للعقل والحياة. وهو أيضًا مؤلف مختارات البوذية والعلوم وأسس مؤخرًا معهد سانتا باربرا لدراسات الوعي. التقط المعهد العمل الذي كان يقوم به بول إيكمان بناءً على طلب الدالاي لاما في & # 8220 تنمية التوازن العاطفي ، & # 8221 ويقوم بتدريب المعلمين والممرضات وغيرهم من المهنيين الصحيين في & # 8220 التأمل العلماني & # 8221 تقنيات وغيرها أشكال العمل بالعواطف. سيقوم برنامج اليقظة الذهنية بدراسة ما إذا كان التأمل يمكن أن يساعد الأشخاص الذين يعانون من اضطراب نقص الانتباه وفرط النشاط. أخيرًا ، سيراقب مشروع Shamatha الأشخاص الذين يتأملون في منشأة خاصة على مدار عام.

بول إيكمان ، عضو مجلس إدارة معهد سانتا باربرا ، متحمس لهذه الدراسة ، لكنه يقول ، إنها & # 8220 ثانية أفضل دراسة. & # 8221 أفضل دراسة ، كما يقول ، ستكون & # 8220 إلى افعل شيئًا مثل ما تم القيام به في الدراسات الشهيرة لأمراض القلب ، حيث بدأوا بـ 4000 شخص. إذا بدأنا في النظر إلى 4000 مراهق في منطقة الخليج ، ودرسناهم كل بضع سنوات ، فمن المؤكد أن بعضهم سيشترك في التأمل. كنا سنعرف كيف كانوا هم ومن شارك. ثم نتبعهم لمدة خمسة وعشرين عامًا قادمة. هذا هو البحث الذي يجب القيام به.

& # 8220 المشكلة الوحيدة في دراسة معهد سانتا باربرا هي أن الأشخاص الذين يرغبون في قضاء عام في ملاذ تأملي ليسوا عذارى بوذيين. سنرى ما يتغير بمرور الوقت ، وسنرى كيف تبدو أجهزتهم العصبية وحياتهم العاطفية في البداية وكيف تتغير. سنتعلم الكثير منه. لكنني كنت أرغب في رؤيتهم قبل عشرين عامًا ، لمعرفة ما كانوا عليه قبل أن يتورطوا ، وما الذي جعلهم يشاركون. يوما ما ، شخص ما سيفعل ذلك. يستغرق تكريس العمر لها. أجرى مرشدي دراسة لمدة أربعين عامًا لارتفاع ضغط الدم. يتطلب الأمر مهنة للقيام بذلك. أعتقد أن الأشخاص الذين تأثروا بالبوذية سيكونون أكثر استعدادًا من الآخرين لتخصيص الوقت ، لأنهم أقل انشغالًا برغباتهم الشديدة في المجد والاعتراف. & # 8221

في 24 مارس 2000 ، أخذ فرانسيسكو فاريلا الكلمة في قاعة اجتماعات Dalai Lama & # 8217 لتقديم آخر عروضه العديدة في الحوار بين البوذيين والعلماء لدرجة أنه فعل الكثير للبدء. على وشك البكاء ، في إيماءاته وكلماته الناعمة ، شكر الدالاي لاما ضمنيًا على تمكينه من التواجد هناك. قبل عدة سنوات ، عندما كان يحتضر بسبب السرطان ، كان متناقضًا بشأن إجراء عملية زرع كبد. فجأة تلقى فاكس من الدالاي لاما يشجعه على إطالة حياته. الآن ، على الرغم من ضعفه ، عاد إلى العمل ، وميض شريحة PowerPoint على الشاشة. لقد دعا إلى قيام البوذيين وعلماء الأعصاب بالتعاون من أجل مصلحة الجنس البشري ، وهي قضية كان يصنعها لأكثر من عشرين عامًا ، منذ وقت كان فيه عدد قليل من الناس يُدعون بالفعل بعلماء الأعصاب ، وهو الوقت الذي كان الناس يضحكون فيه. من المبنى. بحلول الوقت الذي نُشرت فيه الإجراءات ، كان قد مات ، لكن الحركة التي ساعدها على البدء في الازدهار.

شكرًا لك على قراءة زئير الأسد. هل يمكننا أن نطلب مساعدتك؟

في Lion’s Roar ، مهمتنا هي توصيل الحكمة البوذية في عالم اليوم. الاتصالات التي نشاركها معكم - قرائنا - هي التي تدفعنا إلى تحقيق هذه المهمة.

اليوم ، نطلب منك إجراء المزيد من الروابط مع Lion’s Roar. هل يمكنك مساعدتنا بالتبرع اليوم؟

بصفتها منظمة غير ربحية مستقلة ملتزمة بمشاركة الحكمة البوذية بكل تنوعها واتساعها ، يعتمد Lion’s Roar على دعم القراء أمثالك. إذا شعرت بفائدة الممارسة والحكمة البوذية في حياتك الخاصة ، فالرجاء دعم عملنا حتى يستفيد الكثير من الآخرين أيضًا.

من فضلك تبرع اليوم - دعمك يصنع الفارق.

Lion’s Roar هي مؤسسة خيرية مسجلة في الولايات المتحدة وكندا. جميع التبرعات الكندية الأمريكية & # 038 معفاة من الضرائب إلى أقصى حد يسمح به القانون.

حول باري بويس

باري بويس كاتب ومحرر محترف كان محررًا رئيسيًا منذ فترة طويلة في Shambhala Sun. وهو محرر ومساهم في ، ثورة اليقظة: كبار علماء النفس والعلماء والفنانين ومعلمي التأمل حول قوة اليقظة في الحياة اليومية (2011). وهو أيضًا مؤلف مشارك لقواعد النصر: كيفية تحويل الفوضى والصراع - استراتيجيات من فن الحرب (2008).

المنشورات ذات الصلة.


شاهد الفيديو: إیجاد نسبة الحجم بین شكلین متماثلین 1. الریاضیات. اختبار مسابقات الریاضیات الأمریكیة AIME (شهر نوفمبر 2022).